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Elementos estruturais para degradação proteica

Modelo 3D de uma estrutura de cocristal com a PROTAC, em verde, ligada ao alvo, em amarelo, e a ubiquitina E3, em rosa, para degradação proteica direcionada.

A degradação proteica direcionada (DPD) é uma nova abordagem usada na descoberta de medicamentos para infiltrar a via de degradação dos proteassomas celulares de maneira eficaz e eliminar rapidamente as proteínas-alvo das células. Essa estratégia tem o potencial de desenvolver novas terapias que diferem consideravelmente dos inibidores clássicos e que sejam viáveis até mesmo para o acesso a alvos proteicos “intratáveis” e doenças de difícil tratamento.

Nosso portfólio diversificado de elementos estruturais para degradação proteica permitem gerar facilmente bibliotecas de degradadores de proteínas que podem ser triadas para uma degradação eficaz das suas proteínas-alvo provenientes de células. Nossos degradadores de proteínas, como as quimeras direcionadas à proteólise (moléculas PROTAC® ), são moléculas bifuncionais com três componentes principais:

  • Um ligante em uma extremidade que é direcionado à proteína de interesse (POI)
  • Um segundo ligante na extremidade oposta que se liga a uma ligase E3
  • Um reticulador no meio que une as duas extremidades

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Portfólio de elementos estruturais para degradação proteica

Nossos elementos estruturais para degradação proteica consistem em permutações dos seguintes componentes:

  • Ligantes direcionados à ligase E3 Cereblon (CRBN) ou von Hippel–Lindau (VHL)
  • Reticuladores com comprimentos e composições variados
  • Sítios de conjugação com reatividade para grupos funcionais comuns

Tudo que é necessário para uma degradação proteica direcionada bem-sucedida

A ligação simultânea de duas proteínas ao degradador aproxima a POI o suficiente para que ocorra a poliubiquitinação pela enzima E2 associada à ligase E3, o que marca a POI para degradação pelo proteassoma.

O design preciso de pequenas moléculas degradadoras de alvos é crucial para o sucesso da degradação proteica. Até mesmo pequenas alterações nos ligantes e reticuladores pode afetar a ligação à POI ou à ligase E3. Dessa forma, muitos análogos são sintetizados, com pequenas variações em cada estrutura, e triados em células para determinar o degradador ideal para degradação do alvo.

Nossos elementos estruturais para degradação são uma coleção de conjugados de reticuladores e ligantes E3 com um grupo funcional pendurado para realizar ligação covalente a um ligante-alvo, de forma a agilizar a síntese. Como o mesmo grupo funcional está presente em toda uma série, um ligante-alvo pode ser conjugado a vários elementos estruturais de degradação simultaneamente para gerar bibliotecas de modo fácil e realizar a triagem subsequente.

Vantagens dos nossos degradadores de proteínas

  • Compatibilidade: Ligantes se conjugam a grupos funcionais comuns presentes nos ligantes-alvo
  • Design da molécula: A variedade estratégica de combinações de conectores e ligantes ajuda no design de degradadores de alvos
  • Economia de tempo de síntese: Os conjugados de ligante E3-reticulador reduzem o tempo gasto com a síntese de degradadores
  • Produção de bibliotecas: O uso de elementos estruturais de degradação com o mesmo sítio de conjugação permite a geração simultânea de vários degradadores por síntese paralela

PROTAC® é uma marca comercial registrada da Arvinas Operations, Inc. e é usada sob licença.





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