Fehérje Pull-Down technikák
A pull-down assay két vagy több fehérje kölcsönhatásának meghatározására szolgál. Az affinitási pull-down próbák során egy ″bait″ fehérjét megjelölnek és rögzítenek egy immobilizált ligandumon (hordozógyöngyök) kovalens kötéssel vagy affinitási címkén keresztül, például immobilizált fémaffinitás-kromatográfiával (IMAC). A gyakori csalifehérje-fúziós címkék közé tartoznak a glutation-S-transzferáz (GST) és a hisztidin-jelölésű fehérjék. A csalifehérje komplexet képez, amelyet aztán egy fehérjeforrással, például sejt- vagy szövetlizátummal inkubálnak. Az érdeklődésre számot tartó fehérjéket a gyöngyös hordozóról több mosáson keresztül eluáljuk, majd centrifugálással összegyűjtjük. Az affinitásos pull-down tisztítási és kimutatási módszer abban különbözik az immunprecipitációs (IP) és a Co-IP vizsgálatoktól, hogy nem antitest-antigén kölcsönhatásról van szó. Minden pull-down vizsgálatnál a megtisztított mintát gyakran SDS-PAGE, tömegspektrális elemzéssel és Western blot detektálással elemzik a további downstream analízishez.
Kapcsolódó műszaki cikkek
- CsCl gradient centrifugation separates RNA from DNA; differential and density gradient centrifugation techniques explained.
- A centrifugálás lehetővé teszi a részecskék üledékképződéssel történő szétválasztását. Ismerje meg, hogyan lehet a részecskéket centrifugával szétválasztani, és hogyan lehet a Stokes-törvényt használni az ülepedési sebesség kiszámításához.
- Sera-Mag and Sera-Mag SpeedBeads provide cost effective magnetic bead separation technology for molecular biology applications, nucleic acid isolation, and research immunoassays.
- Agarose beads Vs. Magnetic beads in Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
- This page describes immunoprecipitation (immunoaffinity or pull-down techniques).
- Mindent látni (12)
Kapcsolódó protokollok
- Techniques for protein antigen molecular weight determination, protein interactions, enzymatic activity, and post-translational modifications.
- Ez a protokoll részletezi az immunprecipitációt immobilizált G-protein felhasználásával szövetekkel vagy sejtekkel. Hibaelhárítási tippeket is tartalmaz.
- Immunoprecipitation Kit (Protein A) Protocol & Troubleshooting
- Sera-Mag SpeedBeads provide fast and convenient protein isolation; suitable for manual or automated magnetic affinity binding in various applications.
- Az antitesttisztítási protokollok olyan készítményeket eredményeznek, amelyek a specifikus antitestek mellett endogén IgG-t is tartalmaznak.
- Mindent látni (17)
További cikkek és protokollok keresése
Affinity GST Pull-Down Applications
A glutation S-transzferáz (GST) egy 211 aminosavból álló fehérje, amely a legtöbb szervezetben megtalálható. A GST-t gyakran integrálják expressziós vektorokba, hogy a E. coli fehérje-expressziós rendszereken belül fúziós taget állítsanak elő. A GST-tag egy nagyméretű, körülbelül 26 kDa fehérje, és kifejezhető baktériumokban, élesztő-, emlős- és rovarsejtekben. A GST-tag előnyös, ha a rekombináns fehérje védelmére van szükség az intracelluláris proteázok hasításával szemben, és ha a jelölt fehérje oldhatóságát növelni kell. Ezenkívül a GST-fehérje nagy affinitású taget biztosít az egyszerű tisztításhoz és az olcsó affinitásgyantákat használó, enyhe elúciós körülmények között végzett pull-down-kísérletekhez.
Co-immunoprecipitáció
A pull-down vizsgálat ideális a co-immunoprecipitációs eredmények ellenőrzésére, és kiváló módszer ismeretlen fehérje-fehérje kölcsönhatások azonosítására, valamint specifikus fehérjék aktivációs állapotának meghatározására. Az affinitási pull-down módszerekkel ellentétben az IP antitesteket használ az antigének komplex biológiai mintákhoz való kötődésére és izolálására.
A ko-IP egy antitest használatára utal, amely egy antigént köt meg egy multiprotein komplexen belül. A komplexet ezután protein A vagy protein G közeg hozzáadásával rögzítjük. A fehérje A/G nagy affinitása a poliklonális és monoklonális IgG típusú antitestek Fc régiójához kritikus komponenssé teszi őket az érdeklődésre számot tartó fehérje vagy fehérjekomplex tisztításában. A fehérje pull-down módszerek alkalmazása alapvető eszköz a fehérje-fehérje kölcsönhatási hálózatok vizsgálatához; a konkrét módszer kiválasztását azonban a kutató konkrét alkalmazási igénye határozza meg.
Az olvasás folytatásához jelentkezzen be vagy hozzon létre egy felhasználói fiókot.
Még nem rendelkezik fiókkal?