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WTA1
TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit
DNA polymerase separate.
Sinonimo/i:
Kit di amplificazione dell’intero trascrittoma TransPlex®
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About This Item
Codice UNSPSC:
41121800
NACRES:
NA.55
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Prodotti consigliati
Livello qualitativo
tecniche
whole genome amplification: suitable
Condizioni di spedizione
wet ice
Temperatura di conservazione
−20°C
Descrizione generale
Il metodo TransPlex® per l′amplificazione dell′intero trascrittoma (WTA) consente l′amplificazione rappresentativa dell′RNA totale presente in quantitativi nell′ordine dei nanogrammi in meno di 4 ore e senza 3′-bias. I quantitativi di amplificato, nell′ordine dei microgrammi, ottenuti da tessuto, cellule in coltura, campioni fissati in formalina, o siero, sono sufficienti per applicazioni a valle come la qPCR e i microarray.
Applicazioni
Il kit per l′amplificazione dell′intero trascrittoma TransPlex® (Whole Transcriptome Amplification) è stato usato per sintetizzare il cDNA a doppio filamento.[1] Inoltre è stato usato per l′amplificazione del cDNA[2]
Idoneo all′impiego con le applicazioni successive, tra cui:
- qPCR
- analisi di microarray
- clonaggio
Caratteristiche e vantaggi
- Amplificazione dell′RNA totale in meno di 4 ore con meno di 30 minuti di manipolazione
- Con soli 5 ng di materiale di partenza si produce una libreria altamente rappresentativa dall′RNA totale.
- Quantità in microgrammi del prodotto dell′amplificazione generate da RNA intatto da tessuto, cellule in coltura, siero o da RNA degradato da campioni fissati in formalina inclusi in paraffina
Principio
Il processo di WTA prevede due fasi. Nella prima fase, si sottopone l′RNA campione alla trascrizione inversa con primer non autocomplementari costituiti da un′estremità 3′ quasi casuale e un′estremità 5′ universale. Con il procedere della polimerizzazione, i singoli filamenti dislocati agiscono come nuovi templati per l′annealing e l′estensione dei primer. La libreria di cDNA OmniPlex che ne risulta, costituita da frammenti casuali, sovrapponentesi, da 100-1000 basi affiancati dalla sequenza terminale universale, viene quindi amplificata dalla PCR con il primer universale per realizzare il prodotto della WTA.
Note legali
TransPlex is a registered trademark of Rubicon Genomics, Inc.
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N° Catalogo
Descrizione
Determinazione del prezzo
Avvertenze
Warning
Indicazioni di pericolo
Consigli di prudenza
Classi di pericolo
Eye Irrit. 2
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10 - Combustible liquids
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Not applicable
Punto d’infiammabilità (°C)
Not applicable
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Protocolli
TransPlex® kits' amplification products integrate seamlessly into existing Agilent workflows for microarray target expression analyses.
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Transplex Whole Transcriptome Amplification FAQs on topics including whole transcriptome steps, RNA source, including archival fixed tissue, library purification, quantitation of the product and downstream applications
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What is the Department of Transportation shipping information for this product?
1 risposta-
Utile?
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Can TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1, be used for downstream applications?
1 risposta-
Upon creation of a cDNA library, quantitative qPCR or microarray analysis may be performed
Utile?
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Can TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1, be used to amplify archival fixed tissue or degraded samples?
1 risposta-
Yes, the WTA kit effectively amplifies degraded RNA, including formalin-fixed and paraffin-embedded samples.
Utile?
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Is the TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1, also applicable for ribosomal RNA and/or small RNA amplification?
1 risposta-
Using the kit as is, Ribosomal RNA does appear to amplify. However, we have not quantitated how well it is amplified.
Utile?
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What is the difference between WTA and WGA? I use the TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1.
1 risposta-
The starting material for WTA is RNA, whereas for WGA it is genomic DNA. After the RNA is reverse-transcribed into the DNA complement by WTA, the OmniPlex library is formed. This library is in turn amplified by PCR.
Utile?
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What is the concentration of the dNTPs supplied with the TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1?
1 risposta-
The dNTP Mix (D6193) is supplied as 10 mM each.
Utile?
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