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A9539

Sigma-Aldrich

Agarosio

Agarose
1 of 2 reviewers received a sample product or took part in a promotion

BioReagent, for molecular biology, low EEO

Sinonimo/i:

3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan, Agarose LE

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About This Item

Numero CAS:
Numero CE:
Numero MDL:
Codice UNSPSC:
41105317
ID PubChem:
NACRES:
NA.25

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Origine biologica

algae (marine)

Livello qualitativo

Grado

for molecular biology

Nome Commerciale

BioReagent

Stato

powder

tecniche

electrophoresis: suitable

Impurezze

≤10% moisture content

EEO

0.09-0.13

Temp. transizione

gel point 36 °C ±1.5 °C (1.5% gel)

Resistenza del gel

≥1200 g/cm2 (1% gel)

Anioni in tracce

sulfate (SO42-): ≤0.15%

Compatibilità

suitable for electrophoresis
suitable for molecular biology

Attività estranea

DNase, RNase, none detected

Stringa SMILE

O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O

InChI

1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

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Descrizione generale

L′agarosio è un polisaccaride naturale che viene estratto dalle alghe marine dei generi Gelidium e Gracilaria. Si tratta di un polimero lineare la cui struttura consiste di unità D-galattosio e 3,6-anidro-L-galattosio che si alternano.[1]

Applicazioni

L′agarosio è stato impiegato:

  • in gel elettroforesi, per l′analisi dell′integrità del DNA[2]
  • per preparare gel idrocolloidi e studiare l′influenza strutturale dei gel sul rilascio di carboidrati[3]
  • in gel elettroforesi, per l′analisi dell′integrità dell′RNA[4]
  • indicato per applicazioni in materia di proteine come l′immunodiffusione Ouchterlony e quella radiale (RID)

Azioni biochim/fisiol

L′agarosio viene impiegato come agente gelificante e trova applicazione diffusa nella ricerca in biologia molecolare per la separazione e l′analisi degli acidi nucleici mediante elettroforesi o blotting (northern e southern). Nel corso del processo di gelatinizzazione, i polimeri di agarosio si aggregano tra loro in maniera non covalente dando luogo a un reticolato di fasci fibrosi con pori le cui dimensioni definiscono le proprietà di setaccio molecolare del gel. La tipologia e la concentrazione dell′agarosio influenzano la velocità di migrazione delle molecole di DNA attraverso il gel.[1] Inoltre, l′agarosio è in possesso di peculiari proprietà che hanno acceso in maniera significativa l′interesse per l′impiego di questa sostanza in applicazioni biologiche. Per esempio, è considerato un eccellente biomateriale per applicazioni nell′ambito dell′ingegneria dei tessuti in quanto in grado di replicare abbastanza fedelmente la matrice extracellulare. Grazie alla sua notevole capacità di assorbire acqua, risulta inoltre indicato per l′incapsulazione di cellule. L′agarosio consente di regolare la permeazione di ossigeno e nutrienti ed è utile per la crescita, il differenziamento e la proliferazione delle cellule. L′agarosio viene usato nella veicolazione di farmaci controllata/localizzata e in medicina rigenerativa, in processi come la neurogenesi, l′angiogenesi, la spermatogenesi, la formazione di cartilagine, la rigenerazione ossea, la cicatrizzazione delle ferite e lo sviluppo di un pancreas artificiale.[5]

Caratteristiche e vantaggi

  • Biocompatibile
  • I gel di agarosio dispongono di pori le cui dimensioni sono superiori a quelli dei gel di poliacrilammide a basse concentrazioni
  • A differenza della poliacrilammide, i gel di agarosio hanno consistenza più solida (ma meno elastica)
  • Possiede un basso livello di colorazione di fondo da bromuro di etidio o SYBR Green.

Risultati analitici

Segue l′elenco delle caratteristiche specificate per il nostro agarosio:
contenuto in solfati - usato come indicatore di purezza, poiché il solfato è il principale gruppo ionico presente.
forza del gel -la forza che deve essere applicata a un gel per provocarne la rottura.
punto di gel - la temperatura alla quale una soluzione acquosa di agarosio gelifica al raffreddamento La transizione dallo stato liquido a gel delle soluzioni di agarosio è soggetto a isteresi, ovvero il punto di gel non coincide con la temperatura di fusione.
Elettroendosmosi (EEO) - indica un movimento di liquido attraverso il gel. I gruppi anionici in un gel di agarosio sono fissati alla matrice e non possono muoversi, mentre i controcationi dissociabili possono migrare verso il catodo nella matrice, dando origine a EEO. Poiché il movimento elettroforetico dei biopolimeri è solitamente diretto verso l'anodo, l'EEO può disturbarne la migrazione a causa della convezione interna.

Prodotto comparabile

N° Catalogo
Descrizione
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Codice della classe di stoccaggio

11 - Combustible Solids

Classe di pericolosità dell'acqua (WGK)

WGK 1

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Not applicable

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Sharma U, et al.
Physiology and Molecular Biology of Plants : An International Journal of Functional Plant Biology, 25, 581-588 (2019)

Protocolli

The GenElute™ Blood Genomic DNA Kit Protocol provides a simple and convenient way to isolate pure genomic DNA from fresh or aged whole blood.

The GenElute Mammalian Genomic DNA Purification Kit Protocol describes the isolation of pure, high molecular weight DNA from a variety of mammalian sources.

GenElute™ Bacterial Genomic DNA Kit protocol describes a simple and convenient way for the isolation of pure genomic DNA from bacteria.

Questions

1–4 of 4 Questions  
  1. I would like to know the molecular weight of this agarose.

    1 answer
    1. Agarose is a polysaccharide made up of alternating ?-D-galactose and 3,6-anhydro-L-galactose units of agarobiose in its chemical structure. The molecular weight is variable and has not been determined. Please see the link below for additional information, including an agarose selection guide:
      https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/product/documents/181/864/a9539pis.pdf

      Helpful?

  2. How can I determine the shelf life / expiration / retest date of this product?

    1 answer
    1. If this product has an expiration or retest date, it will be shown on the Certificate of Analysis (COA, CofA). If there is no retest or expiration date listed on the product's COA, we do not have suitable stability data to determine a shelf life. For these products, the only date on the COA will be the release date; a retest, expiration, or use-by-date will not be displayed.
      For all products, we recommend handling per defined conditions as printed in our product literature and website product descriptions. We recommend that products should be routinely inspected by customers to ensure they perform as expected.
      For products without retest or expiration dates, our standard warranty of 1 year from the date of shipment is applicable.
      For more information, please refer to the Product Dating Information document: https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/marketing/global/documents/449/386/product-dating-information-mk.pdf

      Helpful?

  3. How is shipping temperature determined? And how is it related to the product storage temperature?

    1 answer
    1. Products may be shipped at a different temperature than the recommended long-term storage temperature. If the product quality is sensitive to short-term exposure to conditions other than the recommended long-term storage, it will be shipped on wet or dry-ice. If the product quality is NOT affected by short-term exposure to conditions other than the recommended long-term storage, it will be shipped at ambient temperature. As shipping routes are configured for minimum transit times, shipping at ambient temperature helps control shipping costs for our customers. For more information, please refer to the Storage and Transport Conditions document: https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/marketing/global/documents/316/622/storage-transport-conditions-mk.pdf

      Helpful?

  4. Good afternoon, The specification of this product indicates that the amount of sulfate is lower or equal to 15%. Could you please specify what the 15% refers to? mass of sulfate groups per total mass of the polymer? Best regards

    1 answer
    1. This product contains trace amounts of sulfate. The maximum amount allowable is 0.15% by weight.

      Helpful?

Reviews

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  1. Freiburg, Germany
    • Review 1
    • Votes 3
    5 out of 5 stars.

    Perfect for DNA gel electrophoresis

    We use this agarose already since several years in the lab on a regular basis for our DNA gel electrophoresis and always obtained very good results. We use in for gels from 0.8 up to 4%.

    Helpful?

  2. 1 Ratings-Only Review

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