MBD6000
Zestaw 5R-Plex
Ultra-sensitive 16S NGS assay for degraded and low biomass DNA
Zaloguj się, aby wyświetlić ceny organizacyjne i kontraktowe.
Wybierz wielkość
Produkt MBD6000 nie jest obecnie dostępny w sprzedaży w Twoim kraju Skontaktuj się z zespołem ds. pomocy technicznej
Informacje o tej pozycji
NACRES:
NA.84
UNSPSC Code:
41106302
Przejdź do
Pomoc techniczna
Potrzebujesz pomocy? Nasz zespół doświadczonych naukowców chętnie Ci pomoże.
Pozwól nam pomócusage
Preparing 96 samples for sequencing
technique(s)
DNA amplification: suitable, DNA sequencing: suitable
shipped in
dry ice
storage temp.
-10 to -25°C
Quality Level
General description
Gen 16S rybosomalnego RNA (16S rRNA) jest powszechnym markerem bakteryjnym, wykorzystywanym jako cel do profilowania społeczności drobnoustrojów w badaniach metagenomicznych mikrobiomu. Gen ten składa się z dziewięciu zmiennych regionów (V1-V9) przeplatających się między konserwowanymi regionami. Najpopularniejsze testy 16S rRNA NGS są ukierunkowane na jeden lub dwa regiony przy użyciu pojedynczego zestawu starterów (np. V3-V4). Jednak takie podejście zwykle skutkuje słabą wykrywalnością bakterii i wskaźnikiem klasyfikacji, gdy dane wejściowe DNA są niskiej jakości lub gdy stosuje się je do próbek o wyjątkowo niskiej biomasie. Zestaw 5R-PLEX oferuje kompletne rozwiązanie dla trudnych próbek biologicznych, w których standardowe protokoły sekwencjonowania 16S nie działają. Typy próbek obejmują:
- Tkanka utrwalona formaliną i zatopiona w parafinie (FFPE)[1]
- Tkanka guza nowotworowego
- Zdegradowane lub uszkodzone DNA
- Próbki o niskiej biomasie
- Kopalne i starożytne DNA
Features and Benefits
- Zestaw 5R-PLEX zapewnia wysokoprofilowe sekwencjonowanie zdegradowanych, uszkodzonych lub o niskiej zawartości biomasy próbek.
- Multipleksowany test NGS jest ukierunkowany na 5 zmiennych regionów genu 16S rRNA w pojedynczej puli starterów.
- Zawiera kontrolę pozytywną do eksperymentów z wykrywaniem problemów.
- Zestaw może wykryć zaledwie 1pg wysoce zdegradowanego bakteryjnego DNA o średniej wielkości fragmentu 260bp.
- Zestaw zawiera odczynniki o niskim obciążeniu biologicznym
- Obejmuje wyłączny dostęp do platformy M-CAMP™ z innowacyjnym algorytmem zaprojektowanym do rekonstrukcji pojedynczego spójnego profilowania drobnoustrojów i przeprowadzania kompleksowej analizy.
Preparation Note
Okres trwałości wszystkich odczynników dostarczonych w zestawie wynosi 12 miesięcy, jeśli są prawidłowo przechowywane. Wszystkie składniki należy przechowywać w temperaturze -20 °C.
Other Notes
Szczegółowe informacje na temat komponentów zestawu można znaleźć w instrukcji obsługi.
- 5R-PLEX PCR1 Primer mix- 25 μL
- 5R-PLEX PCR2 Forward Primer mix- 25 μL
- 5R-PLEX index plate 96-plate
- Water, microbial DNA-free 10X- 1.5 mL
- HF DNA Polymerase- 0.1 mL
- 5X HF buffer 2 mL
- dNTP′s- 0.2 mL
- Elution Buffer (EB), microbial DNA-free- 8 mL
- 5R-PLEX Positive Control (10 ng/μL)- 30 μL
Legal Information
M-Camp is a trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.
Related product
hcodes
pcodes
Hazard Classifications
Aquatic Chronic 3
Klasa składowania
10 - Combustible liquids
Wybierz jedną z najnowszych wersji:
Masz już ten produkt?
Dokumenty związane z niedawno zakupionymi produktami zostały zamieszczone w Bibliotece dokumentów.
Jacob T Nearing et al.
Microbiome, 9(1), 113-113 (2021-05-20)
Advances in DNA sequencing technology have vastly improved the ability of researchers to explore the microbial inhabitants of the human body. Unfortunately, while these studies have uncovered the importance of these microbial communities to our health, they often do not
Nicole M Davis et al.
Microbiome, 6(1), 226-226 (2018-12-19)
The accuracy of microbial community surveys based on marker-gene and metagenomic sequencing (MGS) suffers from the presence of contaminants-DNA sequences not truly present in the sample. Contaminants come from various sources, including reagents. Appropriate laboratory practices can reduce contamination, but
Deborah Nejman et al.
Science (New York, N.Y.), 368(6494), 973-980 (2020-05-30)
Bacteria were first detected in human tumors more than 100 years ago, but the characterization of the tumor microbiome has remained challenging because of its low biomass. We undertook a comprehensive analysis of the tumor microbiome, studying 1526 tumors and
Amnon Amir et al.
Nucleic acids research, 41(22), e205-e205 (2013-11-12)
The emergence of massively parallel sequencing technology has revolutionized microbial profiling, allowing the unprecedented comparison of microbial diversity across time and space in a wide range of host-associated and environmental ecosystems. Although the high-throughput nature of such methods enables the
Garold Fuks et al.
Microbiome, 6(1), 17-17 (2018-01-28)
Most of our knowledge about the remarkable microbial diversity on Earth comes from sequencing the 16S rRNA gene. The use of next-generation sequencing methods has increased sample number and sequencing depth, but the read length of the most widely used
Nasz zespół naukowców ma doświadczenie we wszystkich obszarach badań, w tym w naukach przyrodniczych, materiałoznawstwie, syntezie chemicznej, chromatografii, analityce i wielu innych dziedzinach.
Skontaktuj się z zespołem ds. pomocy technicznej