U211140

DMT-2′O-Methyl-rU Phosphoramidit

configured for MerMade

• Synonym(e): 5′-O-[Bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-O-methyl-uridin, 3′-[2-Cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidit], DMT-2′O-Methyl-rU Amidit
• Empirische Formel (Hill-System): C₄₀H₄₉N₄O₉P
• CAS-Nummer: 110764-79-9
• Molekulargewicht: 760.81
• UNSPSC Code: 41116105
• NACRES: NA.51
• MDL number: MFCD00792626
• Assay: ≥99% (³¹P-NMR), ≥99.0% (reversed phase HPLC)
• Biological source: non-animal source (no BSE/TSE risk)
• Form: powder
• Storage temp.: -10 to -25°C

Eigenschaften

• biological source: non-animal source (no BSE/TSE risk)
• Quality Segment: 300
• product line: Proligo Reagents
• assay: ≥99% (³¹P-NMR), ≥99.0% (reversed phase HPLC)
• form: powder
• mol wt: 760.81 g/mol
• impurities: ≤0.3% mU2 (reversed phase HPLC, Hydrolysate), ≤0.3% mU3 (reversed phase HPLC, DMT-rme), ≤0.3% water content (Karl Fischer), ≤0.5% P(III) Impurities 100-169ppm (³¹P-NMR), ≤0.5% single Impurity (redox titration), ≤1.0% mU1 (reversed phase HPLC, DMT-rUme-DMT), ≤3% residual Solvent content
• color: white to off-white
• suitability: conforms to structure for H-NMR, conforms to structure for LC-MS
• compatibility: configured for MerMade
• storage temp.: -10 to -25°C
• SMILES string: CO[C@@H]1[C@H](OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)[C@@H](COC(c2ccccc2)(c3ccc(OC)cc3)c4ccc(OC)cc4)O[C@H]1N5C=CC(=O)NC5=O
• InChI: 1S/C40H49N4O9P/c1-27(2)44(28(3)4)54(51-25-11-23-41)53-36-34(52-38(37(36)49-7)43-24-22-35(45)42-39(43)46)26-50-40(29-12-9-8-10-13-29,30-14-18-32(47-5)19-15-30)31-16-20-33(48-6)21-17-31/h8-10,12-22,24,27-28,34,36-38H,11,25-26H2,1-7H3,(H,42,45,46)/t34-,36-,37-,38-,54?/m1/s1
• InChI key: UVUOJOLPNDCIHL-XKZJCBTISA-N

Beschreibung

General description

DMT-2′-O-Methyl-rU-Phosphoramidit gehört zur Klasse der 2′-O-Methyl-RNA-Phosphoramidite. Zu seinen Hauptmerkmalen zählen:

• Hohe Ausbeute von rohen Oligonukleotiden, die mit der DNA-Synthese kompatibel sind
• Kann gemeinsam mit DNA- oder RNA-Phosphoramiditen in derselben Synthese eingesetzt werden, um Mixmer-Oligonukleotide zu erhalten
• Empfohlene Entschützungsbedingungen sind 8 Stunden bei 55 °C mit konzentrierter Ammoniaklösung oder 10 Minuten bei 65 °C mit AMA (konzentrierter Ammoniak/40%iges wässriges Methylamin I/I, v/v)
• Aufreinigung und andere nachgelagerte Verarbeitungsschritte von vollständig modifizierten 2′-O-Methyl-RNA-Oligonukleotiden sind einfacher als im Falle von RNA und es sind keine speziellen Vorsichtsmaßnahmen für den Schutz vor nukleolytischem Abbau erforderlich
• Die Synthese von 2′-O-Methyl-RNA-Oligonukleotiden ähnelt der gängigen DNA-Synthese, erfordert jedoch eine längere Kupplungsdauer (es werden 6 Minuten empfohlen; 90 Sekunden für DNA-Monomere)
• 2′-O-Methyl-RNA-Phosphoramidite sind auch mit schneller Entschützungschemie erhältlich

Application

2′-O-Methyl-RNA-Nukleosid, einschließlich DMT-2′-O-Methyl-rU-Phosphoramidit, kann vorteilhaft in Nukleinsäuresonden mit RNA oder DNA für In-vivo- oder In-vitro-Anwendungen eingebunden werden, um Nukleaseresistenz zu verleihen. Die einzigartige Kombination der Eigenschaften von 2′-O-Methyl-RNA findet breite Anwendung in folgenden Bereichen:

• Diagnosesonden
• Aptamer- und Ribozymentwicklung
• Gemischte 2′-O-Methyl-RNA/DNA-Antisense-Moleküle

Sicherheitshinweise

• Lagerklasse: 11 - Combustible Solids
• wgk: WGK 3
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable