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Merck

SMAI-RO

Roche

Sma I

from Serratia marcescens Sb

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About This Item

UNSPSCコード:
12352204

由来生物

Serratia marcescens

品質水準

形状

solution

比活性

10000 U/mL

包装

pkg of 1,000 U (10220566001 [10 U/μl])
pkg of 5,000 U (10656348001 [10 U/μl])
pkg of 5,000 U (11047639001 [40 U/μl])

メーカー/製品名

Roche

濃度

<0.1 % (w/w)

パラメーター

25 °C optimum reaction temp.

テクニック

electrophoresis: suitable

colorless

pH

7.0 (39 °F)

溶解性

water: miscible

適合性

suitable for molecular biology

アプリケーション

life science and biopharma

その他の活性

Endonucleases, none detected (up to 20 U with lambda-DNA)
Endonucleases, none detected (up to 20U with pBR 322-DNA )

輸送温度

dry ice

保管温度

−20°C

関連するカテゴリー

詳細

Sma Iは、配列*C°C*C↓GGGを認識し、平滑末端を持つ断片を産生します。

特異性

認識部位:*C °C*CGGG
*C °C*CGGG
制限部位:*C °C*C↓GGG
*C °C*C↓GGG
熱失活:Sma Iは、65°Cで15分間インキュベートすることで不活性化されます(100 U/μg DNAまで試験済み)。

アプリケーション

Sma Iはマクロ制限分析で使用されています。また、制限消化、アミド高速パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)における制限酵素混合物にも使用されています。

品質

非特異的エンドヌクレアーゼ活性がない
1 μgのλDNAを50 μLのSuRE/CutバッファーA中、過剰のSma Iを添加して16時間インキュベートします。酵素の単位数が酵素による特有の制限パターンに影響を与えないことは分析証明書に示されています。

エキソヌクレアーゼ活性がない
約5 μgの[3H]標識した仔牛胸腺DNAを3 μLのSma Iを用いて総容量100 μL中50 mM Tris-HCl、10 mM MgCl2、1 mMジチオエリスリトール、pH 約7.5において、+37°Cで4時間インキュベートします。本条件下で、分析証明書に示されているように、放射能の放出は検出されていません。

DNAプロファイル

各種DNAにおける切断部位数
  • λ:3
  • φX174:0
  • Ad2:12
  • M13mp7:0
  • pBR322:0
  • pBR328:0
  • pUC18:1
  • SV40:0

単位の定義

1ユニットは、総量25 μL(1×)のSuRE/CutバッファーAにおいて+25°C、1時間で1 μgのλDNAを完全に切断する酵素活性です。

保管および安定性

−25°C以下で保存しないこと

アナリシスノート

Compatible ends(共通な末端)
Sma Iは平滑末端と共通の末端を生成します。

アイソシゾマー

本酵素はCfr9 I、PspA I、Xma IおよびXmaC Iのアイソシゾマーです。

メチル化感受性
Sma Iは認識配列の3つのC残基の中央(°)で5-メチルシトシンによる阻害を受けませんが、他のC(*)で5-メチルシトシンにより、または認識配列(*C°C*C↓GGG)中の任意の位置で4-メチルシトシンにより活性が阻害されます。

インキュベーション温度
+25°C

PFGE試験済み
Sma Iはパルスフィールドゲル電気泳動(細菌の染色体)でテストされています。PFGE分析のためにアガロースに埋め込んだゲノムDNA(E. coli C 600)の切断については、酵素10 U/μg DNAおよび4時間のインキュベーションを推奨します。

Ligation and recutting(ライゲーション‐再切断)検定

1μgのλDNAを完全に消化して得られたSma I断片を、1 UのT4 DNAリガーゼを用いて10 μL中、66 mM Tris-HCI、5 mM MgCl2、5 mM ジチオエリスリトール、1 mM ATP、pH 7.5(+20°C時)において+25°C、16時間インキュベートした結果、1μgのλDNA断片の>80%が回収されます。
引き続きSma Iで再切断を行うと>80%のλDNA × Sma I断片の典型的なパターンが得られます。
SuRE/Cutバッファーシステム
至適な活性のために太字で示されたバッファーを推奨します。
  • A:100%
  • B:0~10%
  • H:0~10%
  • L:0~10%
  • M:0~10%

PCRバッファー中の活性:100%

PCR mix(Taq DNAポリメラーゼバッファー)中の相対活性は100%です。PCR mixはλDNA、プライマー、10 mM Tris-HCl(pH 8.3、20°C)、50 mM KCl、1.5 mM MgCl2、200 μM dNTP、2.5 U Taq DNAポリメラーゼを含みます。混合液は25サイクルの増幅反応にかけられました。PwoSuperYield DNAポリメラーゼPCR Mixの反応バッファー中の活性は100%です。GCリッチ溶液を追加しても活性は100%を維持します。Pwo SuperYield DNAポリメラーゼPCR Mixは米国では入手できません。

その他情報

ライフサイエンス研究専用。診断目的での使用はできません。

キットの構成要素のみ

製品番号
詳細

  • Enzyme Solution

  • SuRE/Cut Buffer A 10x concentrated

保管分類コード

12 - Non Combustible Liquids

WGK

WGK 1

引火点(°F)

does not flash

引火点(℃)

does not flash


試験成績書(COA)

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Corinna Kehrenberg et al.
Antimicrobial agents and chemotherapy, 51(2), 483-487 (2006-12-06)
During a study of florfenicol-resistant porcine staphylococci from Denmark, the genes cfr and fexA were detected in the chromosomal DNA or on plasmids of Staphylococcus hyicus, Staphylococcus warneri, and Staphylococcus simulans. A novel variant of the phenicol resistance transposon Tn558
E M Ribot et al.
Journal of clinical microbiology, 39(5), 1889-1894 (2001-04-28)
We developed a rapid pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) protocol for subtyping Campylobacter isolates based on the standardized protocols used by PulseNet laboratories for the subtyping of other food-borne bacterial pathogens. Various combinations of buffers, reagents, reaction conditions (e.g., cell suspension

資料

The term “Restriction enzyme” originated from the studies of Enterobacteria phage λ (lambda phage) in the laboratories of Werner Arber and Matthew Meselson.

「制限酵素」という用語は、ヴェルナー・アーバーとマシュー・メセルソンの研究所で行われた腸内細菌ファージλ(ラムダファージ)の研究に由来しています。

関連コンテンツ

Restriction endonucleases in prokaryotes function primarily to protect against foreign genetic material, notably bacteriophage DNA.

ライフサイエンス、有機合成、材料科学、クロマトグラフィー、分析など、あらゆる分野の研究に経験のあるメンバーがおります。.

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