蛋白富集
Sera-Mag SpeedBeads Protein A/G Magnetic Particles(表 1)提供了一種快速、方便的方法,可利用親和結合進行蛋白質的手動和自動磁性分離。這種微粒可用於從血清、細胞培養上清液或腹水中分離抗體,以及從細胞或組織萃取物中進行免疫沉澱和抗原的共免疫沉澱。結合的抗體或抗原可使用洗脫緩衝液從微粒中離解。
微粒可使用磁力架從溶液中人工移除,或使用自動磁性微粒處理系統自動移除。
Sera-Mag SpeedBeads Protein A/G Magnetic Particles 含有重組蛋白 A/G(Mr ~50 500;SDS-PAGE 表觀分子量 Mr ~40,000 至 45,000),結合了蛋白 A 和蛋白 G 的 IgG 結合域。
蛋白 A/G包含蛋白A的四個Fc結合域和蛋白G的兩個Fc結合域,使其成為研究和純化免疫球蛋白更通用和方便的工具。
Sera-Mag SpeedBeads Protein A/G 顆粒是均勻、膠體穩定、單分散、無孔的超順磁性球體,由專利的核殼法製成。
核是由苯乙烯和酸單體的自由基乳液聚合製成的羧酸鹽改性顆粒。兩層磁鐵礦 (Fe3O4) 塗佈在此核心顆粒上,因此磁性反應時間更快。表面以專利方法進行化學改性,以減少蛋白質的非特異結合。最後,蛋白質 A/G 共價結合到微粒表面。
微粒以 1% 固體 (10 mg/mL) 儲存在 0.05% 疊氮化鈉中供應,有 1 mL、5 ml 和 100 mL 三種包裝規格。
使用 Sera-Mag SpeedBeads Protein A/G Magnetic Particles 前的重要資訊
- 請勿離心、乾燥或冷凍磁性微粒。離心、乾燥或冷凍會使顆粒聚集並失去結合活性。
- 我們建議在使用前徹底混合(渦旋、滾動或聲納)磁性蛋白 A/G顆粒。
- 我們建議在使用前徹底混合(渦旋、滾動或聲波處理)磁性蛋白 A/G 顆粒。聲波處理是徹底、有效地重悬顆粒的首選方法。
- 建議使用探頭式超聲波儀進行聲波處理,以重悬長期儲存和清洗步驟後的顆粒。
- 為了減少蛋白質降解,在製備細胞裂解液時加入蛋白酶抑制劑。低pH淘洗的最佳時間為10分鐘。
- 在下游 Western 印迹应用中使用兔抗体(一抗或二抗)时,请在室温下使用 SDS-PAGE 样品缓冲液进行洗脱。對於所有其他抗體種類,在單次使用的應用中,在 SDS-PAGE 樣品緩衝液中煮沸微粒是可以接受的。
- Sera-Mag SpeedBeads Protein A/G Magnetic Particles 可用于小规模抗体纯化和免疫沉淀,以及 Western 印迹和质谱分析。
手動抗體純化程序
所需的其他材料
- 1.5 mL 微離心管。
- 樣本:血清、濃縮細胞培養上清液或濃縮腹水。
- 結合/清洗緩衝液:Tris-buffered saline (25 mM Tris, 0.15 M NaCl, pH 7.5) containing 0.05 % Tween®-20 detergent.
- 洗滌緩衝液:0.1 M 甘氨酸,pH 2-3。
- 中和緩衝液:高離子強度鹼性緩衝液,如 1 M 磷酸鹽或 1 M Tris;pH 7.5-9.
- 磁力架(例如:MagRack 6,Cytiva、MagRack 6,Cytiva 代碼 28-9489-64)。
從血清、細胞培養上清液或腹水中純化抗體
注意:為了確保均勻性,使用前請重覆倒置、輕輕攪拌或使用旋轉平台徹底混合微粒。
- 將 50 μL (0.50 mg) Sera-Mag SpeedBeads Protein A/G Magnetic Particles 放入 1.5 mL 微離心管中。
- 將試管放入磁力架,靠著試管的側邊收集微粒。
- 在試管中加入 1 mL 粘合/沖洗緩衝液。倒轉試管數次或輕輕攪拌 1 分鐘。
- 用 490 μL 綁定/沖洗緩衝液稀釋 10 μL 樣品。
註:樣品容量可根據用戶喜好修改。 - 將稀釋後的樣品加入含有預洗磁性顆粒的試管中,輕輕攪拌或倒置混勻。
- 用磁力架收集顆粒,然後移除並棄掉上清液。
- 在試管中加入 500 μLof 結合/沖洗緩衝液,混勻,用磁力架收集顆粒並棄掉上清液。
- 在試管中加入 100 μL 洗滌緩衝液,混勻,在室溫下孵育 10 分鐘,間中攪拌。
- 用磁力架收集顆粒,然後移除並保存含有洗脫抗體的上清液。為了中和低 pH 值,每 100 μL 洗離液加 10 μL 的中和緩衝液。
註: 50 μL 是建議用於抗體純化的最小顆粒量。
自動化抗體純化程序
所需其他材料
- KingFisher™ Flex 配 96 深孔頭 (Thermo Scientific 產品編號 5400630) 或 KingFisher 96 (Thermo Scientific 產品編號 5400500)。
- KingFisher Flex Microtiter Deepwell 96平板,V底(Thermo Scientific產品編號95040450)。
- KingFisher Flex 96吸頭梳,用於深孔磁頭(Thermo Scientific產品編號97002534)。
- 結合/清洗緩衝液:含 0.05% Tween®-20 洗滌劑的 Tris-buffered saline).
- 洗滌緩衝液:0.1 M 甘氨酸,pH 2-3。
- 中和緩衝液:高離子強度鹼性緩衝液,如 1 M 磷酸鹽或 1 M Tris;pH 7.5-9.
儀器準備和平板設置
注意:以下方案是為 KingFisher Flex 或 KingFisher 96 儀器的一般使用而設計的。可使用儀器隨附的 Thermo Scientific BindIt™ 軟體根據客戶需求修改方案。
- 從 Thermo Scientific 網站下載「抗體純化」方案 (www.thermoscientific.com/kingfisher)下載到外部電腦的 BindIt 軟體中。
- 從外部電腦傳輸協議到 KingFisher Flex 或 KingFisher 96。有關匯入協議的詳細說明,請參閱《BindIt 軟體用戶手冊》。
- 根據表2設置平板。
注意事項
- 如果使用的孔少於 96 個,請在每個板中填入相同的孔。例如,如果使用 A1 至 A12 孔,則在所有板中使用這些相同的孔。
- 為確保珠粒均勻,在將珠粒加入板 1 前,請重覆倒轉、輕輕旋轉或旋轉平台,將小瓶徹底混勻。
- 將 Tip 與深孔 96 板結合。詳細說明請參閱 KingFisher Flex 或 KingFisher 96 用戶手冊。
- 可根據用戶喜好修改樣品容量。如果樣品容量是< 500 μL,用結合/清洗緩衝液稀釋到最終容量500 μL。
在KingFisher Flex上執行抗體純化方案
- 用儀器鍵盤上的箭頭選擇方案,然後按Start。詳情請參閱 KingFisher Flex 使用手冊。
- 推開儀器保護蓋的門蓋。
- 按照方案要求將板裝入 KingFisher Flex,將每塊板放置在同一方向。
- 處理完樣品後,按照儀器顯示器的指示移除平板。
- 移除每個平板後按下 Start。
- 移除所有平板後按下 Stop。
- 完成後,如果需要,為每 100 μL 洗出液加入 10 μL 中和緩衝液中和低 pH。
手動免疫沉澱 (IP) 的步驟
所需的其他材料
- 1.5 mL 微離心管。
- 結合緩衝液:Tris-buffered saline (25 mM Tris, 0.15 M NaCl, pH 7.5) containing 0.05% Tween®-20 detergent.
- 清洗緩衝液:25 mM Tris, 0.65 M NaCl, 0.05% Tween®-20 洗滌劑, pH 7.5.
- 低pH洗脱緩衝液:0.1 M 甘氨酸,pH 2-3。
- 替代洗脫緩衝液:SDS-PAGE 還原樣品緩衝液。
- 免疫共沉澱用抗原樣品。
- 抗原樣品。
- 細胞裂解緩衝液(用於調整 IP 反應容量)。
- 中和緩衝液:
免疫沉淀
注意:本方案是免疫沉淀的一般指南,需要針對每種應用進行優化。
- 將抗原樣品與 10 μg 抗體混合。用細胞裂解緩衝液調整反應容量至 500 μL。
- 將25 μL (0.25 mg) Sera-Mag SpeedBeads Protein A/G Magnetic Particles放入1.5 mL 微離心管中。
- 向微粒中加入 175 μL 洗滌緩衝液,輕輕攪拌。
- 將試管放入磁力架,靠著管側收集微粒。
- 在試管中加入 1 mL 洗滌緩衝液。倒轉試管數次或輕輕攪拌 1 分鐘。用磁力架收集微粒。
- 將抗原樣本/抗體混合物加入含有預洗微粒的 1.5 mL 微離心管中,在室溫下混和孵育 1 小時。
- 用磁力架收集顆粒,然後移除流出液並保存以備分析。
- 在管中加入 500 μL 洗滌緩衝液,輕輕混和 收集顆粒,然後丟棄上清液。重複此清洗兩次。
- 在試管中加入 500 μL 純淨水,輕輕混勻。在磁力架上收集微粒並棄掉上清液。
- 低pH洗脫:向試管中加入 100 μL 低 pH 洗滌緩衝液。在室溫下混和孵育 10 分鐘。磁力分離微粒並保存含有目標抗原的上清液。為中和低 pH 值,每 100 μL 洗出液加入 10 μL 中和緩衝液:管中加入 100 μL SDS-PAGE 還原樣品緩衝液,在加熱塊中以 96 °C 至 100 ºC 加熱 10 分鐘。磁力分離微粒,保存含有目標抗原的上清液。
注意:如果您要使用兔抗體(一級或二級)進行 Western 印跡,請勿加熱樣品。在室溫下混和孵育 10 分鐘。
.自動免疫沉澱的步驟
所需的其他材料
- 帶 96 深孔頭的 KingFisher Flex 或 KingFisher 96(Thermo Scientific 產品編號:5400630 或 5400500)。5400630 或 5400500)
- KingFisher Flex 微量滴定深孔 96 板,V 底(Thermo Scientific 產品編號 95040450)
- KingFisher Flex 96 深孔磁頭用吸頭梳(Thermo Scientific 產品編號 97002534)
- 1.5 mL 微量離心管
- 結合緩衝液:含 0.05 % Tween®-20 洗滌劑的三氫緩衝鹽水
- 清洗緩衝液:含 0.05 % Tween®-20 洗滌劑和 0.5 M NaCl 的三氫緩衝鹽水
- 低 pH 洗滌緩衝液:0.1 M 甘氨酸,pH 2-3
- 替代洗脫緩衝液:SDS-PAGE 還原樣品緩衝液。
- 抗原樣品
- 細胞裂解緩衝液(用於製備抗原樣品)
- 中和緩衝液:高離子強度鹼性緩衝液,如 1 M 磷酸鹽或 1 M Tris;pH 7.5-9)
- 磁力架
仪器准备和平板设置
注意:以下方案设计用于 KingFisher Flex 或 KingFisher 96 仪器的一般使用。使用儀器隨附的 BindIt 軟體,可以根據您的需要修改方案。
- 每個抗原樣品與 2-10 μg 免疫沉澱抗體混合。室溫孵育1-2小時或4ºC混勻過夜。
- 在外部電腦的BindIt軟體中輸入表3中的 「免疫沉澱 」方案。
- 從外部電腦將方案傳輸到KingFisher Flex或KingFisher 96。有關匯入方案的詳細說明,請參閱《BindIt 軟體用戶手冊》。
- 根據表3設置平板。
注意事項
- 如果使用少於 96 孔,請在每個板中填入相同的孔。例如,如果使用 A1 至 A12 孔,則在所有板中使用這些相同的孔。
- 為確保微粒均勻,在將微粒加入板 1 前,先將小瓶重複倒置、輕輕旋轉或旋轉平台徹底混合。詳細說明請參閱 KingFisher Flex 或 KingFisher 96 使用手冊。
- 可將顆粒洗脫至 100 μL 0.1 M glycine, pH 2-3 或 100 μL SDS-PAGE 還原樣品緩衝液中。如果在加热洗脱中使用SDS-PAGE还原样品缓冲液,请安装KingFisher Flex或96加热块(正确安装请参阅手册),在96°C至100 ºC下加热样品10分钟。
- 如果您选择SDS-PAGE还原样品缓冲液进行洗脱,并将使用兔抗体(一抗或二抗)进行Western印迹,请不要加热样品。
- 如果選擇低pH值的洗脫緩衝液進行洗脫,在運行完成後,每100 μL洗脫液用10 μL中和緩衝液中和pH值。
- 為了限制蒸發,請在 「加熱動作 」副標題下選擇 「混合 」和 「慢速 」速度。
執行自動免疫沉淀協議
- 使用儀器鍵盤上的箭頭選擇協議,然後按Start。詳情請參閱 KingFisher Flex 用戶手冊或 Kingfisher 96 用戶手冊。
- 推開儀器保護蓋的門。
- 根據方案要求將板裝入儀器,將每塊板放置在同一方向。按Start(開始)確認每個動作。
- 處理完樣品後,按照儀器顯示器的指示移除平板。移除每個平板後按 Start(開始)。移除所有平板後按 Stop。
疑難排解 |
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