B0300

Betaina

5 M, PCR Reagent

• Sinonimo/i: TMG, trimethylglycine
• Formula condensata: (CH₃)₃N⁺CH₂COO⁻
• Numero CAS: 107-43-7
• Peso molecolare: 117.15
• UNSPSC Code: 12352200
• NACRES: NA.52
• PubChem Substance ID: 24891511
• MDL number: MFCD00012123
• Beilstein/REAXYS Number: 3537113

Proprietà

• Quality Segment: 300
• form: liquid
• packaging: vial of 1.5 mL
• concentration: 5 M
• technique(s): PCR: suitable
• color: colorless
• application(s): agriculture
• foreign activity: DNase, RNase, none detected
• storage temp.: 2-8°C
• SMILES string: C[N+](C)(C)CC([O-])=O
• InChI: 1S/C5H11NO2/c1-6(2,3)4-5(7)8/h4H2,1-3H3
• InChI key: KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N

Descrizione

General description

La betaina, denominata anche trimetilglicina o N,N,N trietilammonio acetato, è un analogo della glicina contenente tre gruppi metilici. Presenta un′elevata compatibilità con la miscela tampone per la reazione a catena della polimerasi (PCR). La betaina è un adiuvante della PCR ampiamente usato per aumentare la resa e la specificità dei prodotti della PCR, in particolare durante l′amplificazione di sequenze bersaglio ad alto contenuto di GC o che formando strutture secondarie sono soggette a una resa insoddisfacente. La betaina facilita la separazione dei filamenti di DNA e permette di gestire la discrepanza tra le temperature di fusione (Tm) delle coppie GC e AT nel DNA. Stabilizza il DNA a doppio filamento bilanciando l′incorporazione delle coppie di basi GC e AT. La betaina si usa comunemente per ottimizzare reazioni di PCR multiplex e PCR “lunga e accurata” (LA-PCR). È stato descritto in letteratura che l′aggiunta di betaina acquosa 1,0-1,7 M a una miscela di PCR riduce la dipendenza della denaturazione del DNA dalla composizione delle coppie di basi.[1]

Application

La soluzione di betaina è stata usata come componente della miscela di reazione per:

• l'amplificazione isotermica mediata da loop (LAMP);
• l'amplificazione del DNA genomico mediante la reazione a catena della polimerasi;[2]
• l′analisi della lunghezza dei telomeri mediante la reazione a catena della polimerasi quantitativa (qPCR);
• l'amplificazione delle ripetizioni CGG nel DNA genomico mediante PCR;[3]
• l'amplificazione isotermica mediata da loop con trascrizione inversa (RT-LAMP) per rilevare il coronavirus 2 responsabile della sindrome respiratoria acuta grave (SARS-CoV-2);[4]
• l'amplificazione mediante PCR della subunità maggiore della RNA polimerasi II (RPB2) diretta da DNA;
• la trascrizione inversa durante la preparazione di librerie mediante Smartseq2[5]

Packaging

1,5 mL per flaconcino

Informazioni sulla sicurezza

• Classe di stoccaggio: 12 - Non Combustible Liquids
• wgk: WGK 1
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable