Aminosavak referenciatáblázata

Aminosav	Reagensek	Cellakultúra és molekuláris biológia	Analitikai és érzékeny alkalmazások
Alanin (Ala/A)	A7627	A7469	05129
Arginin (Arg/R)	A5006		A8094	11009
Asparagin (Asn/N)	A8381	A4284	A4284	A7094
Aszparaginsav  (Asp/D)		A9256	A7219	A8949	A8949
Cisztein (Cys/C)	<>	C7880	C6852	30129
	C7352
Glutaminsav (Glu/E)	G1251		G8415	49449
Glutamin (Gln/Q)	G3126		G8540	49419
		G7513
Glicin  (Gly/G)	G7126	G8898		50046
Hisztidin (His/H)	H8000	H6034	53319
Hidroxiprolin (Hyp/O)	H54409	H54409	H5534
Izoleucin (Ile/I)	I2752	I7403	58879
Leucin (Leu/L)	L8000/td>	L8912	61819
Lizin (Lys/K)	L5626	L8662	6292929
Methionin (Met/M)		M9625	M5308	64319	64319<>/td>
Fenilalanin (Phe/F)	P2126	P5482
Prolin (Pro/P)	P0380	P5607	81709
Serine (Ser/S)		S4500	S4311	84959	84959<>/td>
Threonin (Thr/T)	T8625	T8441	89179
Triptofán (Trp/W)	T0254	T8941	93659
Tirozin (Tyr/Y)		T8566	93829
		T1145
Valin (Val/V)	V0500	Valin (Val/V)	V0500	V0513		94619

A gyakori aminosavak tulajdonságai

	Név	Molekuláris súly	Molekuláris képlet	Reziduum képlet	Maradéktömeg (-H2O)	pKa1	pKb2	pKx3	pl4
	Alanin (Ala/A)		89.10	C3H7NO2	C3H5NO	71.08	2.34	9.69	-	6.00
Arginin (Arg/R)	174.20	C6H14N4O2	C6H14N4O2	C6H12N4O	156.19	2.17	9.04	12.48	10.76
Asparagin (Asn/N)	132.12	C4H8N2O3	C4H6N2O2	114.11	2.02	8.80	-	5.41
Aszparaginsav (Asp/D)	133.11	C4H7NO4	C4H5NO3	115.09	1.88	9.60	3.65	2.77
Cisztein (Cys/C)	121.16	C3H7NO2S	C3H5NOS	103.15	1.96	10.28	8.18	5.07
Glutaminsav (Glu/E)	147.13	C5H9NO4	C5H7NO3	129.12	2.19	9.67	4.25	3.22
Glutamin (Gln/Q)	146.15	C5H10N2O3	C5H8N2O2	128.13	2.17	9.13	-	5.65
Glicin (Gly/G)	75.07		C2H5NO22	C2H3NO	57.05	2.34	9.60	-	5.97
Hisztidin (His/H)	155.16	C6H9N3O2	C6H7N3O	137.14	1.82	9.17	6.00	7.59
Hidroxiprolin (Hyp/O)		131.13	C5H9NO3	C5H7NO2	113.11	1.82	9.65	-	-
	-	-
Izoleucin (Ile/I)	131.18		C6H13NO2	C6H11NO	113.16	2.36	9.60	-	6.02
Leucin (Leu/L)	131.18	C6H13NO2	C6H11NO	113.16	2.36	9.60	-	5.98
Lizin (Lys/K)	146.19	C6H14N2O22.	C6H12N2O	128.18	2.18	8.95	10.53	9.74
Methionin (Met/M)	149.21	C5H11NO2S	C5H9NOS	131.20	2.28	9.21	-	5.74
Fenilalanin (Phe/F)	165.19	C9H11NO2	C9H9NO	147.18	1.83	9.13	-	5.48
Prolin (Pro/P)	115.13	C5H9NO2	C5H7NO	97.12	1.99	10.60	-	6.30
Pyroglutamát (Glp/U)	139.11	C5H7NO3	C5H5NO2	121.09	-	-	-	-	5.68
Serin (Ser/S)	105.09	C3H7NO3	C3H5NO2	87.08	2.21	9.15	-	5.68
Threonin (Thr/T)	119.12	C4H9NO3	C4H7NO2	101.11	2.09	9.10	-	5.60
Triptofán (Trp/W)	204.23	C11H12N2O22	C11H10N2O	186.22	2.83	9.39	-	5.89
Tirozin (Tyr/Y)	181.19	C9H11NO3	C9H9NO2	163.18	2.20	9.11	10.07	5.66
Valin (Val/V)	117.15	C5H11NO2	C5H9NO	99.13	2.32	9.62	-	5.96

¹ pKa a -COOH csoport disszociációs állandója logaritmusának negatívja.
² pKb a -NH3 csoport disszociációs állandója logaritmusának negatívja.
³ pKx a molekula bármely más csoportjának disszociációs állandója logaritmusának negatívja.
⁴ pl a pH az izoelektromos ponton.
Hivatkozás: D.R. Lide, Handbook of Chemistry and Physics, 72nd Edition, CRC Press, Boca Raton, FL, 1991.

Az aminosavak azok a vegyületek vagy építőelemek, amelyek a peptideket és a fehérjéket alkotják. Minden egyes aminosav egy aminocsoportból és egy karboxilcsoportból épül fel, amelyek egy tetraéderes szénhez kapcsolódnak. Ezt a szenet α-szénnek (alfa-szénnek) nevezzük. 

Az aminosavak az oldalláncok tekintetében különböznek egymástól, amelyeket R-csoportoknak nevezünk. Az egyes aminosavak R-csoportjai szerkezetükben, elektromos töltésükben és polaritásukban különböznek egymástól.

Az alábbi táblázatok és szerkezetek segítségével felfedezheti az aminosavak tulajdonságait, típusait, alkalmazását és elérhetőségét.

Hidrofób - alifás Hidrofób - aromás Hidrofób - aromás/a> semleges - poláris oldalláncok	Acidic Basic	Unique Hidrofóbsági index a gyakori aminosavakhoz

Hidrofób oldalláncú aminosavak - Alifás aminosavak

Alanin, Ala, A

Izoleucin, Ile, I

Leucin, Leu, L

Metionin, Met, M

Valin, Val, V

Hidrofób oldalláncú aminosavak - Aromás

Fenilalanin, Phe, F

Triptofán, Trp, W

Tirozin, Tyr, Y

Aminosavak polárisan semleges oldalláncokkal

Aszparagin, Asn, N

Cisztein, Cys, C

Glutamin, Gln, Q

Serin, Ser, S

Treonin, Thr, T

Aminosavak elektromosan töltött oldalláncokkal - savasak

Aszparaginsav, Asp, D

Glutaminsav, Glu, E

Aminosavak elektromosan töltött oldalláncokkal - Alapvetően

Arginin, Arg, R

Hisztidin, His, H

Lizin, Lys, K

Egyedi aminosavak

Glicin, Gly, Gly, G

Prolin, Pro, P

Hidrofóbiaindex a gyakori aminosavakhoz

A hidrofóbiaindex a relatív hidrofobicitást méri, vagyis azt, hogy egy aminosav mennyire oldódik vízben. Egy fehérjében a hidrofób aminosavak valószínűleg a fehérje belsejében találhatók, míg a hidrofil aminosavak valószínűleg a vizes környezettel érintkeznek.

Az alábbi táblázatban szereplő értékeket úgy normalizáltuk, hogy a leghidrofóbabb maradék 100-as értéket kap a glicinhez képest, amely semlegesnek tekinthető (0 érték). A skálákat extrapoláltuk a glicinnél hidrofilebb maradékokra.

A pH 2A

^ApH 2 értékek: Sereda et al., J. Chrom. 676: 139-153 (1994).
^BpH 7 értékek: Monera et al., J. Protein Sci. 1: 319-329 (1995).

Hivatkozások

1. Hayman M, Smith K, Cameron N, Przyborski S. 2005. Growth of human stem cell-derived neurons on solid three-dimensional polymers. Journal of Biochemical and Biophysical Methods. 62(3):231-240. https://doi.org/10.1016/j.jbbm.2004.12.001

2. Cho IJ, Ahn JY, Kim S, Choi MS, Ha TY. 2008. Resveratrol attenuates the expression of HMG-CoA reductase mRNA in hamsters. Biochemical and Biophysical Research Communications. 367(1):190-194. https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2007.12.140

3. Polleux F, Ghosh A. 2002. The Slice Overlay Assay: A Versatile Tool to Study the Influence of Extracellular Signals on Neuronal Development. Science Signaling. 2002(136):pl9-pl9. https://doi.org/10.1126/stke.2002.136.pl9

4. Rama Rao KV, Reddy PV, Tong X, Norenberg MD. 2010. Brain Edema in Acute Liver Failure. The American Journal of Pathology. 176(3):1400-1408. https://doi.org/10.2353/ajpath.2010.090756

5. Marx M, Günter RH, Hucko W, Radnikow G, Feldmeyer D. 2012. Improved biocytin labeling and neuronal 3D reconstruction. Nat Protoc. 7(2):394-407. https://doi.org/10.1038/nprot.2011.449