Humán fehérje atlasz

A Human Protein Atlas 2003-ban indult azzal a céllal, hogy feltérképezze az összes emberi fehérjét a sejtekben, szövetekben és szervekben, és ezt az információt nyílt hozzáférésű formátumban rendelkezésre bocsássa, hogy elősegítse az emberi biológia és a betegségek megértését. A három részatlaszra - a Szövetatlaszra, a Sejtatlaszra és a Patológiai atlaszra - tagolódó program érzékeny és rendkívül specifikus antitestekre támaszkodik a fehérjeexpresszió pontos becslésének biztosítása érdekében. A Human Protein Atlas által használt összes antitest szigorú validálási folyamaton megy keresztül, amely magában foglalja a Western blot elemzést, immunhisztokémiai festést és immunfluoreszcencia értékelést gondosan kiválasztott mintaanyagokkal szemben. A Prestige Antibodies^®, amelyet a Atlas Antibodies, a Human Protein Atlas adatai támogatják, és a piacon kapható legjobban jellemzett primer antitesteket képviselik.

A humán fehérjeatlasz három al-atlasza

A szövetatlasz

Az emberi szövetek atlasza

Tekintse át a célszövetek kiváló minőségű festését a szigorúan validált antitestek kiválasztásához

A Szövetatlasz tartalmazza a különböző szöveteken belüli emberi gének expressziós profiljára vonatkozó információkat mind fehérje-, mind mRNS-szinten. A fehérjeexpressziós adatok 76 különböző sejttípus immunhisztokémiai elemzésén alapulnak, amelyek 44 normál emberi szövettípusnak felelnek meg, míg az mRNS-expressziós adatok 37 normál szövettípusból származó RNS mélyszekvenálásából (RNA-seq) származnak. Ezek az információk könnyen feltárhatók egy adott gén keresésével. Például a PAX8 fehérje olyan szövetekben fejeződik ki, amelyek közé tartozik a pajzsmirigy és a vese, és ugyanezekben a szövetekben mRNS-szinten feldúsult expresszió figyelhető meg.

A szövetatlaszban egy adott gén keresése mellett lehetőség van egy adott emberi szövet keresésére is. Ez értékes információkkal szolgálhat, például arról, hogy mely gének mutatnak emelkedett fehérjeexpressziót az adott szövetben, és hogy ez az expresszió egy adott régióra korlátozódik-e. Például 130 gén mutat emelkedett expressziót az emlőszövetben más szövetekhez képest, és e gének mélyreható elemzése antitest-alapú profilalkotás segítségével azt mutatja, hogy a kódolt fehérjék közül több magasan expresszálódik a szoptató emlő emlőmirigyekben. 

A Sejtatlasz

Festési lehetőségek felfedezése sejtszinten, hogy azonosítani tudja a sejtszintű célpontjához releváns antitesteket./b>

A Cell Atlas információt nyújt a fehérjék térbeli eloszlásáról egy 64 sejtvonalból álló panelen belül, amelyet úgy választottak ki, hogy az emberi test különböző szerveinek különböző sejtpopulációit reprezentálja. A fehérjeexpressziós adatok immunfluoreszcens mikroszkópiával, míg az mRNS-expressziós adatok az RNS mélyszekvenálásából származnak. E sejtvonalak egy részhalmazát mélyebb vizsgálatnak vetjük alá, amelyen belül a szubcelluláris fehérjeeloszlást 33 különböző organellumba és finom sejtstruktúrába soroljuk. Ezt az információt egy adott gén keresésével lehet feltárni. Az immuncitokémiai elemzés például azt mutatja, hogy a PAX8 fehérje a nukleoplazmában lokalizálódik, míg az mRNS-expressziós adatok, amelyek teljes körű elemzése a sejtvonalak fenotípusos hasonlóságuk szerinti szervenként történő válogatását követően történik, olyan szövetekben mutatnak feldúsult expressziót, mint a vese és az emlő.

A Cell Atlasban egy adott gén keresése mellett lehetőség van a különböző sejtvonalak és sejtorganellumok részletesebb vizsgálatára is. A Human Protein Atlas ezeket az információkat különböző adatkészletekbe gyűjtötte össze, többek között a következőkben:

• Cellvonal transzkriptom - 64 különböző sejtvonal transzkriptomjának elemzése feltárja azokat a géneket, amelyek bizonyos sejtvonalakban fokozottan expresszálódnak, valamint azokat a géneket, amelyek a sejtvonalakban expresszálódnak, de a megfelelő normál szövetben nem
• Organellaproteom - átfogó információ a fehérjék szubcelluláris lokalizációjáról
• Multilokalizáló proteom - azon fehérjék azonosítása, amelyek egynél több organellában helyezkednek el
• Cellciklusfüggő proteom - az elemzés feltárja azokat a fehérjéket, amelyek expressziós mintázata sejtről sejtre változik, még akkor is, ha ezek a sejtek genetikailag azonosak és ugyanabból a klónpopulációból származnak

A patológiai atlasz

Megtudja, hogyan különbözik a fehérjeexpresszió a normál és a rákos szövetek között

A patológiai atlasz tartalmazza a fehérjeexpressziós és mRNS-adatokat az emberi rák leggyakoribb formáira vonatkozóan. A Human Protein Atlas mintegy 8000 megfelelő rákos beteg esetében korrelálta a rákos szövetekben található emberi gének mRNS-expressziós szintjét a klinikai kimenetelével, és számos ilyen gén esetében elvégezték az ezzel egyenértékű fehérjék immunhisztokémiai elemzését. A patológiai atlasz lehetővé teszi a kutatók számára, hogy tanulmányozzák az egyes ráktípusok egyedi daganatainak fehérjeexpressziós szintjeit. Például a PAX8 festődése emelkedett a pajzsmirigy-, petefészek- és endometriális rákszövetekben.

 Prestige Antibodies^®, powered by Atlas Antibodies

Az Prestige Antibodies^®, powered by Atlas Antibodies, a Human Protein Atlas adatai támogatják, és a piacon kapható legjobban jellemzett primer antitesteket képviselik. Mivel portfóliónkban több mint 40 000 Prestige Antitest^® található, nagy valószínűséggel rendelkezünk a sikeres immunfestés biztosításához szükséges termékkel.

Immunohisztokémiai, immuncitokémiai és Western blot validálási adatok az egyes termékoldalainkon találhatók, valamint linkek a Human Protein Atlas weboldal vonatkozó részéhez.

.