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  • MicroRNA signature characterizes primary tumors that metastasize in an esophageal adenocarcinoma rat model.

MicroRNA signature characterizes primary tumors that metastasize in an esophageal adenocarcinoma rat model.

PloS one (2015-04-01)
Ali H Zaidi, Lindsey T Saldin, Lori A Kelly, Linda Bergal, Ricardo Londono, Juliann E Kosovec, Yoshihiro Komatsu, Pashtoon M Kasi, Amit A Shetty, Timothy J Keane, Shyam J Thakkar, Luai Huleihel, Rodney J Landreneau, Stephen F Badylak, Blair A Jobe
要旨

To establish a miRNA signature for metastasis in an animal model of esophageal adenocarcinoma (EAC). The incidence of esophageal adenocarcinoma (EAC) has dramatically increased and esophageal cancer is now the sixth leading cause of cancer deaths worldwide. Mortality rates remain high among patients with advanced stage disease and esophagectomy is associated with high complication rates. Hence, early identification of potentially metastatic disease would better guide treatment strategies. The modified Levrat's surgery was performed to induce EAC in Sprague-Dawley rats. Primary EAC and distant metastatic sites were confirmed via histology and immunofluorescence. miRNA profiling was performed on primary tumors with or without metastasis. A unique subset of miRNAs expressed in primary tumors and metastases was identified with Ingenuity Pathway Analysis (IPA) along with upstream and downstream targets. miRNA-linked gene expression analysis was performed on a secondary cohort of metastasis positive (n=5) and metastasis negative (n=28) primary tumors. The epithelial origin of distant metastasis was established by IF using villin (VIL1) and mucin 5AC (MUC5AC) antibodies. miRNome analysis identified four down-regulated miRNAs in metastasis positive primary tumors compared to metastasis negative tumors: miR-92a-3p (p=0.0001), miR-141-3p (p=0.0022), miR-451-1a (p=0.0181) and miR133a-3p (p=0.0304). Six target genes identified in the top scoring networks by IPA were validated as significantly, differentially expressed in metastasis positive primary tumors: Ago2, Akt1, Kras, Bcl2L11, CDKN1B and Zeb2. In vivo metastasis was confirmed in the modified Levrat's model. Analysis of the primary tumor identified a distinctive miRNA signature for primary tumors that metastasized.

材料
製品番号
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製品内容

Sigma-Aldrich
2-プロパノール, suitable for HPLC, 99.9%
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在庫状況
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Sigma-Aldrich
2-プロパノール, ACS reagent, ≥99.5%
カタログ番号
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単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, HPLC Plus, for HPLC, GC, and residue analysis, 99.9%
カタログ番号
容量
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単価
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Sigma-Aldrich
DAPI, for nucleic acid staining
カタログ番号
容量
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Sigma-Aldrich
イソプロピルアルコール, meets USP testing specifications
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Sigma-Aldrich
2-プロパノール, puriss. p.a., ACS reagent, reag. ISO, reag. Ph. Eur., ≥99.8% (GC)
カタログ番号
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数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, Laboratory Reagent, ≥99.5%
カタログ番号
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Sigma-Aldrich
Isopropyl alcohol, ≥99.7%, FCC, FG
カタログ番号
容量
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単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, puriss. p.a., ACS reagent, ≥99.8% (GC)
カタログ番号
容量
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単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, BioUltra, for molecular biology, ≥99.5% (GC)
カタログ番号
容量
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単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, electronic grade, 99.999% trace metals basis
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, puriss., meets analytical specification of Ph. Eur., BP, USP, ≥99.5% (GC)
カタログ番号
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在庫状況
単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, JIS special grade, ≥99.5%
カタログ番号
容量
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単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, suitable for HPLC, 99.5%
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
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Sigma-Aldrich
2-プロパノール, anhydrous, 99.5%
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, for molecular biology, BioReagent, ≥99.5%
カタログ番号
容量
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単価
数量
USP
2-プロパノール, United States Pharmacopeia (USP) Reference Standard
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, SAJ first grade, ≥99.0%
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Sigma-Aldrich
2-フェニルインドール, technical grade, 95%
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, ACS reagent, ≥99.5%
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Supelco
2-プロパノール, analytical standard
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Supelco
2-プロパノール, Pharmaceutical Secondary Standard; Certified Reference Material
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, suitable for HPLC
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, ACS reagent, ≥99.5%
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量
Sigma-Aldrich
2-プロパノール, HPLC Plus, for HPLC, GC, and residue analysis, 99.9%, poly coated bottles
カタログ番号
容量
在庫状況
単価
数量