Ugrás a tartalomra
Merck
KezdőlapApplicationsProtein BiologyFehérje szerkezeti analízis

Fehérje szerkezeti analízis

Egy összetett fehérjeszerkezet 3D-s illusztrációja különböző színű, egymásba fonódó szalagokkal, amelyek az aminosavláncok hajtogatását ábrázolják.

A fehérjék működése közvetlenül függ a szerkezetüktől, a más fehérjékkel való kölcsönhatásuktól, valamint a sejtekben, szövetekben és szervekben való elhelyezkedésüktől. A fehérjék szerkezetét és funkcióját nagymértékben tanulmányozzák a proteomikában, amely lehetővé teszi a specifikus betegségállapotokhoz kapcsolódó fehérje biomarkerek azonosítását, és potenciális célpontokat biztosít a terápiás kezeléshez. A fehérjék szerkezetének megértése és a fehérjék elhelyezkedésének, expressziós szintjének és kölcsönhatásainak feltérképezése értékes információkat eredményez, amelyekből következtetni lehet a fehérjék működésére. 

- Fehérje szerkezete
- Proteinszerkezet-meghatározás
- Protein-térképezés


Kapcsolódó műszaki cikkek

Kapcsolódó protokollok

További cikkek és protokollok keresése


A fehérje szerkezete

A fehérje szerkezetét a fehérjét alkotó aminosavak sorrendje határozza meg, valamint az, hogy a fehérje hogyan hajtogatja össze összetettebb alakzatokká.

  • Az elsődleges szerkezetet a fehérje aminosavsorrendje határozza meg.
  • A másodlagos szerkezetet a polipeptidlánc szakaszainak helyi kölcsönhatásai határozzák meg, amelyek hidrogénkötéses kölcsönhatások révén α-hélixeket és β-lemezeket alkothatnak.
  • Tercier szerkezet meghatározza a fehérje teljes háromdimenziós szerkezetét.
  • Kvaterner szerkezet meghatározza, hogy több fehérje alegység hogyan lép kölcsönhatásba egymással, hogy nagyobb komplexeket alkossanak.

Proteinszerkezet-meghatározás

A háromdimenziós fehérjeszerkezetek atomi felbontású meghatározása hasznos a fehérje funkciójának felderítésében, a szerkezetalapú gyógyszertervezésben és a molekuláris dokkolásban.

  • NMR: A nukleáris mágneses rezonancia (NMR) spektroszkópiát a fehérjék szerkezetére és dinamikájára vonatkozó információk megszerzésére használják. Az NMR-ben az atomok térbeli elhelyezkedését kémiai eltolódásuk alapján határozzák meg. A fehérjék NMR vizsgálatához a fehérjéket általában stabil izotópokkal (15N, 13C, 2H) jelölik, hogy növeljék az érzékenységet és megkönnyítsék a szerkezeti dekonvolúciót. Az izotópos jelöléseket jellemzően úgy vezetik be, hogy a fehérjeexpresszió során izotóposan jelölt tápanyagokat juttatnak a növekedési közegbe.
  • Röntgenkrisztallográfia: A fehérjék röntgenkrisztallográfiája a fehérjék háromdimenziós szerkezetének meghatározására használható a kristályosított fehérjék röntgendiffrakciója révén. A kristályok növesztése úgy történik, hogy nagy koncentrációjú fehérjét ültetnek a kicsapódást elősegítő oldatokba, és megfelelő körülmények között rendezett fehérjekristályok alakulnak ki. A röntgensugarakat a fehérjekristályra irányítják, amely a röntgensugarakat egy elektronikus detektorra vagy filmre szórja. A kristályokat elforgatják, hogy a diffrakciót három dimenzióban rögzítsék, ami lehetővé teszi a kristályosodott molekulában lévő egyes atomok helyzetének Fourier-transzformációval történő kiszámítását.

Protein-térképezés

A fehérjék elhelyezkedésének és expressziós szintjének feltérképezése bizonyos sejtekben, szövetekben és szervekben segíti a proteom funkcionális vizsgálatát. A fehérjék térbeli eloszlása kulcsfontosságú a fehérjék működéséhez, a nem megfelelő lokalizáció vagy expresszió különböző betegségeket vált ki. Az olyan feltérképezési projektek, mint a Human Protein Atlas, proteomikai forrást biztosítanak a biomarkerek felfedezéséhez, és segítik a betegségek patológiájának megértését. Az interaktom feltérképezése segít meghatározni a sejtszinten előforduló molekuláris kölcsönhatásokat, segít a fehérjék működésének megértésében, és értékes potenciális gyógyszercélpontokat kínál a betegségek kezelésére.


Kapcsolódó termékforrások

  • Bulletin: ISOGRO Media

    This technical bulletin is from ISOGRO Media, providing information on stable isotope enrichment of proteins for NMR spectroscopy.





A folytatáshoz jelentkezzen be

Az olvasás folytatásához jelentkezzen be vagy hozzon létre egy felhasználói fiókot.

Még nem rendelkezik fiókkal?