17-10494
Magna ChIRP®-RNA-Interaktom-Kit
Isolation and characterization of non-coding RNA:chromatin complexes
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About This Item
UNSPSC-Code:
41105331
NACRES:
NA.84
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Qualitätsniveau
Allgemeine Beschreibung
Das Magna ChIRP-RNA-Interaktom-Kit verwendet das ChIRP-Verfahren (Chromatin Isolation by RNA Purification), um die Identifikation und Analyse von Chromatinregionen zu ermöglichen, die mit einer bestimmten Chromatin-assoziierten RNA interagieren. Diese neuartige Anti-Sense-Einfangstrategie auf Sondenbasis verwendet vernetztes Chromatin, um eine nicht verzerrte Entdeckung von RNA-assoziierten DNA-Sequenzen und Proteinen zu ermöglichen. Zur Durchführung von ChIRP werden zwei Pools aus mehreren biotinylierten Oligonukleotidsonden eingesetzt, die zu der RNA von Interesse komplementär sind (siehe Abbildung 1). Diese Sondensets werden mit Chromatin kombiniert und zu Chromatin-assoziierter RNA hybridisiert. Komplexe, die biotinylierte, an die die Chromatin-assoziierte RNA gebundene Sonden enthalten, werden anschließend mit magnetischen Streptavidin-Beads isoliert. DNA oder RNA kann anschließend gewonnen und durch quantitative PCR oder Next-Generation-Sequenzing (ChIRP-seq) analysiert werden. Alternativ kann eine Proteomikanalyse des rückgewonnenen Chromatins durchgeführt werden.
Anwendung
Das Magna ChIRP-RNA-Interaktom-Kit ermöglicht die Analyse und Kartierung von Chromatinregionen, die mit Chromatin-assoziierten RNA interagiert. Basierend auf dem ChIRP-Verfahren (chromatin isolation by RNA purification) ermöglicht dieser sondenbasierte Einfang-Assay die Entdeckung von RNA-assoziierten DNA-Sequenzen und Proteinen.
Verpackung
Kit-Kapazität: 12 Chromatinisolierungen durch RNA-Aufreinigungs-Assays (einschließlich Negativkontrolle-Sonden)
Komponenten
10X-Glycin, Lysepuffer, Hybridisierungspuffer (ohne 15 % Formamid), Waschpuffer, Proteinase K-Puffer (für DNA), Proteinase K-Puffer (für RNA), DNA-Elutionspuffer, 0,5 mol/l EDTA, magnetische Streptavidin-Beads, RNase-Inhibitor, Proteaseinhibitor-Cocktail III, Proteinase K-Lösung, RNase-freie DNase I, DNase I-Reaktionspuffer, RNase A (20 mg/ml), RNase H (10 E/μl), Magna ChIRP-Negativkontrolle-Sondenset (LacZ)
Rechtliche Hinweise
MAGNA CHIRP is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
Haftungsausschluss
Sofern in unserem Katalog oder anderen Begleitdokumenten unserer Produkte nicht anders angegeben, sind unsere Produkte nur für Forschungszwecke vorgesehen und nicht für andere Zwecke zu verwenden, einschließlich, jedoch nicht beschränkt auf unautorisierte kommerzielle Verwendung, zur In-vitro-Diagnostik, für Ex-vivo- oder In-vivo-Therapiezwecke oder jegliche Art der Einnahme oder Anwendung bei Menschen oder Tieren.
Signalwort
Danger
H-Sätze
Gefahreneinstufungen
Eye Irrit. 2 - Resp. Sens. 1
Lagerklassenschlüssel
10 - Combustible liquids
WGK
WGK 3
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