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PopCulture® Reagenz

Synonym(e):

E. coli culture medium protein extraction reagent

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Das PopCulture Reagenz* ist eine gepufferte Mischung konzentrierter Detergenzien, die zur Extraktion von Proteinen aus E.-coli-Zellen direkt in deren Kulturmedium entwickelt wurde. Bei dieser Methode werden Zellkultur, Proteinextraktion und -aufreinigung im ursprünglichen Kulturröhrchen oder in der Multiwell-Platte durchgeführt. PopCulture perforiert die E.-coli-Zellwand, ohne lösliche Proteine zu denaturieren, und schützt Proteine vor den pH-Extremen, die in Kulturmedien mit hoher Dichte auftreten. Rekombinante Proteine können direkt getestet oder durch Zugabe einer Affinitätsmatrix aufgereinigt werden. Anschließend wird der Komplex aus Matrix und Zielprotein gewaschen, um Kulturmedium und zelluläre Verunreinigungen zu entfernen, und das aufgereinigte Protein wird von der Matrix eluiert. Die Aufreinigung von Fusionsproteinen aus gesamten Kulturextrakten wurde sowohl mit IMAC- als auch mit GST-Affinitätschromatographie-Verfahren nachgewiesen (1).

Um das PopCulture Aufreinigungsverfahren weiter zu verbessern, können Lysozym und/oder Benzonase® Nuklease hinzugefügt werden. Lysozym spaltet eine Peptidoglykanbindung in der Zellwand von E. coli, wodurch die Zelllyse verstärkt und die Proteinausbeute erhöht wird (1, 2). Die Proteine können in einem Wirt exprimiert werden, der für T7-Lysozym kodiert (pLysS-Wirt), oder es kann nach dem PopCulture Reagenz exogenes Lysozym zugegeben werden. Zudem kann Benzonase Nuklease hinzugefügt werden, um endogene Nukleinsäuren abzubauen, die die Aufreinigung aufgrund ihrer hohen Viskosität beeinträchtigen könnten.

Das PopCulture Proteinaufreinigungsverfahren eignet sich ideal für die robotergestützte Probenverarbeitung mit hohem Durchsatz (HT) für die Proteomforschung oder für jede andere Anwendung, die von der erhöhten Geschwindigkeit und dem Komfort profitieren würde. Die magnetischen Agarose-Capture-Harze (z. B. GST•Bind<TMSYMBOL></TMSYMBOL> Magnetische Agarose-Perlen, His•Bind<TMSYMBOL></TMSYMBOL> Magnetische Agarose-Perlen) sind optimal für HT-Anwendungen, da das gesamte Verfahren in einem einzigen Röhrchen durchgeführt werden kann, ohne dass Säulen oder Zentrifugation erforderlich sind.

* Zum Patent angemeldet.

Other Notes

1. Grabski, A., Drott, D., Handley, M., Mehler, M. and Novy, R. (2001). inNovations13, 1–4.

2. Inouye, M., Arnheim, N. and Sternglanz, T. (1973). J. Biol. Chem.248, 7247.

Legal Information

Dieses Produkt ist durch das EP-Patent 1,432,822 geschützt, das der EMD Chemicals Inc. bzw. ihren verbundenen Unternehmen gehört.
Benzonase is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
NOVAGEN is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
POPCULTURE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

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Traditionally, protein purification from E. coli consists of four distinct phases: harvest, bacterial cell lysis, lysate clarification and protein purification. Bacterial lysis typically requires several time-consuming, hands-on steps, such as freeze/thaw cycles and sonication. These harsh lysis techniques may negatively impact protein quality and contribute to sample-to-sample variability. To maintain protein activity and integrity, detergent-based lysis buffers are routinely used to avoid mechanical protein extraction methods. Regardless of the lysis method used, centrifugation is traditionally required to pellet unwanted cell debris and permit recovery of the clarified lysate. The final step, purification, is frequently performed using affinity media specific for expressed epitope tags. Agarose-based media have typically been used, either as a slurry in microcentrifuge tubes or packed into gravity-driven or spin columns. While easier to manipulate, columns are greatly affected by lysate consistency and carryover of cell debris, which can lead to clogging of the column frits.

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