콘텐츠로 건너뛰기
Merck
  • Retrospective cell lineage reconstruction in humans by using short tandem repeats.

Retrospective cell lineage reconstruction in humans by using short tandem repeats.

Cell reports methods (2021-08-04)
Liming Tao, Ofir Raz, Zipora Marx, Manjusha S Ghosh, Sandra Huber, Julia Greindl-Junghans, Tamir Biezuner, Shiran Amir, Lilach Milo, Rivka Adar, Ron Levy, Amos Onn, Noa Chapal-Ilani, Veronika Berman, Asaf Ben Arie, Guy Rom, Barak Oron, Ruth Halaban, Zbigniew T Czyz, Melanie Werner-Klein, Christoph A Klein, Ehud Shapiro
초록

Cell lineage analysis aims to uncover the developmental history of an organism back to its cell of origin. Recently, novel in vivo methods utilizing genome editing enabled important insights into the cell lineages of animals. In contrast, human cell lineage remains restricted to retrospective approaches, which still lack resolution and cost-efficient solutions. Here, we demonstrate a scalable platform based on short tandem repeats targeted by duplex molecular inversion probes. With this human cell lineage tracing method, we accurately reproduced a known lineage of DU145 cells and reconstructed lineages of healthy and metastatic single cells from a melanoma patient who matched the anatomical reference while adding further refinements. This platform allowed us to faithfully recapitulate lineages of developmental tissue formation in healthy cells. In summary, our lineage discovery platform can profile informative somatic mutations efficiently and provides solid lineage reconstructions even in challenging low-mutation-rate healthy single cells.

MATERIALS
제품 번호
브랜드
제품 설명

Sigma-Aldrich
Ethylene glycol-bis(2-aminoethylether)-N,N,N′,N′-tetraacetic acid, for molecular biology, ≥97.0%
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Phenylmethanesulfonyl fluoride, ≥98.5% (GC)
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
DL-Dithiothreitol, ≥98% (HPLC), ≥99.0% (titration)
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Potassium chloride, BioXtra, ≥99.0%
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Phenol – chloroform – isoamyl alcohol mixture, BioUltra, for molecular biology, 25:24:1
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Sodium chloride, ACS reagent, ≥99.0%
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
TWEEN® 20, for molecular biology, viscous liquid
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Benzamidine hydrochloride hydrate, ≥99%
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Magnesium chloride hexahydrate, BioXtra, ≥99.0%
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Anti-CD3, T Cell antibody produced in rabbit, whole antiserum
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Sucrose, for molecular biology, ≥99.5% (GC)
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Ammonium persulfate, for molecular biology, suitable for electrophoresis, ≥98%
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Iodoacetamide, ≥99% (NMR), crystalline
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Triton X-100, laboratory grade
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Glycerol, for molecular biology, ≥99.0%
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, ACS reagent, 99.4-100.6%, powder
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00
Millipore
ANTI-FLAG® M2 Affinity Gel, purified immunoglobulin, buffered aqueous glycerol solution
로그인조직 및 계약 가격 보기
SKUVendor SKU팩 크기재고 정보가격수량
4100025-250MG250 mg
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$297.60
4100025-1G1 g
Aldrich 제휴사로부터 7일 내에 출하
US$522.00