WTA2

TransPlex^® Complete Whole Transcriptom Amplification Kit

DNA polymerase included, Complete Kit with optimized enzyme to amplify total RNA in <4 hours, no 3′ bias

• Synonym(e): Kit zur vollständigen Gesamttranskriptom-Amplifikation
• NACRES: NA.55
• UNSPSC Code: 41121800

Eigenschaften

• Quality Segment: 200
• technique(s): whole genome amplification: suitable
• dilution: (WTA)
• input: purified RNA
• shipped in: wet ice
• storage temp.: −20°C

Beschreibung

General description

WTA2 ist dazu optimiert, RNA aus Formalin-fixierten Paraffin-eingebetteten (FFPE) und anderen beschädigten oder verschlechterten Proben zu amplifizieren. Die Whole Transcriptome Amplification(WTA)-Technologie ermöglicht die repräsentative Amplifikation von Mengen im niedrigen Nanogrammbereich der Gesamt-RNA in weniger als 4 Stunden, ohne 3′-Schieflage. Die Amplifikationsprodukte eignen sich für Anwendungen wie qPCR, Mikroarray-Analyse und Klonen. Das WTA2-Kit enthält die Polymerase, die erforderlich ist, um die cDNA-Bibliothek zu amplifizieren.

Application

Geeignet für die Verwendung in Downstream-Anwendungen, einschließlich:

• qPCR
• Mikroarray-Analyse
• Klonen

Das Kit zur vollständigen Gesamttranskriptom-Amplifikation wird für die folgenden Anwendungen eingesetzt:

• Zum Etablieren eines Protokolls für die gleichzeitige Analyse von DNA- und RNA-Viren aus Schweinefäkalien durch den Prozess der kontrollierten Tiefensequenzierung.[1]
• Reverse Transkription und cDNA-Amplifikation.[2][3][4]
• Für die Synthese und Amplifikation einer cDNA-Bibliothek unter Verwendung von genomischer RNA, die aus immuneingefangenen PPV-Teilchen freigesetzt wird.[5]
• Nukleinsäurenaufbereitung und Tiefensequenzierung (Die extrahierten Nukleinsäuren wurden zufällig für die cDNA-Synthese geprimt.)[6]

Biochem/physiol Actions

Das WTA2-Verfahren involviert zwei Schritte. Im ersten Schritt wird eine RNA-Probe mit nicht selbstkomplementären Primern, die aus einem quasi-zufälligen 3′-Ende und einem universellen 5′-Ende bestehen, revers transkribiert. Während diesem Verfahren dienen verdrängte Einzelstränge als neue Matrizen für die Primer-Anlagerung und -Verlängerung. Die daraus resultierende cDNA-Bibliothek besteht aus zufälligen, überlappenden Fragmenten mit 100 bis 1.000 Basenfragmenten, die von universellen Endsequenzen umgeben sind. Der 2. Schritt amplifiziert die cDNA-Bibliothek mittels PCR unter Verwendung von WTA2-Polymerase und einem universellen End-Primer, um ein WTA2-Produkt zu erzeugen.

Features and Benefits

• Eine bis zu 10.000-fache Amplifilkation kann in weniger als 4 Stunden erreicht werden, wobei weniger als 30 Minuten aktive Arbeit erforderlich sind
• Nur 20 pg der gesamten RNA-Matrix ist erforderlich, um geeignete cDNA für die Mikroarray-Profilerstellung zu amplifizieren
• Enthält alle erforderlichen Komponenten für die cDNA-Amplifikation
• Erreichen Sie eine lineare Amplifikation von exprimierten Genen und Exonen, ohne 3′- oder 5′-Schieflage
• Amplifiziert Einzelzellen oder Low-Input-RNA wirksam, einschließlich mRNA und Gesamt-RNA von jedem Tier, jeder Pflanze oder jedem Mikroorganismus

Kit-Komponenten auch einzeln erhältlich

• Library Synthesis Enzyme

  SDB
• Library Synthesis Solution

  SDB
• Amplification Mix

  SDB
• Library Synthesis Buffer

  SDB
• W4502

  Water, Nuclease-Free Water, for Molecular Biology

  SDB
• Amplification Enzyme

  SDB
• D7295

  Deoxynucleotide Mix, 10 mM, Molecular Biology Reagent

  SDB

Sicherheitshinweise

• Lagerklasse: 10 - Combustible liquids
• wgk: WGK 3