Allgemeine Beschreibung
Ubiquitin (Ub) wird anfangs produziert als Polyubiquitin-B-Vorläuferprotein mit 229 AS (UniProt P0CG47), das vom UBB-Gen (Gen-ID 7314) kodiert wird oder als Polyubiquitin-C-Vorläuferprotein mit 685 AS (UniProt P0CG48), das vom UBC-Gen (Gen-ID 7316) in Menschen kodiert wird. Die C-Termini von Polyubiquitin-B (Cys229) und Polyubiquitin-C (Val685) werden nach der Translation entfernt und anschließend erfolgen weitere posttranslationale Spaltungen, um mehrere identische Kopien von Ubiquitin-Molekülen mit 76 Aminosäuren (auch bekannt als High-Mobility-Group-Protein ohne Histon HMG-20) zu erhalten (drei Kopien pro Polyubiquitin-B und neun Kopien pro Polyubiquitin-C). Kovalente Modifizierungen von Zielproteinen durch verschiedene Ub-Lys-Reste, die während der zellulären DNA-Reparatur, ER-assoziierten Degradation (ERAD), Transkriptionsaktivierung, lysosomalen und proteasomalen Degradation auftreten, sind gut dokumentiert. PINK1 (PTEN-induzierte putative Kinase 1) ist eine Ser/Thr-Kinase, die sich in depolarisierten Mitochondrien spezifisch ansammelt und dort als positiver Regulator der E3-Ubiquitin (Ub)-Ligaseaktivität von Parkin (Park2) fungiert, indem sie Ub an Ser65 und den entsprechenden Ser-Rest an der N-terminalen Ub-ähnlichen (UBL) Domäne von Parkin phosphoryliert. Phosphoryliertes Ub interagiert mit phosphoryliertem Parkin an dessen GINGO0-Domäne auf allosterische Weise, wodurch eine Konformationsänderung induziert und die RING2-Domäne von Parkin katalytischem Cystein ausgesetzt wird, um volle Ligaseaktivität zu erzielen. Eine NMR-basierte Konformationsuntersuchung zeigt, dass an Ser65 phosphoryliertes Ub in Lösung in zwei Konformationen existiert. Die Hauptkonformation verfügt über veränderte Oberflächeneigenschaften, während die zweite phosphoUb-Konformation ein zum Ub-Kern hin um zwei Reste verkürztes C-terminales Ende aufweist. Die Ub-Ser65-Phosphorylierung hat nur eine geringe Auswirkung auf die E1-vermittelte E2-Ladung und beeinflusst vorwiegend die Entladung von E2-Enzymen, um polyUb-Ketten zu bilden. Darüber hinaus weisen die meisten Deubiquitinasen (DUB), einschließlich USP8, USP15 und USP30, nachweislich eine eingeschränkte Aktivität gegenüber Lys63-verknüpftem poly-phosphoUb auf.
Spezifität
Die Zielspezifität wurde unter Verwendung des unkonjugierten Antikörpers (ABS1513-I) verifiziert. Es wurden nur an Ser65 phosphoryliertes Ubiquitin (Ub) und ubiquitinierte Proteine (darunter oligoUb und polyUb), die an Ser65 phosphoryliertes Ubiquitin enthalten, nachgewiesen. Bei fehlender Ub-Ser65-Phosphorylierung zeigt dieser Antikörper keine Reaktivität gegenüber Ub oder ubiquitinierter Proteine.
Immunogen
An KLH konjugierte lineares Peptid, das der Ubiquitin-Zielregionensequenz entspricht, die phosphoryliertes Ser65 enthält.
Anwendung
Der unkonjugierte Antikörper (Best.-Nr. AB1513-I) ist auch für Immunzytochemie- und Western-Blot-Anwendungen verfügbar.
Dieser poyklonale Kaninchenantikörper, Anti-phospho-Ubiquitin-(Ser65)-Antikörper, Alexa Fluor™ 488-Konjugat, ist für die Verwendung in der Immunzytochemie validiert und wird zum Nachweis der Ubiquitin-Ser65-Phosphoylierung eingesetzt.
Forschungskategorie
Signalisierung
Qualität
Mittels Immunzytochemie in PINK1-exprimierenden HeLa-Zellen mit oder ohne CCCP-Behandlung beurteilt.
Immunzytochemische Analyse: Mit einer Verdünnung dieses Antikörpers im Verhältnis 1:100 wurde die durch die CCCP-Behandlung initiierte Ubiquitin-Ser65-Phosphorylierung in PINK1-exprimierenden HeLa-Zellen nachgewiesen.
Zielbeschreibung
~ 17/8 kDa (Dimer/Monomer) und ~ 45–250 kDa gemessen. 8,565/17,112/25,66/34,21 kDa (mono-/di/tri-/tetra-Ubiquitin) berechnet. Die Banden mit ~ 45–250 kDa repräsentieren ubiquitinierte Proteine, die an Ser65 phosphoryliertes Ub enthalten. Nicht charakterisierte Banden können in manchen Lysaten beobachtet werden.
Physikalische Form
Affinitätsgereinigt.
Aufgereinigter polyklonaler Kaninchenantikörper in PBS mit 1,5% BSA und 0,05% Natriumazid.
Lagerung und Haltbarkeit
Bei 2–8 °C ab Empfangsdatum 1 Jahr haltbar.
Sonstige Hinweise
Konzentration: Die Konzentration entnehmen Sie bitte dem chargenspezifischen Datenblatt.
Rechtliche Hinweise
ALEXA FLUOR is a trademark of Life Technologies
Haftungsausschluss
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