Doppelt markierte Sonden

• Zu den Vorteilen der Verwendung doppelt markierter Sonden gehören:
• Funktion doppelt markierter Sonden
• Tabelle der spektralen Eigenschaften
• Versandzeitplan
• Zugehörige Produkte

Doppelt markierte Sonden sind der in der qPCR am häufigsten eingesetzte Sondentyp. Sie werden oft als Hydrolysesonden bezeichnet.

Doppelt markierte Sonden werden empfohlen für:

• Microarray-Validierungen
• Mehrere Zielgene / niedrige Probenanzahl
• Pathogennachweis
• Multiplexing
• Quantifizierung der Viruslast
• Genexpressionsanalyse
• Bestimmung der Genkopien

Ideal für die Validierung von MISSION^® siRNA- und shRNA-Knockdowns.

Zu den Vorteilen der Verwendung doppelt markierter Sonden gehören:

• Einfaches Design für Sequenzspezifität
  
• Umfassende Verfügbarkeit von Kombinationen aus Reporter/Quencher
  
• Erhöhte Empfindlichkeit

Fügen Sie Ihrer Sonde verbrückte Nukleinsäure hinzu:

• Erhöhte thermische Stabilität und Hybridisierungsspezifität
• Höhere Genauigkeit beim SNP-Nachweis, bei der allelischen Diskriminierung und bei In-vitro-Quantifizierung bzw. -Nachweis
• Einfachere und empfindlichere Sondendesigns für problematische Zielsequenzen 

Funktion doppelt markierter Sonden

Eine doppelt markierte Sonde ist ein einzelsträngiges Oligonukleotid, das mit zwei verschiedenen Farbstoffen markiert ist. Am 5'-Ende befindet sich ein Reporterfarbstoff und am 3'-Ende ein Quencher-Molekül. Das Quencher-Molekül hemmt die natürliche Fluoreszenzemission des Reporters durch Fluoreszenzresonanzenergietransfer (FRET). In der nachstehenden Abbildung ist der Mechanismus dargestellt. 

Der Primer wird durch die Polymerase verlängert und die Sonde bindet an das spezifische DNA-Template. Durch die Hydrolyse wird der Reporter aus dem Sonden-/Ziel-Hybrid freigesetzt, was zu einem Anstieg der Fluoreszenz führt. Das gemessene Fluoreszenzsignal ist direkt proportional zur Menge der Ziel-DNA.

Zu den Produktmerkmalen gehören:

• Mengen: 1, 3, 5 und 10 OD
• Aufreinigung: HPLC
• Sequenzlängen: 15 - 40 Basen
• Qualitätskontrolle: 100 % Massenspektrometrie
• Format: Lieferung trocken in Braunglasröhrchen
• Benutzerdefinierte Formate verfügbar (Normalisierung, spezielle Platten usw.)

Unsere Sonden werden in einem Format angeboten, das Ihre Versuchsplanung vereinfacht.

Garantierte Ausbeuten

*Die Schätzung basiert auf 4 nmol oder 32 µg für 1 OD und 200 nM in 25 µl-Reaktion (5,0 pmol/Reaktion). Die Schätzung basiert auf einer durchschnittlichen Sequenzlänge von 25 Basen.

Garantierte OD-Ausbeute	Ungefähre Anzahl nmol	Ungefähre Anzahl µg	Ungefähre Anzahl Reaktionen*
1	4	32	800
3	12	96	2.400
5	20	160	4.000
10	40	320	8.000

Tabelle der spektralen Eigenschaften

Farbstoff	Max. EX (nm)	Max. EM (nm)	Kompatibler Quencher
6-FAM™	495	520	BHQ™-1, TAMRA™
JOE™	529	555	BHQ™-1, TAMRA™
TET™	521	536	BHQ™-1, TAMRA™
Cal Fluor® Gold 5401	522	544	BHQ™-1
HEX™2	535	556	BHQ™-1, TAMRA™
Cal Fluor® Orange 5602	538	559	BHQ™-1
TAMRA™	557	583	BHQ™-2
Cyanin 3	549	566	BHQ™-2
Quasar® 5703	548	566	BHQ™-2
Cal Fluor® Rot 5904	569	591	BHQ™-2
ROX™	586	610	BHQ™-2
TxRd (Sulforhodamin 101-X)	597	616	BHQ™-2
Cyanin 5	646	669	BHQ™-3
Quasar® 6705	647	670	BHQ™-3
Cyanin 5.5	675	694	BHQ™-3

¹JOE/TET-Alternative
²VIC^® Alternative
³Cyanin 3-Alternative
⁴TAMRA™ Alternative
⁵Cyanin 5-Alternative

Versandzeitplan

*Die Lieferzeiten können sich aufgrund von internationalem Transit, Verzögerungen bei der Zollabfertigung usw. verlängern. Für große Projekte wird ein Lieferplan erstellt, der sich nach den Projektanforderungen richtet.

Menge (OD)	1	3	5	10
Doppelt markierte Sonden mit Standardfarbstoffen	3-5 Tage	3-5 Tage	3-5 Tage	3-5 Tage
Doppelt markierte Sonden mit verbrückter Nukleinsäure mit Standardfarbstoffen	7 Tage	7 Tage	7 Tage	7 Tage
Doppelt markierte Sonden mit Post-Synthese-Farbstoffen, mit/ohne verbrückte Nukleinsäure	7-10 Tage	7-10 Tage	7-10 Tage	7-10 Tage

Zugehörige Produkte