Analisi delle acque reflue e di processo
La depurazione delle acque reflue e di processo è necessaria per proteggere la salute pubblica e l’ambiente, ma anche per mantenere costante l’efficienza dei processi industriali. La maggior parte degli enti normativi richiede una regolare analisi degli effluenti di lavorazione nelle varie fasi del loro trattamento. Solitamente anche le acque di processo utilizzate nelle caldaie e nei sistemi di raffreddamento vengono sottoposte ad analisi chimica.
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Panoramica delle metodiche di NGS
Nonostante la metodologia e i reagenti per NGS siano in continua evoluzione, i ricercatori possono comunque contare su numerosi sistemi NGS. Le piattaforme più diffuse integrano nel flusso di lavoro dell'NGS molti dei passaggi critici, tra cui la preparazione del campione o della libreria, la generazione dei cluster, il sequenziamento e l'analisi dei dati. La preparazione del campione in genere comporta l'amplificazione del DNA o l'aggiunta di oligonucleotidi linker o adattatori. La generazione di un cluster a partire da ogni sequenza di DNA avviene quando il DNA legato covalentemente al linker si ibrida a una superficie solida per l'amplificazione a ponte mediante PCR o con metodi alternativi come la PCR in emulsione. Inoltre, sono disponibili molti metodi per sequenziare il DNA, tra cui sequenziamento mediante ligazione, sequenziamento per sintesi, pirosequenziamento e sequenziamento basato su semiconduttore ionico. Ciascun metodo comporta fasi di reazione e processi chimici differenti dai quali dipenderanno la lunghezza di ciascuna sequenza (lunghezza delle reads), il tasso di errore e il costo dei reagenti.
Approcci analitici per l'analisi dei dati di NGS
Tutte le metodologie dell'NGS, convergono nella fase finale cruciale dell'interpretazione dei dati successiva al sequenziamento. Ogni piattaforma e flusso di lavoro dell'NGS produce un'enorme quantità di informazioni digitali acquisite dai computer; l'insieme dei dati grezzi deve essere quindi analizzato dai bioinformatici che, per l'allineamento e la mappatura della reads si avvalgono di un numero sempre crescente di strumenti analitici, come Bowtie, Galaxy e molti altri. Molti degli sviluppi nel campo delle tecnologie di NGS sono il frutto della convergenza di diversi ambiti scientifici che ha consentito di sviluppare e ottimizzare l'analisi e l'interpretazione di insiemi di dati così vasti. A seconda delle diverse esigenze applicative, i ricercatori sono ora in grado di sfruttare questi potenti strumenti per sequenziare interi genomi, esomi o trascrittomi per la di ricerca di base e per gli studi sulle malattie.
Visitate la nostra raccolta di documenti in cui troverete schede tecniche, certificati e documentazione tecnica.
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