07-354

Przeciwciało przeciwko acetylo-histonie H3 (Lys18)

serum, Upstate^®

• Synonim(y): H3K18Ac, histon H3 (acetyl K18)
• UNSPSC Code: 12352203
• NACRES: NA.41
• eCl@ss: 32160702
• Clone: polyclonal
• Species reactivity: yeast, Saccharomyces cerevisiae, human
• Application: ChIP, DB, WB
• Citations: 90

Właściwości

• biological source: rabbit
• Quality Segment: 100
• antibody form: serum
• antibody product type: primary antibodies
• clone: polyclonal
• species reactivity: yeast, Saccharomyces cerevisiae, human
• species reactivity (predicted by homology): vertebrates (most common)
• manufacturer/tradename: Upstate^®
• technique(s): ChIP: suitable (ChIP-seq), dot blot: suitable, western blot: suitable
• NCBI accession no.: NM_003493
• UniProt accession no.: Q16695
• shipped in: dry ice
• target post-translational modification: acetylation (Lys18)
• Gene Information: human ... H3C1(8350)

Opis

General description

Histon H3 jest jednym z 5 głównych białek histonowych zaangażowanych w strukturę chromatyny w komórkach eukariotycznych. Charakteryzuje się główną domeną kulistą i długim N-końcowym ogonem H3 jest zaangażowany w strukturę nukleosomów o strukturze "koralików na sznurku".



Acetylacja histonu H3 zachodzi w kilku różnych pozycjach lizyny w ogonie histonu i jest wykonywana przez rodzinę enzymów znanych jako acetylotransferazy histonowe (HAT).

17 kDa

Immunogen

Syntetyczny peptyd sprzężony z KLH (GKAPRAcKQLASK-C) odpowiadający aminokwasom 13-23 drożdżowego histonu H3 acetylowanego na lizynie 18 z C-końcową cysteiną dodaną do celów koniugacji.

Application

Immunoprecypitacja chromatyny:
Reprezentatywne dane partii.
Sonikowaną chromatynę przygotowaną z komórek HeLa (1 X 10E6 równoważników komórek na IP) poddano immunoprecypitacji chromatyny przy użyciu 2 µL normalnej surowicy króliczej lub 2 µL anty-acetylo-histonu H3 (Lys18) i zestawu Magna ChIP A (nr kat. 17-610). Pomyślna immunoprecypitacja fragmentów DNA związanych z acetylo-histonem H3 (Lys18) została zweryfikowana za pomocą qPCR przy użyciu starterów kontrolnych specyficznych dla ludzkiego regionu promotora GAPDH jako locus dodatniego i starterów β-globiny jako locus ujemnego. Dane przedstawiono jako procentowy wkład każdej próbki IP w stosunku do chromatyny wejściowej dla każdego amplikonu i próbki ChIP, jak wskazano.
Szczegółowe informacje dotyczące eksperymentu można znaleźć w protokole EZ-Magna ChIP A (nr kat. 17-408) lub EZ-ChIP (nr kat. 17-371).

Sekwencjonowanie ChIP:
Reprezentatywne dane partii. Immunoprecypitację chromatyny przeprowadzono przy użyciu zestawu Magna ChIP HiSens (nr kat. 17-10460), 2 μg przeciwciała anty-acetylo-Histone H3 (Lys18) (nr kat. 07-354), 20 µL kulek Protein A/G i 1e6 usieciowanej chromatyny komórek HeLa, a następnie oczyszczono DNA za pomocą kulek magnetycznych. Biblioteki zostały przygotowane z próbek Input i ChIP DNA przy użyciu standardowych protokołów z adapterami Illumina z kodem kreskowym i analizowane na urządzeniu Illumina HiSeq. Nadmiar dziesięciu milionów odczytów z plików FastQ zmapowano za pomocą Bowtie (http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml) po usunięciu tagów TagDust (http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource/). Piki zidentyfikowano za pomocą MACS (http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/), a piki i odczyty zwizualizowano jako niestandardową ścieżkę w UCSC Genome Browser (http://genome.ucsc.edu) z plików BigWig i BED.

Analiza Western Blot:
Reprezentatywne dane partii.
Rekombinowany histon H3 (lane 1, Catalog # 14-494) i ekstrakty kwasowe z komórek HeLa traktowanych maślanem sodu (lane 2) i nietraktowanych (lane 3) (Catalog # 17-305) sondowano anty-acetylo-histonem H3 (Lys18) (rozcieńczenie 1:10 000).
Strzałka wskazuje acetylo-histon H3 (Lys18) (17 kDa).

Dot Blot:
Reprezentatywne dane partii.
40 ng i 4 ng peptydów histonowych z różnymi modyfikacjami (patrz tabela 1) przeniesiono na membranę PVDF i sondowano przeciwciałem anty-acetylo-histonowym H3 (Lys18) (rozcieńczenie 1:5000). Białka wizualizowano przy użyciu koziej anty-króliczej IgG sprzężonej z HRP i systemu detekcji chemiluminescencji. Pokazano obraz z 60-sekundowej ekspozycji.

Użyj przeciwciała anty-acetylo-histonowego H3 (Lys18) (królicze przeciwciało poliklonalne) zatwierdzonego w ChIP, WB do wykrywania acetylo-histonu H3 (Lys18) znanego również jako H3K18Ac, Histon H3 (acetyl K18).

Biochem/physiol Actions

Rozpoznaje histon H3 acetylowany na lizynie 18.

Physical form

100 μl surowicy króliczej zawierającej 0,05% azydku sodu i 30% glicerolu.

Analysis Note

routinely evaluated by immunoblot on acid extracts from sodium butyrate treated HeLa cells

Other Notes

Stężenie: Stężenie specyficzne dla danej partii można znaleźć w certyfikacie analizy.

Zastępuje: 04-1107

Legal Information

UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.

Informacja o środkach bezpieczeństwa

• Klasa składowania: 12 - Non Combustible Liquids
• wgk: WGK 1
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable