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  • Chromatin status of apoptosis genes correlates with sensitivity to chemo-, immune- and radiation therapy in colorectal cancer cell lines.

Chromatin status of apoptosis genes correlates with sensitivity to chemo-, immune- and radiation therapy in colorectal cancer cell lines.

Apoptosis : an international journal on programmed cell death (2014-10-09)
Anne Benard, Connie M Janssen, Peter J van den Elsen, Marja C J A van Eggermond, Dave S B Hoon, Cornelis J H van de Velde, Peter J K Kuppen
RESUMO

The apoptosis pathway of programmed cell death is frequently deregulated in cancer. An intact apoptosis pathway is required for proper response to anti-cancer treatment. We investigated the chromatin status of key apoptosis genes in the apoptosis pathway in colorectal cancer cell lines in relation to apoptosis induced by chemo-, immune- or radiation therapy. Using chromatin immunoprecipitation (ChIP), we measured the presence of transcription-activating histone modifications H3Ac and H3K4me3 and silencing modifications H3K9me3 and H3K27me3 at the gene promoter regions of key apoptosis genes Bax, Bcl2, Caspase-9, Fas (CD95) and p53. Cell lines DLD1, SW620, Colo320, Caco2, Lovo and HT29 were treated with cisplatin, anti-Fas or radiation. The apoptotic response was measured by flow cytometry using propidium iodide and annexin V-FITC. The chromatin status of the apoptosis genes reflected the activation status of the intrinsic (Bax, Bcl2, Caspase-9 and p53) and extrinsic (Fas) pathways. An active intrinsic apoptotic pathway corresponded to sensitivity to cisplatin and radiation treatment of cell lines DLD1, SW620 and Colo320. An active Fas promoter corresponded to an active extrinsic apoptotic pathway in cell line DLD1. mRNA expression data correlated with the chromatin status of the apoptosis genes as measured by ChIP. In conclusion, the results presented in this study indicate that the balance between activating and silencing histone modifications, reflecting the chromatin status of apoptosis genes, can be used to predict the response of tumor cells to different anti-cancer therapies and could provide a novel target to sensitize tumors to obtain adequate treatment responses.

MATERIAIS
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Cloreto de sódio, for molecular biology, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration)
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Acetato de sódio, ACS reagent, ≥99.0%
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Acetato de sódio, puriss. p.a., ACS reagent, reag. Ph. Eur., anhydrous
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Sodium chloride solution, 0.9% in water, BioXtra, suitable for cell culture
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Fluoreto de fenilmetanosulfonil, ≥98.5% (GC)
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Cloreto de sódio, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99%
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Sodium chloride solution, 5 M in H2O, BioReagent, for molecular biology, suitable for cell culture
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Sodium chloride solution, 5 M
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Sodium butyrate, 98%
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cis-Diammineplatinum(II) dichloride, crystalline
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Sodium chloride solution, BioUltra, for molecular biology, ~5 M in H2O
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Fluoreto de fenilmetanosulfonil, ≥99.0% (T)
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Cloreto de sódio, 99.999% trace metals basis
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Isoamyl alcohol, ≥98%, FG
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Cloreto de sódio, BioUltra, for molecular biology, ≥99.5% (AT)
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3-Methyl-1-butanol, reagent grade, 98%
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Acetato de sódio, >99%, FG
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Acetato de sódio, 99.995% trace metals basis
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3-Methyl-1-butanol, ACS reagent, ≥98.5%
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Sodium acetate solution, BioUltra, for molecular biology, ~3 M in H2O
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Acetato de sódio, anhydrous, free-flowing, Redi-Dri, ACS reagent, ≥99.0%
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Acetato de sódio, anhydrous, BioUltra, for luminescence, for molecular biology, ≥99.0% (NT)
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Acetato de sódio, powder, BioReagent, suitable for electrophoresis, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, ≥99%
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Isoamyl alcohol, natural, ≥98%, FG
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3-Methylbutanol, for molecular biology, BioReagent, ≥98.5%
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cis-Diamineplatinum(II) dichloride, ≥99.9% trace metals basis
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Cloreto de sódio, BioXtra, ≥99.5% (AT)
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Anticorpo antiacetil-histona H3, from rabbit
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