Přehled kináz rodiny Src
Od chvíle, kdy byl v-Src izolován jako transformační složka viru Rousova sarkomu, a od následné identifikace jeho buněčného homologu c-Src, je o jeho aktivitu a regulaci intenzivní zájem. Src je zakládajícím členem skupiny nereceptorových proteinových tyrozinkináz označovaných jako kinázy rodiny Src (SFK). Všichni členové sdílejí základní mutidoménovou strukturu a vysoký stupeň homologie. SFK lze dále rozdělit na základní skupinu "typických" SFK, kterou u člověka tvoří osm členů (Src, Blk, Fgr, Fyn, Hck, Lck, Lyn a Yes), malou skupinu atypických členů (Brk, Frk a Srm) a dvě blízce příbuzné kinázy (Csk a Matk), které regulují typické SFK.
Typické SFK jsou definovány přítomností pěti domén: Jedinečná oblast proměnlivé délky, která obsahuje na svém krajním amino konci motivy určující modifikaci krátkými mastnými kyselinami palmitátem a/nebo myristátem; doména SH3, která zprostředkovává vazbu na specifické motivy PXXP; doména SH2, která řídí vazbu na specifické fosfotyrosinové zbytky; katalytická doména obsahující tyrosin v aktivační smyčce, jehož fosforylace moduluje katalytickou aktivitu; a krátký karboxykoncový ocas s tyrosinovým zbytkem, jehož fosforylace negativně reguluje enzym. Všichni atypičtí členové mají podobnou strukturu jádra, ačkoli žádný z nich nemá motiv potřebný pro myristaci, a zatímco Frk a Brk mají regulační tyrozin v C-ocasu, Srm nikoli. Kromě toho mají všechny atypické členy v doméně SH2 sekvenci pro jadernou lokalizaci. Regulátory Csk a Matk postrádají myristační motivy, tyroziny v aktivační smyčce a C-koncové regulační ocásky.
Aktivita typických SFK je přesně regulována strukturními omezeními. Obvykle se udržují v "uzavřené" neaktivní formě a na podnět přecházejí do "otevřené" aktivní konformace. Například Src v neaktivní formě je fosforylován v C-koncovém ocásku (tyrozin 530), což je reakce, kterou obvykle provádí Csk. Tato fosforylace podporuje interakci mezi ocasem a doménou SH2, která spolu s druhou intramolekulární interakcí mezi doménou SH3 a sekvencemi spojujícími doménu SH2 a kinázovou doménu podporuje uzavřenou konformaci. Domény SH2 a SH3 jsou maskovány a konformace kinázové domény je pro katalýzu nepříznivá. K přechodu do aktivního stavu může dojít buď defosforylací ocasního tyrozinu, nebo vazbou vysoce afinitních ligandů na domény SH2 a/nebo SH3.
SFK se často aktivují, když se extracelulární ligandy spojí s jejich kognátními receptory (jako jsou receptorové tyrozinkinázy, receptory spřažené s G-proteiny, integrinové receptory a receptory rozpoznávající imunitní systém), a také vnitřně během mitózy. SFK se podílejí na mitogenezi, přežívání buněk, reorganizaci cytoskeletu a motilitě, jakož i na specializovaných funkcích, jako je vývoj imunitních buněk, signalizace neuronálních buněk, funkce osteoklastů a krevních destiček atd. Kromě toho se deregulace a/nebo nadměrná exprese typických i atypických SFK podílí na vzniku rakoviny. V souladu s účastí SFK v mnoha signálních drahách je identifikován velký a stále rostoucí počet substrátů SFK (v současné době jen pro Src více než 50).
Bylo identifikováno několik nízkomolekulárních inhibitorů SFK, z nichž dva (PP2 a SU6656) jsou běžně dostupné. PP2 vykazuje značnou selektivitu pro SFK a může inhibovat Lck a Fyn v nanomolárním rozmezí; je však stejně účinným inhibitorem receptoru PDGF a dalších RTK i Tec kináz. SU6656 inhibuje SFKs ve vysokém nanomolárním rozsahu a neinhibuje receptor PDGF ani Tec, ale je velmi nepravděpodobné, že by byl zcela selektivní pro SFKs. Pokud je to možné, výsledky získané s SFK by měly být potvrzeny druhým inhibitorem nebo pomocí jiných prostředků.
Níže uvedená tabulka obsahuje přijaté modulátory a další informace. Seznam dalších produktů naleznete v "Podobné produkty" části níže.
Členové rodiny | Příbuzní | Blk | Fgr | Fyn | Hck | |
<Hck | ||||||
Hck | ||||||
c-Src pp60c-Src | Src2 p55c-fgr | p59Fyn Slk/Syn | Př.JTK9 | |||
Skupina | ||||||
Molekulová hmotnost (kDa) | 59.8 | 57,7 | 59,4 | 60,7 | 57.3 | |
Strukturní údaje | 536 | 505 | 529 | 529/td> | 537 | 526 |
Isoformy | nSrc | Není známo | Není známo | Fyna, Fynb, Fync | p59Hck, p61Hck | |
Druhy | Pták (v-Src), člověk, opice, myš, Xenopus, potkan, chordit | Člověk, myš, potkan | Člověk, myš, potkan | Člověk, myš, potkan, Xenopus | člověk, myš, potkan, Xenopus | Člověk, opice, myš, potkan |
Oblast Organizace | SH3-SH2-Tyr kináza | SH3-SH2-Tyr kináza | SH3-SH2-Tyr kináza | SH3-SH2-Tyr kináza | SH3-SH2-Tyr kináza | |
Fosforylační místa | Ser12 Ser17 Tyr216. Tyr419 Tyr530 | Překlad: J. Š.Tyr389 Tyr501 | Tyr.523 Tyr412 | Tyr531 Tyr420 | Tyr522 Tyr390 | |
Tyr390 | ||||||
Všudypřítomný | B-buňky | Myeloidní buňky B-buňky | Všudypřítomné | Myeloidní buňky | ||
Subcelulární uspořádání | Cytoplazma, plazmatická membrána/td> | Cytoplazma | Cytoplazma | Cytoplazma, plazmatická membrána | Cytoplazma, plazmatická membrána | |
Vazboví partneři/ přidružené proteiny/b> | ADAM12 Csk EGFR FKHR Sam68 Paxillin WASp 14-3-3 β/γ/ε PKCε/ζ | Bcl2 CBL PLCγ2 Ubikvitinová proteinová ligáza E3A | CCR3 CD24 SLAM SHIP WASp | PI3K (p85α) Fyn-vázající protein SLAM SAP Paxillin | WIP Abl p130Cas | |
Podstatné je, že se jedná o nejvýznamnější proteinovou skupinu, která se vyskytuje v oblasti, kde se vyskytuje.Upstream aktivátory | ErbB1; AP-1 PDGFR IR AMPK Neu Fibronektin FGR VDR Dráha PI3K/Akt/eNOS LPS LPS IFNγ | AML1 BSAP/PAX5 NERF/ELF-2 NFkB BSAP EBF Komplex antigenních receptorů | Negativní regulace PP1a Chemokinová signalizace Adheze PMN Urokináza | CD95L NSAIDs RAFTK FAK Vav PDGFR | Actin | |
Downstream Aktivace | EGFR Shc Dynamin Clathrin Raf-1 JAK1 STAT1/3/5 Tks5 G proteinová receptorová kináza 2 Caveolin-1 | Není známo | PI3K p120/130 Cbl Pyk2 p190RhoGAP Rac | PI3K p120/130 Cbl Pyk2 | Ca2+ MAPK | |
Růstové faktory | Není známo | Není známo | Není známo | Není známo | ||
Inhibitory | PP1 PP2 SU6656 | Není známo | Není známo | PP1 PP2 SU6656 | PP1 PP2 | |
Fyziologická funkce | Buněčná proliferace a diferenciace, remodelace kostí | Přenos signálu lymfoidními buňkami | Buněčná migrace a adheze | Synaptická plasticita, podílí se na učení a paměti, buněčný růst | Může přispívat k migraci meutrofilů a může regulovat proces degranulace neutrofilů | |
Význam pro onemocnění | Embryonální vývoj, četné druhy rakoviny, osteoporóza | Některé leukemie | B-buněčná akutní lymfoblastická leukemie | Neurologické onemocnění - porucha speciálního učení | Podrobnosti, které se vyskytují u pacientů s neurologickým onemocněním.B-buněčná akutní lymfoblastická leukémie |
Network error: Failed to fetch
Odkazy
Abyste mohli pokračovat ve čtení, přihlaste se nebo vytvořte účet.
Nemáte účet?Toto je strojově přeložená stránka.