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Both high-fidelity replicative and low-fidelity Y-family polymerases are involved in DNA rereplication.

Molecular and cellular biology (2014-12-10)
Takayuki Sekimoto, Tsukasa Oda, Kiminori Kurashima, Fumio Hanaoka, Takayuki Yamashita
RÉSUMÉ

DNA rereplication is a major form of aberrant replication that causes genomic instabilities, such as gene amplification. However, little is known about which DNA polymerases are involved in the process. Here, we report that low-fidelity Y-family polymerases (Y-Pols), Pol η, Pol ι, Pol κ, and REV1, significantly contribute to DNA synthesis during rereplication, while the replicative polymerases, Pol δ and Pol ε, play an important role in rereplication, as expected. When rereplication was induced by depletion of geminin, these polymerases were recruited to rereplication sites in human cell lines. This finding was supported by RNA interference (RNAi)-mediated knockdown of the polymerases, which suppressed rereplication induced by geminin depletion. Interestingly, epistatic analysis indicated that Y-Pols collaborate in a common pathway, independently of replicative polymerases. We also provide evidence for a catalytic role for Pol η and the involvement of Pol η and Pol κ in cyclin E-induced rereplication. Collectively, our findings indicate that, unlike normal S-phase replication, rereplication induced by geminin depletion and oncogene activation requires significant contributions of both Y-Pols and replicative polymerases. These findings offer important mechanistic insights into cancer genomic instability.

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Sigma-Aldrich
Saccharose, for molecular biology, ≥99.5% (GC)
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Sigma-Aldrich
Saccharose, ≥99.5% (GC)
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Sigma-Aldrich
DAPI, for nucleic acid staining
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Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium, for molecular biology, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration)
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Sigma-Aldrich
Chlorure de magnésium solution, for molecular biology, 1.00 M±0.01 M
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Sigma-Aldrich
Chlorure de magnésium, anhydrous, ≥98%
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Sigma-Aldrich
Saccharose, ≥99.5% (GC), BioXtra
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Sigma-Aldrich
Saccharose, BioUltra, for molecular biology, ≥99.5% (HPLC)
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Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium solution, 0.9% in water, BioXtra, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Iodure de propidium, ≥94.0% (HPLC)
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Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99%
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Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium solution, 5 M in H2O, BioReagent, for molecular biology, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Acide éthylène glycol-bis(2-aminoéthyléther)-N,N,N′,N′-tétraacétique, for molecular biology, ≥97.0%
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USP
Saccharose, United States Pharmacopeia (USP) Reference Standard
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SAFC
Chlorure de sodium solution, 5 M
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Sigma-Aldrich
PIPES, ≥99% (titration)
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Sigma-Aldrich
Saccharose, ≥99.5% (GC), BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture
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Sigma-Aldrich
Saccharose, ≥99.5% (GC)
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Sigma-Aldrich
Hydroxyurée, 98%, powder
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Sigma-Aldrich
Chlorure de magnésium, powder, <200 μm
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Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium solution, BioUltra, for molecular biology, ~5 M in H2O
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Sigma-Aldrich
Saccharose, ≥99.5% (GC), Grade II, suitable for plant cell culture
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Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium, 99.999% trace metals basis
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Sigma-Aldrich
Chlorure de sodium, BioUltra, for molecular biology, ≥99.5% (AT)
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Sigma-Aldrich
PIPES, BioPerformance Certified, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Chlorure de magnésium solution, BioUltra, for molecular biology, 2 M in H2O
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Sigma-Aldrich
Chlorure de magnésium, BioReagent, suitable for insect cell culture, ≥97.0%
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Sigma-Aldrich
Anticorps anti-étiquette Myc, clone 4A6, clone 4A6, Upstate®, from mouse
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Sigma-Aldrich
Saccharose, Grade I, ≥99% (GC), suitable for plant cell culture
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Sigma-Aldrich
PIPES, BioXtra, for molecular biology, ≥99.5% (T)
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