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Roche

Kit de marcação de RNA com DIG (SP6/T7)

greener alternative

sufficient for 2 x 10 labeling reactions, kit of 1 (12 components), suitable for hybridization, suitable for Southern blotting

Sinônimo(s):

Sistema DIG, rotulagem de rna

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About This Item

Código UNSPSC:
41105500

uso

sufficient for 2 x 10 labeling reactions

Nível de qualidade

embalagem

kit of 1 (12 components)

fabricante/nome comercial

Roche

características do produto alternativo mais ecológico

Designing Safer Chemicals
Learn more about the Principles of Green Chemistry.

sustainability

Greener Alternative Product

técnica(s)

Northern blotting: suitable
Southern blotting: suitable
hybridization: suitable

categoria alternativa mais ecológica

temperatura de armazenamento

−20°C

Descrição geral

Tempo de ensaio: 145 minutos
Materiais da amostra
  • DNA de plasmídeo linearizado
  • Produto de PCR
Princípio
O kit de marcação de RNA com DIG produz sondas de RNA de fita simples marcadas com DIG de comprimento conhecido. A RNA polimerase para SP6 ou para T7 transcreve essas sondas in vitro a partir de um molde de DNA (na presença de digoxigenina-UTP).
Marcação de RNA por transcrição in vitro
O DNA a ser transcrito é clonado no sítio de poli-ligação de vetores de transcrição apropriados (p.ex., pSPT 18 ou 19), contendo promotores de RNA polimerases para SP6 e T7. O molde de DNA adjacente é linearizado em um sítio adequado, e as RNA polimerases são usadas para produzir transcritos por “run off”. A DIG-UTP é incorporada ao transcrito. Cada 20º a 25º nucleotídeo do RNA recém-sintetizado é uma DIG-UTP. Dado que a concentração de nucleotídeos não se torna limitante na reação padrão de transcrição, essa reação pode gerar grandes quantidades de RNA marcado.
Estamos comprometidos em trazer para você produtos alternativos mais ecológicos, que aderem a um ou mais dos 12 princípios de química ecológica (The 12 Principles of Greener Chemistry). Este produto foi desenvolvido como um produto químico mais seguro.  O sistema de DIG foi estabelecido como uma alternativa sensível e econômica ao uso de radioatividade para marcação e detecção de ácidos nucleicos. Existem várias publicações disponíveis que comprovam a versatilidade do sistema de DIG, de modo que o uso de radiomarcação não é mais a única opção para marcação de DNA para hibridização.
Kit de marcação de RNA com digoxigenina-UTP por transcrição in vitro com polimerases para SP6 e T7. Por esse método, são produzidas sondas de RNA de fita simples de comprimento conhecido, que podem ser usadas em diversas técnicas de hibridização.

Especificidade

Sensibilidade e especificidade
As sondas de RNA marcadas com DIG podem detectar genes de cópia única em apenas 1 μg de DNA de mamíferos nas seguintes condições de ensaio: A mistura de hibridização contém 20 a 100 ng de sonda marcada/ml, e a sonda ligada é detectada com fosfatase alcalina (FA) anti-DIG e visualizada com o substrato quimioluminescente CDP-Star.
Inativação térmica: Pare a reação com a adição de 2 μl de EDTA 0,2 M (pH 8,0).

Aplicação

Marcação de RNA com DIG-11-UTP por transcrição in vitro com RNA polimerases para SP6 e T7. Os transcritos “run off” marcados com DIG são sintetizados com alta eficiência e podem ser usados em diversas técnicas de hibridização:
  • Northern blot
  • Southern blot
  • Hibridizações in situ
  • Hibridização de colônia ou placa
  • Experimentos de proteção de RNase
Devido a sistemas de detecção altamente específicos e sensíveis, as sondas marcadas com DIG podem ser usadas para detecção de genes de cópia única em 1 μg de DNA humano total.
Observação: Dado que a ligação entre DIG e UTP é resistente a álcalis, o RNA marcado com DIG pode ser fragmentado por tratamento alcalino. Uma leve redução do tamanho da sonda de RNA marcada com DIG pode torná-la mais adequada para determinadas aplicações de hibridização in situ.

Embalagem

1 kit contendo 12 componentes.

Qualidade

Princípio do teste: O molde de DNA a ser transcrito é clonado no sítio de poli-ligação de vetores de transcrição apropriados, que contém promotores de RNA polimerases para SP6 e/ou T7. Após a linearização em um sítio adequado, o RNA é transcrito na presença de DIG-UTP. Em condições normais, cerca de 10 μg de RNA de comprimento total marcado com DIG são transcritos a partir de 1 μg de molde.

Outras notas

Somente para fins de pesquisas biológicas. Não é destinado ao uso em procedimentos diagnósticos.

Somente componentes do kit

Nº do produto
Descrição

  • pSPT18 DNA 0.25 mg/ml

  • pSPT19 DNA 0.25 mg/ml

  • Control DNA 1, pSPT18-Neo, cleaved with Pvu II 0.25 mg/ml

  • Control DNA 2, pSPT19-Neo, cleaved with Pvu II 0.25 mg/ml

  • DIG-labeled Control RNA, DIG-labeled "antisense" neo RNA 100 ng/µl

  • Unlabeled Control RNA, neo poly (A) "sense" RNA 200 µg/ml

  • NTP Labeling Mixture 10x concentrated

  • Transcription Buffer 10x concentrated

  • DNase I, RNase-free 10 U/µl

  • Protector RNase Inhibitor 20 U/µl

  • SP6 RNA Polymerase 20 U/µl

  • T7 RNA Polymerase 20 U/µl

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Pictogramas

Exclamation mark

Palavra indicadora

Warning

Frases de perigo

Classificações de perigo

Acute Tox. 4 Oral - Eye Irrit. 2 - Skin Sens. 1

Código de classe de armazenamento

12 - Non Combustible Liquids

Classe de risco de água (WGK)

WGK 2

Ponto de fulgor (°F)

does not flash

Ponto de fulgor (°C)

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Artigos

Digoxigenin (DIG) labeling methods and kits for DNA and RNA DIG probes, random primed DNA labeling, nick translation labeling, 5’ and 3’ oligonucleotide end-labeling.

Protocolos

Determine the labeling efficiency in terms of μg (expected yield of a standard labeling reaction is 20 μg of DIG labeled RNA per μg linearized template DNA after the DIG RNA labeling reaction).

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