Next-Generation Sequencing
차세대 서열분석(NGS)은 유기체의 선택된 영역 또는 전체 게놈에 대해 대규모 병렬 또는 심층 서열분석 범위를 가능하게 하는 여러 관련 기술을 광범위하게 포함하는 용어입니다. 유전체학 기반 연구 분야에서 필수적인 서열분석 기술은 수십 년 동안 존재해 왔습니다. 그러나 NGS 또는 대규모 병렬 DNA 및 RNA 서열분석 기술의 지속적인 발전으로 비용을 빠르게 감소시키면서 연구자를 위해 게놈 전체 서열분석 범위 및 데이터 분석 도구를 증가시켰습니다. NGS 애플리케이션은 기본 게놈 및 질병 연구의 최근 발전에 중요한 영향을 미치기 때문에 전체 게놈 분석을 넘어 확장됩니다.
관련 기술 문서
- Regardless of next-generation sequencing (NGS) platform, universal and index adapter sequences are required for the proper assembly of sample fragments.
- MISSION siRNA Universal Negative Controls are an essential component to any siRNA experiment. Using a Negative siRNA control allows the researcher to create a baseline for mRNA knockdown efficiency. MISSION siRNA Universal Negative Controls have been tested in human, rat, and mouse cells. All have been carefully designed to have no homology to known gene sequences.
- MISSION Positive Control siRNA, designed using the Rosetta siRNA Design Algorithm, serve as ideal complement to any siRNA silencing experiment. All MISSION Positive Control siRNA have been validated to work, so that you can spend more time silencing your gene of interest and less time on optimizing internal controls.
- Next-generation sequencing (NGS) revolutionized genomic research, and is now playing a crucial role in the clinical environment.
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관련 프로토콜
- 어닐링은 상보적 염기서열을 가진 2개의 단일 나선 올리고뉴클레오타이드를 가열 및 냉각하는 과정입니다.
- The SeqPlex DNA Amplification Kit for whole genome amplification (WGA) is designed to facilitate next-generation sequencing (NGS) from extremely small quantities or from degraded/highly fragmented DNA
- The SeqPlex RNA Amplification kit provides a method for amplification of total RNA or isolated mRNA prior to entry into the workflows of the commonly used deep sequencing platforms.
- GenomePlex® is a Whole Genome Amplification (WGA) method that allows the researcher to generate a representative amplification of genomic DNA
- WTA2, a Whole Transcriptome Amplification (WTA) method, allows for representative amplification of nanogram quantities of total RNA in less than 4 hours without 3-bias
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NGS 기법 개요
NGS에 대한 방법론과 시약이 지속적으로 발전하고 있지만 현재 연구자가 사용할 수 있는 많은 NGS 시스템이 있습니다. 일반적으로 사용되는 플랫폼은 시료 또는 라이브러리 전처리, 클러스터 생성, 서열분석 및 데이터 분석을 포함하여 NGS 작업공정에서 몇 가지 중요한 단계의 사용을 통합합니다. 시료 전처리에는 일반적으로 DNA 증폭 또는 서열 링커 또는 어댑터의 추가가 포함됩니다. 각 DNA 서열의 클러스터 생성은 공유 결합된 링커를 포함하는 DNA가 브릿지 PCR 증폭을 위해 고체 표면에 혼성화하거나 에멀젼 PCR과 같은 대안적인 방법에 의한 것입니다. 또한 접합에 의한 서열분석, 합성에 의한 서열분석, 파이로시퀀싱(pyrosequencing ) 및 이온 반도체 서열분석을 비롯한 많은 DNA 서열분석 기법이 있습니다. 각 서열분석 기법에는 궁극적으로 각 서열의 길이(판독 길이), 오류율 및 시약 비용을 결정하는 다양한 반응 단계 및 화학을 포함합니다.
NGS 데이터 분석을 위한 분석적 접근
모든 NGS 작업공정의 마지막 요소는 서열분석 후에 발생하는 중요한 데이터 분석 단계입니다. 각 NGS 플랫폼 및 작업공정은 컴퓨터에서 포획한 엄청난 양의 디지털 정보를 생성하지만, 생물 정보학자가 Bowtie, Galaxy 등의 읽기 정렬 및 매핑을 위해 지속적으로 증가하는 분석 도구를 사용하여 원시 데이터 세트를 분석해야 합니다. NGS 기술 분야의 여러 발전은 이러한 대규모 데이터 세트의 분석 및 해석을 개발하고 최적화하기 위해 수많은 과학 분야를 통합한 결과입니다. 특정 응용 분야의 요구 사항에 따라 연구자들은 이제 이러한 강력한 도구를 사용하여 기본 및 질병 연구 연구를 위해 전체 게놈, 엑솜 또는 전사체를 서열분석할 수 있습니다.
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