Metabolické dráhy

Vzpomínka na Dr. Donalda Nicholsona, 1916-2012

Dr. Donald Nicholson získal bakalářský titul v roce 1936 a doktorát v roce 1940, oba v oboru chemie na Londýnské univerzitě. Poté začal pracovat ve společnosti Boots Pure Drug Company v Nottinghamu na vývoji a výrobě prvních sulfonamidových antibakteriálních léčiv. V roce 1946 nastoupil na katedru bakteriologie na Lékařské fakultě v Leedsu jako I.C.I Fellow in Chemotherapy a zůstal zde jako lektor nebo starší lektor mikrobiologie až do "odchodu do důchodu" v roce 1981. Ještě ve svých 90 letech se Dr. Nicholson aktivně podílel na tvorbě menších a podrobnějších "minimap" a zejména "animap". Za svou práci obdržel čestný doktorát a byl jmenován jedním z jediných dvou čestných doživotních členů IUBMB.

Přečtěte si více o Dr. Nicholsonovi a o tom, jak vytvořil grafy metabolických drah.

22. ročník IUBMB-Nicholsonova grafu metabolických drah

Údaje o publikaci Designed by Donald Nicholson Připravila a vydala společnost Sigma-Aldrich Co. LLC, St.Louis, MO ©2002 Mezinárodní unie pro biochemii a molekulární biologii

Metabolická mapa obsahuje více než 500 hypertextových odkazů na naše seznamy produktů. Pro přístup k informacím o produktu stačí kliknout na název metabolitu nebo na E.C. číslo enzymu.

Dvaadvacáté (2003) vydání IUBMB-Nicholsonovy mapy metabolických drah obsahuje aktualizované dráhy zabývající se metabolismem ATP v mitochondriích a chloroplastech. "Páteří" mapy je glykolytická dráha následovaná dráhou metabolismu, která se nachází v místech, kde se vyskytuje.TCA (Krebsův) cyklus a dýchací řetězec které společně vedou k syntéze ATP pomocí ATP syntázy. ATP je zdrojem většiny energie potřebné pro veškerý život. S touto páteří je spojeno mnoho biosyntetických a odbourávacích drah metabolismu, jako jsou sacharidy, aminokyseliny, lipidy, které jsou odlišeny pomocí barvy. Lidský metabolismus je rozlišován tam, kde je to možné, pomocí černých šipek. Některých 550 reakcí je označeno čísly Enzymové komise IUBMB (EC), která jsou následně indexována.

Zobrazit graf (3,05 Mb PDF) - při prohlížení grafu použijte nástroj pro zvětšení v aplikaci Adobe Reader.

Dvaadvacáté vydání komplexního grafu metabolických drah. Obsahuje glykolýzu, metabolismus sacharidů, aminokyselin, lipidů, nukleotidů, steroidů, vitaminů a mnoho dalšího.

Objednejte si výtisk ještě dnes!

Minimapy (PDF) a související zdroje

Dvaadvacáté vydání je nyní doplněno on-line o .Minimapy které berou vybrané jednotlivé dráhy a zvětšují je tak, aby ilustrovaly aspekty metabolismu, které dříve nebylo možné zobrazit - například kompartmentalizaci a regulaci.

Kompletní seznam komisních čísel enzymů v tabulce metabolických drah
Tato tabulka obsahuje křížové odkazy na názvy všech enzymů s odpovídajícími čísly E.C.# na grafech metabolických drah.

Minimální mapy IUBMB-Nicholson
Vybrané jednotlivé dráhy byly zvětšeny, aby ilustrovaly aspekty metabolismu, které dříve nebylo možné zobrazit, jako je kompartmentace, enzymy a regulace.

Animované metabolické dráhy

Jedinečnou a vzrušující novinkou je zavedení animovaných metabolických drah - "animaps" do řady IUBMB-Nicholson pathways. Biochemie se tak stává přehlednější biochemií a metabolismus se stává "smysluplnějším, úžasnějším a zábavnějším!" Tyto animace nemají zvuk.

Animace transportu elektronů
Animované znázornění toho, jak v mitochondriích vzniká protonmotivní síla, která pohání ATP syntázu.

Atp-synthase Animation
Animované znázornění mechanismu, který mnozí považují za nejdůležitější molekulu pro živé systémy.

Animace glykolytické dráhy
Animované znázornění reakcí, při kterých se glukóza mění na pyruvát.

Animace cyklu kyseliny citronové
Toto video zobrazuje fáze cyklu kyseliny citronové a sleduje produkty a reaktanty, jak postupují jednotlivé mezikroky a dokončují reakci (a chemickou rovnici).  

Animace komplexu pyruvátdehydrogenázy
Animované znázornění toho, jak se pyruvát z cytosolu propojuje s acetyl-CoA a TCA cyklem v mitochondriální matrici. Tato animace vyžaduje Adobe Flash player.