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Bromuro di etidio

suitable for fluorescence, ~1% in H₂O

• Sinonimo/i: 3,8-diamino-5-etil-6-fenilfenantridinio bromuro, Bromuro di omidio, EtBr
• Formula empirica (notazione di Hill): C₂₁H₂₀BrN₃
• Numero CAS: 1239-45-8
• Peso molecolare: 394.31
• UNSPSC Code: 12161505
• NACRES: NA.32
• PubChem Substance ID: 57650684
• MDL number: MFCD00011724
• Beilstein/REAXYS Number: 3642536

Proprietà

• Quality Segment: 100
• concentration: ~1% in H₂O
• fluorescence: λ_ex 480 nm; λ_em 620 nm in H₂O, λ_ex 518 nm; λ_em 605 nm (bound to DNA), λ_ex 530 nm; λ_em 600 nm in 50 mM phosphate buffer pH 7.0 (upon binding to DNA)
• suitability: suitable for fluorescence
• storage temp.: 2-8°C
• SMILES string: [Br-].CC[n+]1c(-c2ccccc2)c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc14
• InChI: 1S/C21H19N3.BrH/c1-2-24-20-13-16(23)9-11-18(20)17-10-8-15(22)12-19(17)21(24)14-6-4-3-5-7-14;/h3-13,23H,2,22H2,1H3;1H
• InChI key: ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N

Descrizione

Application

Il bromuro di etidio (EtBr) è il più usato tra i coloranti degli acidi nucleici per la PAGE o l′elettroforesi su gel di agarosio. La fluorescenza di EtBr aumenta di 21 volte quando si lega all′RNA a doppio filamento e di 25 volte quando si lega al DNA a doppio filamento così che con una bassa concentrazione del colorante (10 μg/mL) non è necessario decolorare il fondo. Il bromuro di etidio è stato usato in numerosi saggi fluorimetrici per gli acidi nucleici. È stato dimostrato il legame con il DNA a singolo filamento (anche se non altrettanto forte) e con il DNA a triplo filamento. Per la sua capacità di legarsi al DNA, il bromuro di etidio è un inibitore della DNA polimerasi.

Biochem/physiol Actions

Il bromuro di etidio si frappone al DNA e all′RNA a doppio filamento e agisce come mutageno frameshift. Può essere usato anche insieme ad arancio di acridina per differenziare le cellule vitali, apoptotiche e necrotiche.

Preparation Note

Per colorare un gel dopo l′elettroforesi, diluire un campione della soluzione madre con acqua a 0,5 μg/mL e incubare il gel per 15-30 minuti. La decolorazione, di solito non necessaria, si può eseguire in acqua per 15 minuti, se si deve ridurre il fondo. Si possono quindi rilevare le bande di DNA con l′illuminatore UV (lunghezza d′onda 254 nm). È anche possibile incorporare nel gel il bromuro di etidio, eseguire il tampone a 0,5 μg/mL e visualizzarlo immediatamente dopo l′elettroforesi.

Informazioni sulla sicurezza

• pictograms: GHS06,GHS08
• signalword: Danger
• hcodes: H331,H341
• pcodes: P202 - P261 - P271 - P280 - P304 + P340 + P311 - P308 + P313
• Hazard Classifications: Acute Tox. 3 Inhalation - Muta. 2
• Classe di stoccaggio: 6.1D - Non-combustible acute toxic Cat.3 / toxic hazardous materials or hazardous materials causing chronic effects
• wgk: nwg
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable
• ppe: Eyeshields, Faceshields, Gloves, type ABEK (EN14387) respirator filter