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D5025

Sigma-Aldrich

Désoxyribonucléase I from bovine pancreas

Type IV, lyophilized powder, ≥2,000 Kunitz units/mg protein

Synonyme(s) :

DNase I, Désoxyribonucléate-5′-oligonucléotido-hydrolase

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About This Item

Numéro CAS:
Numéro de classification (Commission des enzymes):
Numéro CE :
Numéro MDL:
Code UNSPSC :
12352204
Nomenclature NACRES :
NA.54

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Source biologique

bovine pancreas

Niveau de qualité

Type

Type IV

Forme

lyophilized powder

Activité spécifique

≥2,000 Kunitz units/mg protein

Poids mol.

~31 kDa

Produit purifié par

chromatography

Composition

Protein, ≥80%

Technique(s)

DNA purification: suitable

Solubilité

0.15 M NaCl: soluble 5.0 mg/mL, clear, colorless

Adéquation

suitable for molecular biology

Application(s)

diagnostic assay manufacturing
diagnostic assay manufacturing

Activité étrangère

Chymotrypsin ≤0.5%
Protease ≤0.05%
RNase ≤0.02%

Conditions d'expédition

wet ice

Température de stockage

−20°C

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Application

La DNase I est utilisée en première étape pour couper l′ADN en vue de l′incorporation de bases marquées dans l′ADN. L′enzyme proposée par Sigma a été utilisée pour le traitement de tissus de cerveaux de rat. Cette étude a montré que la croissance axonale sur les astrocytes n′est pas inhibée par les oligodendrocytes.[1] Dans une autre étude, des échantillons fixés et décongelés d′E. coli ont été digérés avec la DNase I de Sigma avec d′autres enzymes. La digestion a été réalisée avant la perméabilisation et la coloration des acides nucléiques.[2]
La désoxyribonucléase I de pancréas de bovin a été utilisée dans une étude pour l′analyse des nucléases de Bacillus subtilis par zymogramme à deux dimensions. La désoxyribonucléase I de pancréas de bovin a également été utilisée dans une étude évaluant l′effet d′agents se liant dans le petit sillon ou le gros sillon de l′ADN et d′agents intercalants sur l′association avec l′ADN des protéines RecA et désoxyribonucléase I, qui se lient dans le petit sillon.
Produit utilisé pour éliminer l'ADN présent dans les échantillons de protéines.

Actions biochimiques/physiologiques

La DNase I est une endonucléase qui agit sur les liaisons phosphodiester situées à côté de pyrimidines et produit des polynucléotides comportant des 5′-phosphates terminaux. En présence de Mg2+, la DNase I clive indépendamment chaque brin d′ADN et les sites de clivage sont répartis au hasard. Les deux brins d′ADN sont clivés à peu près au niveau du même site en présence de Mn2+.[3] Il a été montré que le pH optimal se situe entre 7 et 8. Les cations divalents tels que Mn2+, Ca2+, Co2+ et Zn2+ activent l′enzyme.[4] Une concentration de Ca2+ 5 mM permet de stabiliser l′enzyme vis-à-vis de la digestion protéolytique. La DNase 1 de pancréas de bovin est composée de quatre éléments A, B, C et D, pouvant être distingués par chromatographie, dans des rapports molaires respectifs pour A, B et C de 4/1/1. D est présent en quantités très faibles.[5] Le 2-mercaptoéthanol, les chélateurs, le dodécylsulfate de sodium (SDS)[6] et l′actine[7] sont connus pour inhiber l′activité enzymatique.

Définition de l'unité

Une unité Kunitz produit une ΔA260 de 0,001 par minute et par ml à pH 5,0 et 25 °C, en utilisant comme substrat de l′ADN de type I ou III.

Forme physique

Poudre lyophilisée contenant du chlorure de calcium

Notes préparatoires

Une solution de DNase I à 10 mg/ml dans du NaCl 0,15 M peut perdre < 10 % de son activité lorsqu′elle est conservée une semaine en aliquotes à −20 °C. La perte d′activité peut être d′environ 20 % si la même solution est conservée en aliquotes entre 2 et 8 °C. Elle reste active jusqu′à cinq heures à 60 °C entre pH 5 et pH 7, et devient inactive après < 10 minutes à 68 °C. Sa perte d′activité est de 6 %/heure dans un tampon d′acétate (pH 5,0) ou un tampon Tris (pH 7,2) à une concentration de 1 mg/ml.

Remarque sur l'analyse

Protéine déterminée par la réaction du biuret.

Pictogrammes

Health hazard

Mention d'avertissement

Danger

Mentions de danger

Conseils de prudence

Classification des risques

Resp. Sens. 1

Code de la classe de stockage

11 - Combustible Solids

Classe de danger pour l'eau (WGK)

WGK 3

Point d'éclair (°F)

Not applicable

Point d'éclair (°C)

Not applicable


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T Guindulain et al.
Applied and environmental microbiology, 63(11), 4608-4611 (1997-11-15)
Three nucleic acid dyes (SYTO-13, TOTO-1, and YOYO-1) were tested on cultures of Escherichia coli and marine prokaryote populations. These dyes stain the RNA and DNA in E. coli but only respond to DNA in marine populations, according to the
J W Fawcett et al.
Journal of cell science, 103 ( Pt 2), 571-579 (1992-10-01)
Axon growth in vitro may be inhibited by contact with oligodendrocytes, but most axons grow readily on the surface of astrocyte monolayers. Since both cell types are in close contact with one another in the damaged nervous system, we have
Enzymes of Molecular Biology
Weir, A. F.
Methods in Molecular Biology, 16 (1993)
Chii J Chan et al.
Biophysical journal, 112(6), 1063-1076 (2017-03-30)
Understanding the physical mechanisms governing nuclear mechanics is important as it can impact gene expression and development. However, how cell nuclei respond to external cues such as heat is not well understood. Here, we studied the material properties of isolated
Miriam Landfors et al.
Cell discovery, 3, 17013-17013 (2017-05-23)
Sertoli cells have dual roles during the cells' lifetime. In the juvenile mammal, Sertoli cells proliferate and create the structure of the testis, and during puberty they cease to proliferate and take on the adult role of supporting germ cells

Protocoles

To standardize a procedure for the enzymatic assay of Deoxyribonuclease I.

Questions

1–8 of 8 Questions  
  1. Good afternoon, if the stock concentration of 10mg/ml may loose 10% of its activity after one week, I was wondering if it is okey regarding stability to keep 500ug/ml aliquots at -20ºC for several weeks.

    1 answer
    1. As cited in the product listing and datasheet, this product in solution shows an approximate loss of activity of 10% when stored in aliquots at −20 °C for 1 week. Studies at lower dilutions have not been performed. Typically, solutions stored at higher concentrations are the most stable.

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  2. Is Kunitz unit same as unit here? I have seen some papers and they have U/ml for DNase. How can i conver it?

    1 answer
    1. Product D5025, Deoxyribonuclease I is given in Kunitz units. This product is a powder. When reconstituting the product with a solution, for example 15,000 Kunitz units in 1 ml of 0.15 M NaCl the end-user will have 15,000 Kunitz units/ml.

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  3. What concentration of Product D5025, Deoxyribonuclease I (DNase I),  is required to remove DNA from solutions?

    1 answer
    1. DNA can be removed from preparations by incubation with 20 - 50 ug DNAse I in the presence of 50 mM Tris-HCl buffer, pH 7.5, 10 mM magnesium chloride, at 37°C. for 60 min.

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  4. What is the Department of Transportation shipping information for this product?

    1 answer
    1. Transportation information can be found in Section 14 of the product's (M)SDS.To access the shipping information for this material, use the link on the product detail page for the product.

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  5. How should I prepare a solution of Product D5025, DNAse I?

    1 answer
    1. This enzyme can be reconstituted in 0.15 M NaCl at a concentration of 10 mg/ml.

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  6. How do Deoxyribonuclease I (DNase I), products D5025 and D4527  differ from each other?

    1 answer
    1. Both of these products have the same specific activity (>2000 units/mg protein) for Dnase I. The enzyme impurity levels for each, however, are different. D5025 has the following impurity specification: Chymotrypsin (<0.5%), Protease (<0.05%), and RNase (<0.02%). The impurity specifications for D4527 are: Chymotrypsin (<0.01%), Protease (<0.005%), and RNase (<0.01%).

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  7. Are stock solutions of Product D5025, Deoxyribonuclease I (DNase I), stable?

    1 answer
    1. Solutions of DNAse I (10 mg/ml) in 0.15 M NaCl may lose 10% of its activity when stored for a week in aliquots at -20°C. The same solutions stored in aliquots at 2 - 8°C. lose approximately 20% activity.

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  8. How can I convert units of Product D5025, Deoxyribonuclease I (DNase I), to mass?

    1 answer
    1. The mg of solid for each unit package size will be indicated on the label of the package. For a particular lot, you can calculate the specific activity in units per mg solid by multiplying the specific activity in units per mg protein by the percent protein divided by 100.

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