Przejdź do zawartości
Merck

Retrospective cell lineage reconstruction in humans by using short tandem repeats.

Cell reports methods (2021-08-04)
Liming Tao, Ofir Raz, Zipora Marx, Manjusha S Ghosh, Sandra Huber, Julia Greindl-Junghans, Tamir Biezuner, Shiran Amir, Lilach Milo, Rivka Adar, Ron Levy, Amos Onn, Noa Chapal-Ilani, Veronika Berman, Asaf Ben Arie, Guy Rom, Barak Oron, Ruth Halaban, Zbigniew T Czyz, Melanie Werner-Klein, Christoph A Klein, Ehud Shapiro
ABSTRAKT

Cell lineage analysis aims to uncover the developmental history of an organism back to its cell of origin. Recently, novel in vivo methods utilizing genome editing enabled important insights into the cell lineages of animals. In contrast, human cell lineage remains restricted to retrospective approaches, which still lack resolution and cost-efficient solutions. Here, we demonstrate a scalable platform based on short tandem repeats targeted by duplex molecular inversion probes. With this human cell lineage tracing method, we accurately reproduced a known lineage of DU145 cells and reconstructed lineages of healthy and metastatic single cells from a melanoma patient who matched the anatomical reference while adding further refinements. This platform allowed us to faithfully recapitulate lineages of developmental tissue formation in healthy cells. In summary, our lineage discovery platform can profile informative somatic mutations efficiently and provides solid lineage reconstructions even in challenging low-mutation-rate healthy single cells.

MATERIAŁY
Numer produktu
Marka
Opis produktu

Sigma-Aldrich
Ethylene glycol-bis(2-aminoethylether)-N,N,N′,N′-tetraacetic acid, for molecular biology, ≥97.0%
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Phenylmethanesulfonyl fluoride, ≥98.5% (GC)
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
DL-Dithiothreitol, ≥98% (HPLC), ≥99.0% (titration)
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Potassium chloride, BioXtra, ≥99.0%
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Phenol – chloroform – isoamyl alcohol mixture, BioUltra, for molecular biology, 25:24:1
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Sodium chloride, ACS reagent, ≥99.0%
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
TWEEN® 20, for molecular biology, viscous liquid
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Anti-CD3, T Cell antibody produced in rabbit, whole antiserum
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Ammonium persulfate, for molecular biology, suitable for electrophoresis, ≥98%
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Benzamidine hydrochloride hydrate, ≥99%
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Magnesium chloride hexahydrate, BioXtra, ≥99.0%
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Sucrose, for molecular biology, ≥99.5% (GC)
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Iodoacetamide, ≥99% (NMR), crystalline
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Triton X-100, laboratory grade
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Glycerol, for molecular biology, ≥99.0%
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, ACS reagent, 99.4-100.6%, powder
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP
Millipore
ANTI-FLAG® M2 Affinity Gel, purified immunoglobulin, buffered aqueous glycerol solution
Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych
SKUGabaryty przesyłkiDostępnośćCena nettoIlość
5 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
785,00 MXP
100 g
Dostępny w magazynie
Szczegóły...
1352,00 MXP
500 g
Przewidywany termin wysyłki 21 marca 2025
1837,00 MXP