03-310
Odczynnik in vivo SHAPE do analizy struktury RNA w żywych komórkach
liquid
Synonim(y):
Odczynnik SHAPE
Zaloguj się, aby wyświetlić ceny organizacyjne i kontraktowe.
Wybierz wielkość
0.5 ML
1250,00 zł
Informacje o tej pozycji
UNSPSC Code:
12161503
NACRES:
NA.32
eCl@ss:
32161000
Form:
liquid
Storage temp.:
-10 to -25°C
Przejdź do
Pomoc techniczna
Potrzebujesz pomocy? Nasz zespół doświadczonych naukowców chętnie Ci pomoże.
Pozwól nam pomócNazwa produktu
Odczynnik in vivo SHAPE do analizy struktury RNA w żywych komórkach, permits the analysis of RNA structure in living cells
Quality Level
form
liquid
manufacturer/tradename
Upstate®
concentration
2 M
technique(s)
activity assay: suitable (reverse transcriptase)
shipped in
dry ice
storage temp.
-10 to -25°C
1 of 4
Ta pozycja | |||
|---|---|---|---|
| Quality Level 100 | Quality Level - | Quality Level 200 | Quality Level 200, 300 |
| manufacturer/tradename Upstate® | manufacturer/tradename - | manufacturer/tradename - | manufacturer/tradename Novabiochem® |
| form liquid | form liquid | form - | form liquid |
| concentration 2 M | concentration - | concentration - | concentration - |
| shipped in dry ice | shipped in - | shipped in - | shipped in - |
| technique(s) activity assay: suitable (reverse transcriptase) | technique(s) cell culture | stem cell: suitable | technique(s) - | technique(s) - |
General description
Cechy i zalety
Odczynnik In Vivo SHAPE służy do określania struktury RNA. Odczynnik ten zawiera wysoce czystą formę imidazolidu kwasu 2-metylonikotynowego (NAI). Związek ten tworzy 2'-O-addukty na jednoniciowych regionach RNA, które można wykryć za pomocą selektywnej 2'-hydroksylowej acylacji i wydłużania primera (SHAPE).
W przeciwieństwie do innych odczynników stosowanych w metodzie SHAPE, oparty na NAI odczynnik In Vivo SHAPE jest szybko wchłaniany przez komórki i ma niski poziom toksyczności, dzięki czemu idealnie nadaje się do stosowania z żywymi komórkami. W przeciwieństwie do innych odczynników stosowanych do analizy SHAPE, odczynnik In Vivo SHAPE reaguje w sposób bezstronny ze wszystkimi czterema nukleotydami RNA. To połączenie niskiej toksyczności, szybkiego wchłaniania i braku stronniczości nukleotydów umożliwia analizę struktury RNA w wysokiej rozdzielczości w różnych żywych systemach.
- Gotowy do użycia roztwór bez RNazy
- Niska toksyczność umożliwia stosowanie z żywymi komórkami
- Wysoka przepuszczalność komórek dla szybkiej modyfikacji RNA
- Reaguje ze wszystkimi nukleotydami RNA bez uprzedzeń, umożliwiając mapowanie w wysokiej rozdzielczości
Odczynnik In Vivo SHAPE służy do określania struktury RNA. Odczynnik ten zawiera wysoce czystą formę imidazolidu kwasu 2-metylonikotynowego (NAI). Związek ten tworzy 2'-O-addukty na jednoniciowych regionach RNA, które można wykryć za pomocą selektywnej 2'-hydroksylowej acylacji i wydłużania primera (SHAPE).
W przeciwieństwie do innych odczynników stosowanych w metodzie SHAPE, oparty na NAI odczynnik In Vivo SHAPE jest szybko wchłaniany przez komórki i ma niski poziom toksyczności, dzięki czemu idealnie nadaje się do stosowania z żywymi komórkami. W przeciwieństwie do innych odczynników stosowanych do analizy SHAPE, odczynnik In Vivo SHAPE reaguje w sposób bezstronny ze wszystkimi czterema nukleotydami RNA. To połączenie niskiej toksyczności, szybkiego wchłaniania i braku stronniczości nukleotydów umożliwia analizę struktury RNA w wysokiej rozdzielczości w różnych żywych systemach.
Fałdowanie do struktur wyższego rzędu pozwala RNA funkcjonować wewnątrz żywych komórek i tworzyć dynamiczne kompleksy z białkami efektorowymi. Przewidywanie tych struktur 3D jest wyzwaniem, dlatego opracowano szereg technik sondowania w celu zbadania fałdowania RNA.
Związki takie jak imidazolid kwasu 2-metylonikotynowego (NAI) zawarte w odczynniku In Vivo SHAPE powodują powstawanie 2-O-adduktów. Addukty te tworzą się szybko na jednoniciowym niesparowanym RNA i znacznie wolniej na sparowanym (dwuniciowym) RNA. Zmodyfikowany RNA może być następnie analizowany przez wydłużenie primera. Zmodyfikowane nukleotydy nie są wydłużane przez polimerazy DNA zależne od RNA, co pozwala na wykrycie miejsc modyfikacji.
Związki takie jak imidazolid kwasu 2-metylonikotynowego (NAI) zawarte w odczynniku In Vivo SHAPE powodują powstawanie 2-O-adduktów. Addukty te tworzą się szybko na jednoniciowym niesparowanym RNA i znacznie wolniej na sparowanym (dwuniciowym) RNA. Zmodyfikowany RNA może być następnie analizowany przez wydłużenie primera. Zmodyfikowane nukleotydy nie są wydłużane przez polimerazy DNA zależne od RNA, co pozwala na wykrycie miejsc modyfikacji.
Physical form
2M NAI w DMSO
Fiolka 0,5 ml zawierająca 2M NAI (>97% czystości) w roztworze DMSO
Preparation Note
NAI należy przechowywać w temperaturze -20°C w zamrażarce chronionej przed światłem. Przy prawidłowym przechowywaniu (ochrona przed światłem i unikanie nadmiernych cykli zamrażania-rozmrażania) produkt jest stabilny przez okres do 6 miesięcy od daty otrzymania.
Analysis Note
Purity of NAI compound is tested by HPLC.
Other Notes
2-methylnicotinic acid imidazolide (NAI) in DMSO
Legal Information
UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
Disclaimer
O ile nie określono inaczej w naszym katalogu lub innej dokumentacji firmy dołączonej do produktu(-ów), nasze produkty są przeznaczone wyłącznie do użytku badawczego i nie mogą być wykorzystywane do żadnych innych celów, w tym między innymi do nieautoryzowanych zastosowań komercyjnych, zastosowań diagnostycznych in vitro, zastosowań terapeutycznych ex vivo lub in vivo lub jakiegokolwiek rodzaju konsumpcji lub zastosowania u ludzi lub zwierząt.
Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.
Related product
Numer produktu
Opis
Cennik
Klasa składowania
10 - Combustible liquids
wgk
WGK 3
Certyfikaty analizy (CoA)
Poszukaj Certyfikaty analizy (CoA), wpisując numer partii/serii produktów. Numery serii i partii można znaleźć na etykiecie produktu po słowach „seria” lub „partia”.
Masz już ten produkt?
Dokumenty związane z niedawno zakupionymi produktami zostały zamieszczone w Bibliotece dokumentów.
Kevin A Wilkinson et al.
Nature protocols, 1(3), 1610-1616 (2007-04-05)
Selective 2'-hydroxyl acylation analyzed by primer extension (SHAPE) interrogates local backbone flexibility in RNA at single-nucleotide resolution under diverse solution environments. Flexible RNA nucleotides preferentially sample local conformations that enhance the nucleophilic reactivity of 2'-hydroxyl groups toward electrophiles, such as
Robert C Spitale et al.
Nature chemical biology, 9(1), 18-20 (2012-11-28)
RNA structure has important roles in practically every facet of gene regulation, but the paucity of in vivo structural probes limits current understanding. Here we design, synthesize and demonstrate two new chemical probes that enable selective 2'-hydroxyl acylation analyzed by
Numer pozycji handlu globalnego
| SKU | NUMER GTIN |
|---|---|
| 03-310 | 04055977113631 |
Active Filters
Nasz zespół naukowców ma doświadczenie we wszystkich obszarach badań, w tym w naukach przyrodniczych, materiałoznawstwie, syntezie chemicznej, chromatografii, analityce i wielu innych dziedzinach.
Skontaktuj się z zespołem ds. pomocy technicznej