Przejdź do zawartości
Merck
Wszystkie zdjęcia(4)

Kluczowe dokumenty

17-10263

Sigma-Aldrich

ChIPAb+ JMJD6 - przeciwciało z walidacją ChIP i zestaw starterów

from rabbit, purified by affinity chromatography

Synonim(y):

JMJD, jumonji domain containing 6, Phosphatidylserine receptor, Lysyl-hydroxylase JMJD6, Jumonji domain-containing protein 6, JmjC domain-containing protein 6, Peptide-lysine 5-dioxygenase JMJD6, Histone arginine demethylase JMJD63, Protein PTDSR

Zaloguj sięWyświetlanie cen organizacyjnych i kontraktowych


About This Item

Kod UNSPSC:
12352203
eCl@ss:
32160702
NACRES:
NA.32

pochodzenie biologiczne

rabbit

Poziom jakości

klon

polyclonal

oczyszczone przez

affinity chromatography

reaktywność gatunkowa

human

reaktywność gatunkowa (przewidywana na podstawie homologii)

Xenopus (based on 100% sequence homology)

producent / nazwa handlowa

ChIPAb+
Upstate®

metody

ChIP: suitable
western blot: suitable

numer dostępu NCBI

numer dostępu UniProt

Warunki transportu

dry ice

Opis ogólny

Białko 6 zawierające domenę JmjC (JMJD6) jest dioksygenazą należącą do grupy białek znanych jako białka zawierające domenę Jmjc. Ta rodzina białek jest grupą enzymów redoks szczególnie zaangażowanych w katalizowanie reakcji utleniania i charakteryzuje się obecnością wysoce konserwowanej domeny jumonji C (Jmjc). JMJD6 może funkcjonować zarówno jako hydroksylaza lizylowa, jak i demetylaza argininy histonowej. Jako hydroksylaza lizyny, JMJD6 katalizuje 5-hydroksylację docelowych reszt lizyny białka. Jako demetylaza argininy, JMJD6 odgrywa kluczową rolę w kodzie histonowym poprzez demetylację histonu H3 i histonu H4. Wykazano również, że pośredniczy w 5-hydrozylacji U2AF2/U2AF65, działając w ten sposób jako regulator splicingu RNA poprzez wpływ na aktywność pre-mRNA U2AF2/U2AF65. JMJD6 jest krytycznym składnikiem embriogenezy dla różnicowania różnych narządów i może działać jako regulator regulacji hematopoetycznej i odpowiedzi cytokinowej makrofagów. Wysoką ekspresję JMJD6 zaobserwowano w sercu, nerkach i mięśniach szkieletowych. Średnią lub niską ekspresję zaobserwowano w mózgu, wątrobie, płucach, jajnikach, trzustce, łożysku, prostacie, jądrach, grasicy i śledzionie.
Wszystkie przeciwciała ChIPAb+ są indywidualnie walidowane pod kątem wytrącania chromatyny, w każdej partii, za każdym razem. Każdy zestaw przeciwciał ChIPAb+ zawiera startery kontrolne (testowane co partię za pomocą qPCR) w celu biologicznej walidacji wyników IP w kontekście specyficznym dla locus. Protokół qPCR i sekwencje starterów są dostarczane, umożliwiając badaczom walidację protokołów ChIP przy użyciu naszego przeciwciała w kontekście chromatyny. Każdy zestaw zawiera również ujemne przeciwciało kontrolne, aby zapewnić specyficzność reakcji ChIP.
Zestaw ChIPAb+JMJD1C zawiera przeciwciało JMJD1C, normalną króliczą IgG i startery kontrolne, które amplifikują region 110 bp starterów ChIP, ludzkiej β-globiny. JMJD1C i kontrole ujemne są dostarczane w skalowalnym rozmiarze reakcji "na ChIP" i mogą być stosowane do funkcjonalnej walidacji wytrącania chromatyny związanej z JMJD1C.

Specyficzność

To przeciwciało rozpoznaje JMJD6.

Immunogen

Liniowy peptyd odpowiadający ludzkiemu JMJD6.

Zastosowanie

Immunoprecypitacja chromatyny:
Reprezentatywne dane partii.
Sonikowaną chromatynę przygotowaną z komórek HeLa (1 X 10E6 równoważników komórek na IP) poddano immunoprecypitacji chromatyny przy użyciu 1,4 µg normalnej króliczej IgG lub anty-JMJD6 i zestawu Magna ChIP A (nr kat. 17-610). Pomyślną immunoprecypitację fragmentów DNA związanych z JMJD6 zweryfikowano za pomocą qPCR przy użyciu starterów ChIP, ludzkiej β-globiny jako locus pozytywnego i starterów promotora β-aktyny jako locus negatywnego. (Rysunek 2). Dane przedstawiono jako procentowy wkład każdej próbki IP w stosunku do chromatyny wejściowej dla każdego amplikonu i próbki ChIP, jak wskazano.
Szczegółowe informacje dotyczące eksperymentu można znaleźć w protokole EZ-Magna ChIP A (nr kat. 17-408) lub EZ-ChIP (nr kat. 17-371).
Analiza Western Blot:
Reprezentatywne dane partii.
Ekstrakt jądrowy HeLa został rozdzielony przez elektroforezę, przeniesiony na membranę PVDF i sondowany anty-JJD6 (1 µg/ml). Białka wizualizowano przy użyciu Donkey Anti-Rabbit IgG sprzężonego z HRP i systemu detekcji chemiluminescencji.
Strzałka wskazuje JMJD6 (~46 kDa). (Rysunek 3).
Analiza immunocytochemiczna:
Reprezentatywne dane partii.
Konfokalna analiza fluorescencyjna komórek A431, HeLa przy użyciu Anti-JMJD6 (czerwony). Filamenty aktyny zostały wyznakowane barwnikiem Alexa Fluor 488.
Phalloidin (zielony). Jądro jest wybarwione DAPI (niebieski). To przeciwciało pozytywnie wybarwia jądro. (Rysunek 4).
Zestaw ChIPAb+ JMJD6 -ChIP Validated Antibody & Primer Set zawiera przeciwciało i specyficzne kontrolne startery PCR.
Research Category
Epigenetics & Nuclear Function
Research Sub Category
Histone Modifying Proteins

Opakowanie

25 testów w zestawie. Zalecane użycie: 1,4 µg (2 µL) przeciwciała na immunoprecypitację chromatyny (w zależności od kontekstu biologicznego).

Jakość

Chromatin Immunoprecipitation:
Representative lot data.
Sonicated chromatin prepared from HeLa cells (1 X 10E6 cell equivalents per IP) were subjected to chromatin immunoprecipitation using 1.4 µg of either Normal Rabbit IgG or Anti-JMJD6 and the Magna ChIP® A Kit (Cat. # 17-610). Successful immunoprecipitation of JMJD6 associated DNA fragments was verified by qPCR using ChIP Primers, human β-globin (Figure 1).
Please refer to the EZ-Magna ChIP A (Cat. # 17-408) or EZ-ChIP (Cat. # 17-371) protocol for experimental details.

Opis wartości docelowych

Zaobserwowano ~46 kDa. Niescharakteryzowane pasmo krzyżowe obserwowane poniżej docelowego pasma 46 kDa w niektórych lizatach.

Postać fizyczna

Anty-JMD6 (króliczy poliklonalny). Jedna fiolka zawierająca 50 µL oczyszczonego poliklonalnego królika w buforze zawierającym 0,1 M Tris-Glicyny (pH 7,4), 150 mM NaCl i 0,05% azydku sodu przed dodaniem glicerolu do 30%. Przechowywać w temperaturze -20°C.
Stężenie: 0,7 mg/ml
Normalne królicze IgG. Jedna fiolka zawierająca 125 µg króliczych IgG w 125 µl buforu do przechowywania zawierającego 0,05% azydku sodu. Przechowywać w temperaturze -20°C.
Primery ChIP, ludzka β-globina. Jedna fiolka zawierająca 75 μL każdego primera (5 μM) specyficznego dla ludzkiego promotora β-globiny. Przechowywać w temperaturze -20°C.
FOR: AGG ACA GGT ACG GCT GTC ATC
REV: TTT ATG CCC AGC CCT GGC TC
Affinity purified

Przechowywanie i stabilność

Przechowywać przez 1 rok w temperaturze -20°C od daty otrzymania. Zalecenia dotyczące postępowania: Po pierwszym rozmrożeniu, a przed zdjęciem korka, odwirować fiolkę i delikatnie wymieszać roztwór. Rozdzielić do probówek mikrowirówkowych i przechowywać w temperaturze -20°C. Unikać powtarzających się cykli zamrażania/rozmrażania, które mogą uszkodzić IgG i wpłynąć na działanie produktu.
Uwaga: Zmienność temperatur w zamrażarce poniżej -20°C może powodować zamarzanie roztworów zawierających glicerol podczas przechowywania.

Komentarz do analizy

Kontrola
Zawiera normalną króliczą IgG i startery specyficzne dla ludzkiej β-globiny.

Inne uwagi

Stężenie: Stężenie specyficzne dla danej partii można znaleźć w certyfikacie analizy.

Informacje prawne

MAGNA CHIP is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

Oświadczenie o zrzeczeniu się odpowiedzialności

Unless otherwise stated in our catalog or other company documentation accompanying the product(s), our products are intended for research use only and are not to be used for any other purpose, which includes but is not limited to, unauthorized commercial uses, in vitro diagnostic uses, ex vivo or in vivo therapeutic uses or any type of consumption or application to humans or animals.
Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.

Kod klasy składowania

12 - Non Combustible Liquids

Temperatura zapłonu (°F)

Not applicable

Temperatura zapłonu (°C)

Not applicable


Certyfikaty analizy (CoA)

Poszukaj Certyfikaty analizy (CoA), wpisując numer partii/serii produktów. Numery serii i partii można znaleźć na etykiecie produktu po słowach „seria” lub „partia”.

Masz już ten produkt?

Dokumenty związane z niedawno zakupionymi produktami zostały zamieszczone w Bibliotece dokumentów.

Odwiedź Bibliotekę dokumentów

Nasz zespół naukowców ma doświadczenie we wszystkich obszarach badań, w tym w naukach przyrodniczych, materiałoznawstwie, syntezie chemicznej, chromatografii, analityce i wielu innych dziedzinach.

Skontaktuj się z zespołem ds. pomocy technicznej