Ścieżki metaboliczne

Wspomnienie o dr Donaldzie Nicholsonie, 1916-2012

.

Dr Donald Nicholson uzyskał tytuł licencjata w 1936 r. i doktora nauk chemicznych w 1940 r. na Uniwersytecie Londyńskim. Następnie rozpoczął pracę w Boots Pure Drug Company w Nottingham nad rozwojem i produkcją najwcześniejszych leków przeciwbakteryjnych z grupy sulfonamidów. W 1946 roku dołączył do wydziału bakteriologii w School of Medicine w Leeds jako stypendysta I.C.I. w dziedzinie chemioterapii i pozostał tam jako wykładowca lub starszy wykładowca mikrobiologii aż do przejścia na emeryturę w 1981 roku. Nawet w wieku 90 lat dr Nicholson był aktywnie zaangażowany w tworzenie mniejszych i bardziej szczegółowych "minimap", a zwłaszcza "animap". W uznaniu jego pracy otrzymał tytuł doktora honoris causa i został jednym z dwóch honorowych dożywotnich członków IUBMB.

Dowiedz się więcej o dr Nicholsonie i o tym, jak stworzył wykresy szlaków metabolicznych.

22. schemat szlaków metabolicznych IUBMB-Nicholson

Dane publikacji Zaprojektowany przez Donalda Nicholsona Przygotowany i opublikowany przez Sigma-Aldrich Co. LLC, St.Louis, MO ©2002 Międzynarodowa Unia Biochemii i Biologii Molekularnej

Mapa szlaków metabolicznych zawiera ponad 500 hiperłączy do naszych list produktów. Wystarczy kliknąć na nazwę metabolitu lub numer E.C. enzymu, aby uzyskać dostęp do informacji o produkcie.

Dwudziesta druga (2003) edycja mapy szlaków metabolicznych IUBMB-Nicholson zawiera zaktualizowane szlaki związane z metabolizmem ATP w mitochondriach i chloroplastach. Szkieletem mapy jest szlak glikolityczny , po którym następuje cykl TCA (Krebsa).Cykl TCA (Krebsa) i łańcuch oddechowy które razem prowadzą do syntezy ATP przez syntazę ATP. ATP jest źródłem większości energii niezbędnej do życia. Wiele szlaków biosyntezy i rozpadu metabolizmu, takich jak węglowodany, aminokwasy, lipidy, jest powiązanych z tym szkieletem i jest rozróżnianych za pomocą kolorów. Ludzki metabolizm jest rozróżniany tam, gdzie to możliwe, za pomocą czarnych strzałek. Niektóre z 550 reakcji są identyfikowane przez ich numery Komisji Enzymów IUBMB (EC), które są następnie indeksowane.

View Chart (3.05 Mb PDF) - Użyj narzędzia powiększania Adobe Reader podczas przeglądania wykresu.

22 edycja kompleksowego wykresu szlaków metabolicznych. Zawiera glikolizę, węglowodany, aminokwasy, lipidy, nukleotydy, steroidy, metabolizm witamin i wiele więcej.

Zamów swój egzemplarz już dziś!

.

Minimapy (PDF) i powiązane zasoby

22. wydanie jest teraz uzupełnione on-line o Minimapy które przedstawiają wybrane indywidualne szlaki w powiększeniu - takie jak kompartmentalizacja i regulacja.Minimapy które biorą wybrane indywidualne szlaki i powiększają je, aby zilustrować aspekty metabolizmu, których wcześniej nie można było pokazać - takie jak kompartmentalizacja i regulacja.

Complete List of Enzyme Commission Numbers on the Metabolic Pathways Chart
Ta tabela odsyła nazwy wszystkich enzymów do odpowiadających im numerów E.C.#s na wykresach szlaków metabolicznych.

IUBMB-Nicholson Minimaps
Wybrane indywidualne szlaki zostały powiększone, aby zilustrować aspekty metabolizmu, których wcześniej nie można było pokazać, takie jak kompartmentacja, enzymy i regulacja.

Animowane szlaki metaboliczne

Unikalnym i ekscytującym wydarzeniem jest wprowadzenie animowanych szlaków metabolicznych - "animaps" do serii szlaków IUBMB-Nicholson. W ten sposób biochemia staje się wyraźniej biochemią, a metabolizm staje się bardziej "znaczący, wspaniały i zabawny!"" Te animacje nie mają dźwięku.

Animacja transportu elektronów
Animowana reprezentacja tego, jak siła protonomotoryczna jest generowana w mitochondriach w celu napędzania syntazy ATP.

Animacja syntazy ATP
Animacja przedstawiająca mechanizm tego, co wielu uważa za najważniejszą cząsteczkę dla żywych systemów.

Animacja szlaku glikolitycznego
Animacja przedstawiająca reakcje przekształcające glukozę w pirogronian.

Animacja cyklu kwasu cytrynowego
Ten film pokazuje etapy cyklu kwasu cytrynowego i śledzi produkty i reagenty w miarę postępu etapów pośrednich i zakończenia reakcji (i równania chemicznego).  

Animacja kompleksu dehydrogenazy pirogronianowej
Animowane przedstawienie tego, jak pirogronian z cytozolu łączy się z acetylo-CoA i cyklem TCA w macierzy mitochondrialnej. Ta animacja wymaga Adobe Flash Player.