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生物源
rabbit
品質等級
無性繁殖
monoclonal
物種活性
mouse, human
物種活性(以同源性預測)
mammals
製造商/商標名
ChIPAb+
Upstate®
技術
ChIP: suitable (ChIP-seq)
western blot: suitable
同型
IgG
NCBI登錄號
UniProt登錄號
運輸包裝
dry ice
基因資訊
human ... H3F3B(3021)
一般說明
对每批、每次的全部ChIPAb+抗体的染色质沉淀进行单独验证。 每个ChIPAb+抗体组均包含对照引物(通过qPCR对每个批次进行检测),以在基因座特异性环境下对IP结果进行生物学验证。提供了qPCR方案和引物序列,使研究人员能够在染色质环境中使用我们的抗体时验证ChIP方案。每组还包括阴性对照抗体,以确保ChIP反应的特异性。
ChIPAb+三甲基组蛋白H3(Lys4)组包括抗三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体,阴性对照抗体(正常兔血清)和qPCR引物,可扩增人GAPDH基因启动子内的166个碱基对区域。 三甲基组蛋白H3(Lys4)和阴性对照抗体以可扩展的“每个ChIP”反应大小提供,可用于功能上验证三甲基组蛋白H3(Lys4)相关染色质的沉淀。
ChIPAb+三甲基组蛋白H3(Lys4)组包括抗三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体,阴性对照抗体(正常兔血清)和qPCR引物,可扩增人GAPDH基因启动子内的166个碱基对区域。 三甲基组蛋白H3(Lys4)和阴性对照抗体以可扩展的“每个ChIP”反应大小提供,可用于功能上验证三甲基组蛋白H3(Lys4)相关染色质的沉淀。
组蛋白的甲基化可以发生在两个不同的残基上:精氨酸或赖氨酸。组蛋白甲基化可以与转录激活或抑制相关,具体取决于甲基化残基。组蛋白H3的赖氨酸4可以通过不同的组蛋白甲基转移酶(HMTs)(例如,SET1或ASH1)单甲基化、二甲基化或三甲基化。Lys4的甲基化通常与转录激活有关。脱甲基酶LSD1能够使组蛋白H3 Lys4脱甲基。
特異性
三甲基化组蛋白H3(Lys4)
免疫原
三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体是针对含有序列…RT[me3K]QT…的BSA偶联合成肽制备的,其中me3K对应于人组蛋白H3的三甲基赖氨酸4
表位:三甲基Lys4
應用
染色质免疫沉淀:
未经处理或紫外线处理(6 hrs,50焦耳/平方米)制备的超声染色质。使用3 μL兔抗三甲基组蛋白H3(Lys4)和Magna ChIP A(目录号17-610)试剂盒对U2OS细胞(每IP 3 X 106细胞当量)进行染色质免疫沉淀。通过qPCR使用包含Sp1结合位点的人p21启动子侧翼的ChIP引物p21通过qPCR验证了三甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的免疫沉淀(请参见图)。
倍数增加是从标准曲线中提取的标准化平均IP量的比率(来自每个染色质样品的输入)。如其他研究中所观察到的,与该启动子相关的三甲基组蛋白(Lys4)免疫沉淀活性随紫外线处理而增加。
请参见EZ-Magna A ChIP(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号#17-371)方案以获得实验详情。
ChIP-seq分析:
使用Magna ChIP HiSens试剂盒(17-10460),3 µL抗三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体(目录号17-614)或20 µL蛋白A/G珠和1e6交联HeLa细胞染色质进行染色质免疫沉淀,然后使用磁珠纯化DNA。使用标准规程从Input和ChIP DNA样品制备文库,带Illumina条形码适配器,并在Illumina HiSeq仪器上进行分析。在去除TagDust(http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource)标签后,使用Bowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml)映射了FastQ文件中的超过188万次读取。使用MACS(http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/)识别峰,并从BigWig和BED文件在UCSC Genome Browser(http://genome.ucsc.edu)中以自定义轨道的形式显示峰和读数。在17-614和07-473数据集中识别出的最高25%峰与HeLa S3的ENCODE H3K4me3 BROAD组蛋白轨迹中识别出的峰有99%重叠。
蛋白质印迹分析和肽抑制:
代表性批次。HeLa酸提取物通过电泳分离,转移到硝酸纤维素膜上,并用抗三甲基组蛋白H3(Lys4)(1:2,000,泳道1)探测或用0.4 μM组蛋白H3肽预孵育,并进行以下修饰:泳道2:单甲基赖氨酸4,泳道3:二甲基赖氨酸4,泳道4:三甲基赖氨酸4。
使用与HRP偶联的山羊抗兔二抗和化学发光检测
系统观察蛋白质(请参见图)。
未经处理或紫外线处理(6 hrs,50焦耳/平方米)制备的超声染色质。使用3 μL兔抗三甲基组蛋白H3(Lys4)和Magna ChIP A(目录号17-610)试剂盒对U2OS细胞(每IP 3 X 106细胞当量)进行染色质免疫沉淀。通过qPCR使用包含Sp1结合位点的人p21启动子侧翼的ChIP引物p21通过qPCR验证了三甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的免疫沉淀(请参见图)。
倍数增加是从标准曲线中提取的标准化平均IP量的比率(来自每个染色质样品的输入)。如其他研究中所观察到的,与该启动子相关的三甲基组蛋白(Lys4)免疫沉淀活性随紫外线处理而增加。
请参见EZ-Magna A ChIP(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号#17-371)方案以获得实验详情。
ChIP-seq分析:
使用Magna ChIP HiSens试剂盒(17-10460),3 µL抗三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体(目录号17-614)或20 µL蛋白A/G珠和1e6交联HeLa细胞染色质进行染色质免疫沉淀,然后使用磁珠纯化DNA。使用标准规程从Input和ChIP DNA样品制备文库,带Illumina条形码适配器,并在Illumina HiSeq仪器上进行分析。在去除TagDust(http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource)标签后,使用Bowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml)映射了FastQ文件中的超过188万次读取。使用MACS(http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/)识别峰,并从BigWig和BED文件在UCSC Genome Browser(http://genome.ucsc.edu)中以自定义轨道的形式显示峰和读数。在17-614和07-473数据集中识别出的最高25%峰与HeLa S3的ENCODE H3K4me3 BROAD组蛋白轨迹中识别出的峰有99%重叠。
蛋白质印迹分析和肽抑制:
代表性批次。HeLa酸提取物通过电泳分离,转移到硝酸纤维素膜上,并用抗三甲基组蛋白H3(Lys4)(1:2,000,泳道1)探测或用0.4 μM组蛋白H3肽预孵育,并进行以下修饰:泳道2:单甲基赖氨酸4,泳道3:二甲基赖氨酸4,泳道4:三甲基赖氨酸4。
使用与HRP偶联的山羊抗兔二抗和化学发光检测
系统观察蛋白质(请参见图)。
三甲基组蛋白H3(Lys4)ChIP验证的抗体&引物组,包括ChIP级抗体 & 特异性对照PCR引物用于H3K4Me3染色质免疫沉淀。
研究子类别
染色质生物学
染色质生物学
研究类别
表观遗传学&核功能
表观遗传学&核功能
包裝
25次测定/试剂盒,约3 μL/染色质免疫沉淀
成分
抗三甲基组蛋白H3(Lys4)(纯化兔IgG),1小瓶
阴性ChIP对照兔IgG,1小瓶
ChIP引物GAPDH,1小瓶
阴性ChIP对照兔IgG,1小瓶
ChIP引物GAPDH,1小瓶
品質
染色质免疫沉淀:
使用3 μL正常兔IgG或3 μL抗三甲基组蛋白H3(Lys4)单克隆IgG和Magna ChIP A(目录号17-610)试剂盒,对从未处理HeLa细胞制备的超声染色质(1 X 106细胞当量)进行染色质免疫。使用人GAPDH启动子侧翼对照ChIP引物通过qPCR验证了
三甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的成功免疫沉淀(请参见图)。关于实验详细信息,请参阅EZ-Magna A ChIP方案。
使用3 μL正常兔IgG或3 μL抗三甲基组蛋白H3(Lys4)单克隆IgG和Magna ChIP A(目录号17-610)试剂盒,对从未处理HeLa细胞制备的超声染色质(1 X 106细胞当量)进行染色质免疫。使用人GAPDH启动子侧翼对照ChIP引物通过qPCR验证了
三甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的成功免疫沉淀(请参见图)。关于实验详细信息,请参阅EZ-Magna A ChIP方案。
標靶描述
17 kDa
外觀
形式:纯化
抗三甲基组蛋白H3(Lys4)重组兔单克隆IgG。一个小瓶包含75 μL蛋白A纯化兔IgG,溶于储存缓冲液(0.1 M Tris-甘氨酸(pH 7.4)、0.15 M NaCl、0.05%NaN3,添加40%甘油)中。
正常兔IgG。一个小瓶包含75 μL正常兔IgG。
对照引物。一个小瓶包含75 μL的5 μM人GAPDH特异性引物。
用于:TAC TAG CGG TTT TAC GGG CG
REV: TCG AAC AGG AGG AGC AGA GAG CGA
正常兔IgG。一个小瓶包含75 μL正常兔IgG。
对照引物。一个小瓶包含75 μL的5 μM人GAPDH特异性引物。
用于:TAC TAG CGG TTT TAC GGG CG
REV: TCG AAC AGG AGG AGC AGA GAG CGA
儲存和穩定性
自收到之日起在-20°C可稳定保存1年
分析報告
对照
包括阴性对照抗体纯化兔IgG和对人GAPDH启动子特异性的对照引物。
包括阴性对照抗体纯化兔IgG和对人GAPDH启动子特异性的对照引物。
法律資訊
UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
免責聲明
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儲存類別代碼
10 - Combustible liquids
分析證明 (COA)
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Mammary-specific gene activation is defined by progressive recruitment of STAT5 during pregnancy and the establishment of H3K4me3 marks.
Molecular and cellular biology null
Epigenetic histone modification of Epstein-Barr virus BZLF1 promoter during latency and reactivation in Raji cells.
Journal of virology null
Oncogene, 31(6), 776-786 (2011-07-05)
In clear-cell renal cell carcinoma (ccRCC), inactivation of the tumor suppressor von Hippel-Lindau (VHL) occurs in the majority of the tumors and is causal for the pathogenesis of ccRCC. Recently, a large-scale genomic sequencing study of ccRCC tumors revealed that
Temporal dynamics and developmental memory of 3D chromatin architecture at Hox gene loci.
eLife null
Regulation of cyclin B2 expression and cell cycle G2/m transition by menin.
The Journal of Biological Chemistry null
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