A4718

Agarosa

for molecular biology

• Sinónimos: 3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan
• Número de CAS: 9012-36-6
• EC Number: 232-731-8
• MDL number: MFCD00081294
• UNSPSC Code: 41105317
• PubChem Substance ID: 24890904
• NACRES: NA.25

Propiedades

• biological source: algae (marine)
• Quality Level: 200
• grade: for molecular biology
• form: powder
• technique(s): electrophoresis: suitable
• EEO: ≤0.05
• mp: ≤75 °C (3% gel)
• transition temp: gel point ≤35 °C (3% gel)
• foreign activity: DNase, RNase, NICKase, none detected
• storage temp.: room temp
• SMILES string: O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O
• InChI: 1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
• InChI key: MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

Descripción

General description

Agarose is a polymer extracted from agar or agar-bearing marine algae. This purified linear galactan hydrocolloid comprises alternating co-polymers D-galactose and 3,6-anhydro-L-galactose units connected by α-(1→3) and β-(1→4) glycosidic bonds.[1] Agarose is highly biocompatible and possesses variable mechanical and diffusion properties.[2] Agarose can be used as a gelling agent, to separate nucleic acids electrophoretically.[3]

Application

Agarose has been used in the preparation of microgel slides employed in lysis and electrophoresis.[4] It has also been used in the gel electrophoresis to separate restriction enzyme digested products in catechol-O-methyltransferase (COMT) genotyping[5]

Ideal for the separation of small DNA fragments (e.g., PCR products) differing in size by as little as 2% and compares to the resolution of DNA in polyacrylamide gels. High resolution agarose is also ideal for resolving amplification fragment length polymorphisms (AmpFLP), short tandem repeats (STR) and tri- and tetranucleotide repeats.
Low ethidium bromide and SYBR Green background staining

Analysis Note

A continuación se presenta una lista de las propiedades asociadas a nuestras agarosas:
Contenido de sulfatos - utilizados como un indicador de pureza, ya que los sulfatos constituyen el principal grupo iónico presente.
Fuerza del gel - la fuerza que debe aplicarse a un gel para provocar su fractura.
Punto de gelificación - la temperatura a la cual una disolución acuosa de agarosa forma un gel cuando se enfría. Las disoluciones de agarosa exhiben histéresis en la transición de líquido a gel - es decir, su punto de gelificación no es el mismo que su temperatura de fusión.
Electroendosmosis (EEO) - movimiento de líquido a través del gel. En un gel de agarosa, los grupos aniónicos están pegados a la matriz y no pueden moverse, pero los contra-cationes disociables pueden migrar en la matriz hacia el cátodo, dando lugar a EEO. Dado que el movimiento electroforético de los biopolímeros suele ser en dirección al ánodo, la EEO puede alterar las separaciones debido a la convección interna.

Información de seguridad

• Storage Class: 11 - Combustible Solids
• wgk_germany: WGK 3
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable
• ppe: Eyeshields, Gloves, type N95 (US)