Foszfatáz inhibitor koktél
Ian Gleiser, Pnina Yaish, Efrat Barnea-Gedalyahu, Dorit Zharhary
Bevezetés
A foszforiláció egy reverzibilis fehérje poszt-transzlációs módosítás. A fehérje kinázok katalizálják az ATP negatív töltésű γ-foszfátcsoportjának átvitelét a fehérje szerin-, treonin- vagy tirozin-maradványainak hidroxil-oldalláncára, megváltoztatva a fehérje konformációját és aktivitását. A fordított reakciót, a foszfát eltávolítását a fehérjéből, vagyis a defoszforilációt a fehérjefoszfatázok végzik.1,2 Az emlősfehérjék három-négy százaléka kináz és foszfatáz, egyesek néhány célfehérjére specifikusak, míg mások széles körben, sok fehérjére hatnak.
A fehérjék foszforilációja kulcsfontosságú szabályozási mechanizmus, amely szabályozza a fehérjék aktivitását, kölcsönhatásait, lokalizációját és degradációját. Szabályozza a jelátvitel, a sejtciklus, az apoptózis, az anyagcsere és más folyamatokat. Egy tipikus emlőssejtben található fehérjék körülbelül egyharmada foszforilálódik, sok közülük több helyen is. A szerin-foszforiláció a foszfoproteom 86%-át teszi ki, míg a treonin- és tirozin-foszforiláció 12%-ot, illetve 2%-ot. Számos emberi betegség a sejtfehérjék abnormális foszforilációjával hozható összefüggésbe.3-5
A sejt számára számos előnnyel jár, ha egy fehérje foszforilációját/defoszforilációját kontrollmechanizmusként használja. Gyors, nem igényel új fehérjék szintézisét vagy a fehérjék lebomlását, és reverzibilis reakció.
A fehérje-foszforilációval járó sejtfolyamatok, például a jelátviteli kaszkádok és a fehérje-fehérje kölcsönhatások tanulmányozásakor, vagy egy fehérje foszforilált helyeinek elemzése és foszfoprotein-tisztításakor elengedhetetlen a sejtfehérje-foszfatázok foszfatáz-inhibitorokkal történő gátlása. Ez lehetővé teszi a célfehérje/fehérjék foszforilációs állapotának befagyasztását egy választott időpontban. A www.phosphosite.org foszforilációs adatbázis 80 000 foszforilációs helyet jelent. Ezek többségének kimutatása nem lenne lehetséges a foszfatáz inhibitorok használata nélkül.
Fehérje-foszfatázok
A fehérje-foszfatázokat szubsztrátspecificitásuk alapján alkategóriákra osztják (1. táblázat).
- Alkalikus foszfatáz6-8 - A nem specifikus foszfatázok családja, amely a foszfátcsoportok eltávolításáért felelős sokféle molekuláról, beleértve a fehérjéket, nukleotidokat és alkaloidokat. Az emlősök alkalikus foszfatáz izoenzimeit a homoarginin és a levamisol analógok gátolják. Az intestinális és placentáris izoenzimeket azonban nem gátolja a levamisol, de az imidazol gátolja.
- Protein szerin/ treonin foszfatáz9,10 - A foszfoprotein foszfatázok ezen osztálya teszi ki a Ser/Thr foszfatáz aktivitás többségét in vivo. Két fő alosztályt foglal magában, a PP1-et és a PP2-t. Ez utóbbit tovább osztják a fémionigény alapján: PP2A, amely nem igényel fémiont; PP2B, amely kalcium stimulált; és PP2C, amely Mg2+ függő. A Ser/Thr-foszfatázokat számos kis molekula gátolja, többek között tengeri szivacsokból, talajban élő streptomiciumokból. A legismertebbek az okadaic-sav, a calyculin A, a microcystin-LR, a tautomicin, a fostriecin és a kantaridin. E vegyületek aktivitása különböző specifitású a különböző Ser/Thr foszfatázokkal szemben.11
- Protein tirozin foszfatáz12 - Az enzimek egy csoportja, amely a fehérjék foszforilált tirozinmaradványairól egy ciszteinil-foszfát enzimintermedier segítségével távolítja el a foszfátcsoportokat. Ezek az enzimek a jelátviteli útvonalak kulcsfontosságú szabályozó komponensei. A tirozin-foszfatázokat ortovanadát és rokon vegyületek, valamint nátrium-fluorid gátolja.
- Dupla-specifitású (Tyr és Ser/Thr) foszfatázok3 - A kettős-specifitású foszfatázok a fehérje-tirozin-foszfatázok egy alosztálya, amelyek képesek a szerin- és treonin-maradékok foszforilálására is. Részt vesznek a kulcsfontosságú sejtszignál-útvonalak szabályozásában. Konkrét példák ezekre az inhibitorokra a hivatkozásban találhatók.13
Foszfatáz inhibitor koktélok
A foszfatáz inhibitorok használata kritikus fontosságú a foszforilációs vizsgálatok minden típusánál. A fehérjék defoszforilációtól való védelmének biztosítása érdekében a foszfatázok legszélesebb körét lefedő foszfatáz inhibitor koktélok sorát kínáljuk. A termékcsalád 2 koktélt tartalmaz: Foszfatáz inhibitor koktél 2 (Cat. No. P5726) és a foszfatáz inhibitor koktél 3 (Cat. No. P0044). A Phosphatase Inhibitor Cocktail 3, a legújabb foszfatáz inhibitor koktélunk a Ser/Thr foszfatázok felé irányuló foszfatáz inhibitorok keveréke. A foszfatáz inhibitor koktél 3 a foszfatáz inhibitor koktél 1 (Cat. No. P2850). A két koktél közötti különbség az, hogy az új Foszfatáz inhibitor koktél 3 a Foszfatáz inhibitor koktél 1-ben található mikrocisztin-LR helyett Calyculin A-t tartalmaz. A 2. táblázat tartalmazza az egyes koktélokban található inhibitorok listáját.
Kísérleti eredmények
A következő kísérleti adatok az új foszfatáz inhibitor koktél 3 és az általa helyettesített foszfatáz inhibitor koktél 1 (Cat. No. P2850) gátló hatását hasonlítják össze. Az adatok azt mutatják, hogy a két koktél aktivitása egyenértékű.
Az adatokból kiderül, hogy a foszfatázok széles körének gátlása és a teljes foszfatázaktivitás hatékony csökkentése érdekében ajánlott mindkét foszfatázgátló koktélunk, a 2. foszfatázgátló koktél (Cat. No. P5726) és a Phosphatase Inhibitor Cocktail 3 (Cat. No. P0044).
A PP1α-szerű endogén aktivitást különböző sejt- és szövetkivonatokban a 32P-Ser foszforiláz A radioaktív szubsztrát segítségével mértük pH 7,5, 30 °C-on. A PP1α-szerű aktivitás mérése előtt 5 perccel, 30 °C-on 1%-os végső koncentrációban foszfatáz inhibitor koktélt 1 (Cat. No. P2850) vagy foszfatáz inhibitor koktélt 3 (Cat. No. P0044) adtunk a kivonatokhoz. A 1. ábra -ban feltüntetett aktivitások relatívak és nem abszolútak. Minél kisebb a megmaradt aktivitás, annál nagyobb a reakcióba adott koktél által okozott gátlás mértéke.
* Az ezeknél a mintáknál megfigyelt érték túl alacsony ahhoz, hogy a diagramon látható legyen, és nagyon közel van a nullához.
1. ábra.A PP1α-szerű aktivitás gátlása sejt- és szövetkivonatokban
A fehérje-foszfatáz 1α-szerű aktivitás gátlása
Foszfatáz inhibitor koktél 3 (Cat. No. P0044) a fehérje-foszfatáz 1α-szerű aktivitás hatékony gátlója sejtekben és szövetekben. Az alábbi kísérletek a gátlás hatékonyságát mutatják be, és összehasonlítják a korábbi Phosphatase Inhibitor Cocktail 1 (Cat. No. P2850).
Az emberi placenta 10-20-szor nagyobb PP1α-szerű aktivitást mutat mg fehérjénként, mint más szövetkivonatok. Ezért ezt választottuk a foszfatáz inhibitor koktélok gátlási hatékonyságának bizonyítására.
A humán placenta kivonatban az endogén PP1α-szerű aktivitást a radioaktív szubsztrát P-Ser foszforiláz A segítségével mértük pH 7,5, 30 °C-on. Különböző mennyiségű foszfatáz inhibitor koktél 1 (Cat. No. P2850) vagy foszfatáz inhibitor koktél 3 (Cat. No. P0044) adtuk a kivonathoz 30 °C-on, 5 perccel a PP1α-szerű aktivitás vizsgálata előtt.
A szarvasmarha-májkivonatban az endogén AP-szerű aktivitást pNPP-t használva szubsztrátként, pH 10,4, 37 °C-on kolorimetriás próbával mértük. A gátlást úgy végeztük el, hogy a kivonatot foszfatáz inhibitor koktél 3-mal (Cat. No. P0044) önmagában vagy a 2. foszfatáz inhibitor koktéllal együtt (Cat. No. P5726) 3 percig 37 °C-on az AP-szerű aktivitás vizsgálata előtt.
Az alkalikus foszfatáz (AP) hasonló aktivitás gátlása
Amint fentebb említettük, a különböző alkalikus foszfatáz izoenzimeket különböző inhibitorok gátolják. A foszfatáz inhibitor koktél 3 (Cat. No. P0044) erősen gátolja az alkalikus foszfatáz L-izoformáit, amelyek a szarvasmarha-májból származó kivonatokban jelen vannak, és szinergista hatást mutat, ha a 2. foszfatáz inhibitor koktéllal (Cat. No. P5726) ( 3A ábra).
A foszfatáz inhibitor koktél 3 (Cat. No. P0044) kevés hatással van az alkalikus foszfatáz aktivitás P-izoformáinak gátlására, amelyek bőségesen előfordulnak a humán placenta kivonatokban, ezért a gátlás a foszfatáz inhibitor koktél 2 (Cat. No. P5726 (3B ábra).
3A. és B. ábra.Az alkalikus foszfatáz (AP) típusú aktivitás dózisfüggő gátlása szarvasmarha-májkivonatban
Az olvasás folytatásához jelentkezzen be vagy hozzon létre egy felhasználói fiókot.
Még nem rendelkezik fiókkal?