Przejdź do zawartości
Merck

Transcriptomic profiling explains racial disparities in pterygium patients treated with doxycycline.

Investigative ophthalmology & visual science (2014-11-02)
Ignacio M Larrayoz, Óscar Rúa, Sara Velilla, Alfredo Martínez
ABSTRAKT

To understand the differential responses to doxycycline between Caucasian and Hispanic patients observed in a previous clinical trial. Primary cultures were established using pterygia excised from male Caucasian (n = 3) and Hispanic (n = 6) patients. The response of these cells to doxycycline was tested in a toxicity assay. In addition, a complete transcriptome was obtained from the nine samples, and the results were analyzed using false discovery rate statistics. Results were confirmed by quantitative RT (qRT)-PCR and Western blotting for a limited set of genes. Caucasian pterygium cells underwent apoptosis upon exposure to doxycycline, whereas Hispanic cells survived the treatment. Transcriptomic analysis showed profound differences between cells of both ethnicities, even before treatment, implicating important cellular pathways such as the mitochondrial oxidative phosphorylation chain, the proteasome, and the components of the extracellular matrix. Following exposure to doxycycline, there was a significant increase in proapoptotic proteins, regulators of the cell cycle, and components of the mitochondrial membrane in Caucasian cells but not in their Hispanic counterparts. There was a good correlation between data obtained by ultrasequencing and those generated by qRT-PCR or Western blotting. The lack of response to doxycycline observed in Hispanic pterygium patients in a previous clinical trial can be explained by the genetic protection afforded to the cells in this ethnic background against apoptosis and cell death. New therapeutic options must be devised for these patients.

MATERIAŁY
Numer produktu
Marka
Opis produktu

Supelco
Sodium dodecyl sulfate, dust-free pellets, suitable for electrophoresis, for molecular biology, ≥99.0% (GC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
L-Thyroxine sodium salt pentahydrate, γ-irradiated, powder, BioXtra, suitable for cell culture
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, BioXtra, ≥99.0% (GC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, 92.5-100.5% based on total alkyl sulfate content basis
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
L-Thyroxine sodium salt pentahydrate, ≥98% (HPLC), powder
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, BioReagent, suitable for electrophoresis, for molecular biology, ≥98.5% (GC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Thiazolyl Blue Tetrazolium Bromide, 98%
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, ≥98.0% (GC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, ≥90% ((Assay))
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, tested according to NF, mixture of sodium alkyl sulfates consisting mainly of sodium dodecyl sulfate
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, ReagentPlus®, ≥98.5% (GC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Bicinchoninic acid disodium salt hydrate, ≥98% (HPLC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Thiazolyl Blue Tetrazolium Bromide, powder, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, ≥97.5% (HPLC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, BioUltra, for molecular biology, ≥99.0% (GC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Supelco
Sodium dodecyl sulfate, suitable for ion pair chromatography, LiChropur, ≥99.0%
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, ACS reagent, ≥99.0%
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, ≥99.0% (GC), dust-free pellets
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate, BioReagent, suitable for electrophoresis, for molecular biology, ≥98.5% (GC), free-flowing, Redi-Dri
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Dimethyl sulfoxide, European Pharmacopoeia (EP) Reference Standard
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate solution, BioUltra, for molecular biology, 10% in H2O
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
L-Glutamine, BioUltra, ≥99.5% (NT)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Dimethyl sulfoxide, BioUltra, for molecular biology, ≥99.5% (GC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Sodium dodecyl sulfate solution, BioUltra, for molecular biology, 20% in H2O
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Dimethyl sulfoxide, ≥99.5% (GC), suitable for plant cell culture
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Dimethyl sulfoxide, PCR Reagent
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Dimethyl sulfoxide, Hybri-Max, sterile-filtered, BioReagent, suitable for hybridoma, ≥99.7%
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
L-Glutamine, ReagentPlus®, ≥99% (HPLC)
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
L-Glutamine, meets USP testing specifications, suitable for cell culture, 99.0-101.0%, from non-animal source
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
Sigma-Aldrich
Dimethyl sulfoxide, sterile-filtered, BioPerformance Certified, meets EP, USP testing specifications, suitable for hybridoma
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość
SAFC
L-Glutamine
Kod SKU
Gabaryty przesyłki
Dostępność
Cena netto
Ilość