反轉錄
反轉錄 (RT) 是使用反轉錄酶和 dNTPs 將 RNA 轉換成 cDNA 的過程。
RT步驟可以在總RNA上進行,以便產生代表樣本中所有RNA轉錄本的全局cDNA(通常通過兩步協議),或在基因特異性方法中進行,以便僅將感興趣的RNA轉換為cDNA(通常遵循一步協議)。
以下實驗可用作基本RT協議,並可根據特定要求進行修改。慣常的做法是使用兩步流程製備 cDNA,然後在加入 PCR/qPCR 之前稀釋 cDNA,或者製備一步反應,兩個流程依序進行。
設備
- 標準 PCR 儀器或加熱塊
試劑
- RNA(濃縮液約 1 μg/μL)。
- ReadyScript® 兩步 cDNA 合成試劑盒 (RDRT)。也可配合 oligo-dT 引物和/或隨機引物使用其他反轉錄試劑盒。
- PCR 級水:PCR級水(W1754 或 W4502),20 mL等分,冷凍;每次反應使用新的等分。
無菌 1.5 mL 螺旋蓋微量離心管 (CLS430909) PCR 管和板,請選擇符合所需格式的一種:
- Individual thin-walled 200 μL PCR tubes (Z374873 or P3114)
- Plates
- 96-well plates (Z374903)
- 384孔板(Z374911)
- 孔板封條或孔蓋
- ThermalSeal RTS™封口膜(Z734438)
- ThermalSeal RT2RR™ 薄膜 (Z722553) 方法
製備
- 將 ReadyScript® kit 成分和 RNA 樣品放在冰上。
- 混合,然後簡單離心,收集管底部的內容物。
反應
- 確定所需反應的數量,包括對照。計算所有反應所需各成分的體積(預留 10% 額外體積以防移液誤差),並根據 表 P10-26 使用 0.2 mL 管或放置在冰上的 96 孔板結合試劑。如果使用 PCR 板,請按照板示意圖確保試劑添加到正確的孔中。
- Individual thin-walled 200 μL PCR tubes (Z374873 or P3114)
- Plates
- 96-well plates (Z374903)
- 384孔板(Z374911)
- 孔板封條或孔蓋
- ThermalSeal RTS™封口膜(Z734438)
- ThermalSeal RT2RR™ 薄膜 (Z722553)
- 密封每個反應後,輕輕攪拌以混合內容物。短暫離心,收集反應管底部的成分。
- 根據表 P10-27 孵育反應混合物。
- 完成 cDNA 合成後,使用 1:5 至 1:10 的第一鏈反應(2-4 μL)進行 PCR 擴增。
注意:使用 ReadyScript® 試劑時,可將 2-4 μL 未稀釋的 cDNA 加入 PCR 而不會造成抑制。如果需要,cDNA 產品可以用 10 mM Tris- HCl (pH8.0)、0.1 mM EDTA 稀釋,並儲存於 -20 °C。
材料
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