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21966

Sigma-Aldrich

5(6)-Carboxy-X-rhodamine N-succinimidyl ester

BioReagent, suitable for fluorescence

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About This Item

Fórmula empírica (Notação de Hill):
C37H33N3O7
Número CAS:
114616-32-9
Peso molecular:
631.67
Código UNSPSC:
12352200
ID de substância PubChem:
329752229

linha de produto

BioReagent

solubilidade

DMF: soluble
acetonitrile: soluble

fluorescência

λex 575 nm; λem 605 nm in 0.1 M phosphate pH 7.0

adequação

suitable for fluorescence

temperatura de armazenamento

−20°C

cadeia de caracteres SMILES

O=C1CCC(=O)N1OC(=O)c2ccc3c(c2)C(=O)OC34c5cc6CCCN7CCCc(c5Oc8c9CCCN%10CCCc(cc48)c9%10)c67.O=C%11CCC(=O)N%11OC(=O)c%12ccc%13C(=O)OC%14(c%15cc%16CCCN%17CCCc(c%15Oc%18c%19CCCN%20CCCc(cc%14%18)c%19%20)c%16%17)c%13c%12

InChI

1S/2C37H33N3O7/c41-29-11-12-30(42)40(29)47-35(43)22-9-10-26-25(17-22)36(44)46-37(26)27-18-20-5-1-13-38-15-3-7-23(31(20)38)33(27)45-34-24-8-4-16-39-14-2-6-21(32(24)39)19-28(34)37;41-29-11-12-30(42)40(29)47-35(43)22-9-10-23-26(19-22)37(46-36(23)44)27-17-20-5-1-13-38-15-3-7-24(31(20)38)33(27)45-34-25-8-4-16-39-14-2-6-21(32(25)39)18-28(34)37/h2*9-10,17-19H,1-8,11-16H2

chave InChI

YEWCZAUCUAYJIO-UHFFFAOYSA-N

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Aplicação

5(6)-Carboxy-X-rhodamine N-succinimidyl ester may used as a labeling reagent to attach the fluorophore 5(6)-carboxy-X-rhodamine to target molecules such as nucleic acids. 5(6)-Carboxy-X-rhodamine labeled molecules may be used in fluorescence energy transfer (FRET) applications.

Pictogramas

Exclamation mark
GHS07

Palavra indicadora

Warning

Frases de perigo

H315,H319,H335

Classificações de perigo

Eye Irrit. 2 - Skin Irrit. 2 - STOT SE 3

Órgãos-alvo

Respiratory system

Código de classe de armazenamento

11 - Combustible Solids

Classe de risco de água (WGK)

WGK 3

Ponto de fulgor (°F)

Not applicable

Ponto de fulgor (°C)

Not applicable

Equipamento de proteção individual

dust mask type N95 (US), Eyeshields, Gloves

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S C Hung et al.
Analytical biochemistry, 255(1), 32-38 (1998-02-04)
Fluorescence energy transfer (ET) primers are far superior to single dye-labeled primers as labels for DNA sequencing and polymerase chain reaction amplification. We compare here ET primers with different donor and acceptor dye combinations with respect to the relative acceptor
S C Hung et al.
Analytical biochemistry, 252(1), 78-88 (1997-11-05)
We have synthesized and characterized the spectroscopic properties of 56 energy transfer (ET) fluorescent dye-labeled primers differing in (i) the spacing between the donor and acceptor, (ii) the nature of the spacer (either oligonucleotide or polydideoxyribose phosphate), (iii) the primer
Tae Seok Seo et al.
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We report four-color DNA sequencing by synthesis (SBS) on a chip, using four photocleavable fluorescent nucleotide analogues (dGTP-PC-Bodipy-FL-510, dUTP-PC-R6G, dATP-PC-ROX, and dCTP-PC-Bodipy-650) (PC, photocleavable; Bodipy, 4,4-difluoro-4-bora-3alpha,4alpha-diaza-s-indacene; ROX, 6-carboxy-X-rhodamine; R6G, 6-carboxyrhodamine-6G). Each nucleotide analogue consists of a different fluorophore attached to
Hailong Li et al.
Biosensors & bioelectronics, 27(1), 167-171 (2011-07-26)
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