細菌學

細菌學學科涉及細菌物種的遺傳學、結構、生理學、行為、致病性、生態學和進化的各個方面。細菌學研究在臨床診斷和工業品質控制中是不可或缺的。顯微鏡在細菌學中的應用包括使用適當的方法（如革蘭染色法）對微生物進行染色，以確定細菌分類或檢測分枝桿菌。

• 革蘭染色
• 分枝桿菌染色
• 滴蟲染色
• 常見的細菌學診斷染色及其用途

革蘭染色

革蘭染色是細菌學中用來區分革蘭陽性和革蘭陰性細菌的重要染色技術。在此方法中，由於革蘭陽性細菌的細胞壁上有一層厚厚的肽聚糖，因此能保留水晶紫染色，從而達到區分的目的。

相反地，革蘭陰性細菌會被有機溶劑脫色，在反染色時會變成橘紅色，這是由於肽聚糖壁較薄所致。此多步染色過程所需的試劑包括水晶紫（主要染色）、苯胺染料、碘溶液（媒染劑）、黃橙（次要染色）或卡波爾紫蘇反染色。

分枝桿菌染色

分枝桿菌感染的早期診斷非常重要，因為耐酸菌具有高度致病性，是肺結核等嚴重疾病的罪魁禍首。有多種染色方案可用於檢測組織培養物和細菌學塗片中的這些致病細菌。螢光檢測方法是利用 Ziehl-Neelsen 染色技術，透過熱處理玻片（熱染色）或非熱處理（冷染色）。這種差異染色技術使用脂溶性酚類化合物石碳酸品紅作為主染劑，並使用孔雀石綠作為副染劑。

滴蟲染色

陰道滴蟲陰道滴蟲時，會使用各種染色劑，如Giemsa和吖啶橙，以及濕裝片檢查。