Elettroforesi su gel degli acidi nucleici
L’elettroforesi su gel degli acidi nucleici è una tecnica di biologia molecolare che consente la separazione, l'identificazione e la purificazione di frammenti di DNA e RNA in base alle dimensioni e alla carica. In questa tecnica, le molecole di DNA e RNA vengono separate applicando un campo elettrico che fa muovere gli acidi nucleici caricati negativamente attraverso una matrice di gel di agarosio o di poliacrilammide.
La matrice del gel funge da setaccio, consentendo alle molecole più corte di muoversi più rapidamente attraverso i pori del gel rispetto alle molecole più lunghe.
- I gel di agarosio sono quelli più comunemente usati per l'elettroforesi di DNA e RNA e possono risolvere frammenti di DNA che vanno da 50 paia di basi (50 bp) a 50.000 bp con tecniche elettroforetiche standard.
- I gel di poliacrilammide hanno un intervallo di separazione più limitato e sono in grado di risolvere frammenti di DNA inferiori a ~ 500 bp con una capacità di risoluzione molto elevata.
- Sia i gel di agarosio che quelli di poliacrilammide possono essere utilizzati anche nel saggio di spostamento della mobilità elettroforetica (EMSA) per lo studio delle interazioni tra acidi nucleici e proteine.
Dopo l'elettroforesi, le molecole di DNA e RNA possono essere visualizzate con l'uso di colorazioni o della luce UV, estratte e purificate dal gel o trasferite con procedure di blotting. Questi metodi costituiscono le comuni tecniche preliminari ad applicazioni successive come clonaggi, PCR, spettrometria di massa, sequenziamento massivo parallelo (NGS), Northern e Southern blotting.
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