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Merck

03353621001

Roche

5′/3′ RACE-Kit, 2. Generation

sufficient for 10 reactions

Anmeldenzur Ansicht organisationsspezifischer und vertraglich vereinbarter Preise


About This Item

UNSPSC-Code:
41106313
NACRES:
NA.55

Verwendung

sufficient for 10 reactions

Qualitätsniveau

Hersteller/Markenname

Roche

Versandbedingung

dry ice

Lagertemp.

−20°C (−15°C to −25°C)

Allgemeine Beschreibung

Die schnelle Amplifikation von cDNA-Enden (RACE) ist eine verbreitete Technik, die zur schnellen Gewinnung von vollständiger cDNA aus teilweise bekannten Sequenzen verwendet wird. Das 5′/3′-RACE-Kit enthält Transcriptor Reverse Transcriptase und rekombinante Terminale Transferase. Transcriptor Reverse Transcriptase transkribiert vollständige cDNA für die hochsensible und schnelle Amplifikation von 5′- oder 3′-cDNA-Fragmenten bis zu 14 kb. Aufgrund ihrer Thermostabilität (bis zu +65 °C) ist sie in Verbindung mit GC-reichen Templates mit hoher Sekundärstruktur einsetzbar. Durch Verwendung von Transcriptor Reverse Transcriptase kann eine hohe Sensibilität erreicht werden, die zu hoch effizienter cDNA-Synthese und zur Erzeugung langer RACE-Produkte führt. Mithilfe von rekombinanter terminaler Transferase wird an das 3′-Ende der cDNA ein homopolymerer A-Tail angehängt. Der Poly(A)+-Tail vermindert die Wahrscheinlichkeit einer unangemessenen Trunkation durch den Oligo(dT)-Anker-Primer und gleicht die im Vergleich zur G/C-Hybridisierung schwächere A/T-Hybridisierung aus. Zudem sind längere Abschnitte von A-Resten erforderlich, damit der Oligo(dT)-Anker-Primer an einer internen Position hybridisieren und das Amplifikationsprodukt trunkieren kann. Tailed-cDNA wird unter Verwendung eines genspezifischen Primers und des Oligo(dT)-Anker-Primers mittels PCR amplifiziert. Die gewonnene cDNA wird weiter durch eine zweite PCR amplifiziert, bei der ein spezifischer Nested-Primer und der PCR-Anker-Primer eingesetzt werden. So können die RACE-Produkte für nachfolgende Studien in einen geeigneten Vektor geklont werden.

Spezifität

Hitzeinaktivierung: Terminale Transferase: 70 °C für 10 Minuten
Transcriptor Reverse Transcriptase: 85 °C für 5 Minuten

Anwendung

5′/3′ RACE Kit, 2. Generation ist geeignet für
  • Struktur- und Expressionsstudien von RNA-Molekülen
  • Herstellung von vollständiger („full-length“) cDNA
  • Isolierung und Charakterisierung von 5′- oder 3′-Enden aus RNA-Botschaften mit niedriger Kopienzahl
  • Erststrang-cDNA-Synthese
  • Amplifikation und weitere Klonierung seltener mRNAs
  • In Verbindung mit Exon-Trapping-Methoden verwenden
  • Produkte der RACE-Reaktion können ohne Klonierung direkt sequenziert werden

Leistungsmerkmale und Vorteile

  • Robuste Leistung: Rekombinante Transcriptor Reverse Transcriptase ermöglicht Prozession durch Regionen mit schwieriger sekundärer RNA-Struktur.
  • Praktisch: Funktions- und Expressionsstudien des 5′ oder 3′-Endes der RNA können mit dem gleichen Kit durchgeführt werden.
  • Zuverlässig: dA-Tailing von cDNA mit rekombinanter terminaler Transferase vermindert die Wahrscheinlichkeit unangemessener Verkürzung (Trunkation).
  • Reproduzierbar: Oligo-dT-Anker-Primer mit Nicht-3′dT gewährleistet die korrekte Bindung an das innere Ende des Poly(A)-Tail.
  • Herstellung langer Fragmente: Erzeugen Sie cDNA mit einer Länge von bis zu 14 kb mit Transcriptor Reverse Transcriptase.
Die Kontrollreaktion schließt die Transkription der Kontroll-RNA in Erststrang-cDNA mit dem Kontrollprimer neo1/rev ein. Die Amplifikation der cDNA wird mit dem Kontrollprimer neo2/rev und neo3/for durchgeführt, um ein 157-bp-PCR-Produkt zu erhalten. Das Tailing der aufgereinigten cDNA erfolgt mit dATP. Die Amplifikation der Tailed-cDNA erfolgt mit Oligo-dT-Anker-Primer und dem Kontrollprimer neo2/rev, um ein 293-bp-PCR-Produkt zu erhalten.

Verpackung

1 Kit mit 12 Komponenten

Sonstige Hinweise

Nur für die Life-Science-Forschung Nicht für den Einsatz in diagnostischen Verfahren vorgesehen.

Nur Kit-Komponenten

Produkt-Nr.
Beschreibung

  • cDNA Synthesis Buffer 5x concentrated

  • Transcriptor Reverse Transcriptase 20 U/μl

  • Deoxynucleotide Mix

  • dATP, pH 7.5 (20 °C)

  • Reaction Buffer 10x concentrated

  • Terminal Transferase, recombinant

  • Control neo-RNA 1 ng/μl

  • Oligo dT-Anchor Primer

  • PCR Anchor Primer

  • Control Primer neo1/rev primer 12.5 μM

  • Control Primer neo2/rev primer 12.5 μM

  • Control Primer neo3/for primer 12.5 μM

Alle anzeigen (12)

Lagerklassenschlüssel

12 - Non Combustible Liquids

WGK

WGK 1

Flammpunkt (°F)

does not flash

Flammpunkt (°C)

does not flash


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Rapid amplification of cDNA ends (RACE)
Yeku O and Frohman MA
Methods in Molecular Biology, 107-122 (2011)
Erdong Cheng et al.
Journal of virology, 86(18), 10173-10185 (2012-07-13)
Hantaviruses, similarly to other negative-strand segmented RNA viruses, initiate the synthesis of translation-competent capped mRNAs by a unique cap-snatching mechanism. Hantavirus nucleocapsid protein (N) binds to host mRNA caps and requires four nucleotides adjacent to the 5' cap for high-affinity
D Chen et al.
BioTechniques, 30(3), 574-580 (2001-03-17)
In determining the terminal sequences of the genomic dsRNAs of rotavirus by 5'-rapid amplification of cDNA ends (5'-RACE), it was found that most of the viral cDNAs contained extra nucleotides at their 5' termini that had not been reported before
Ramesh Choudhari et al.
Molecular and cellular endocrinology, 510, 110819-110819 (2020-04-21)
Recent technical and other advances in genomics provide unique opportunities to improve our understanding of human physiology and disease predisposition through a detailed analysis of gene structure and expression by examining data in public genome and gene-expression repositories. Yet, the
Po-Shuan Huang et al.
Cells, 9(4) (2020-04-17)
Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most common and aggressive human malignancies worldwide. Long non-coding (lnc) RNAs regulate complex cellular functions, such as cell growth, differentiation, metabolism, and metastasis. Although deregulation of lncRNA expression has been detected in HCC

Artikel

In addition to the troubleshooting provided in the product manual, most probably the efficiency of the tailing reaction performed by Terminal Transferase could be impaired. This could occur due to several reasons (which will not only affect the control reaction, but 5′ RACE in general):

Unser Team von Wissenschaftlern verfügt über Erfahrung in allen Forschungsbereichen einschließlich Life Science, Materialwissenschaften, chemischer Synthese, Chromatographie, Analytik und vielen mehr..

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