F3174

Fpgタンパク質 大腸菌由来

≥90% (SDS-PAGE), buffered aqueous glycerol solution, >20,000 units/mg protein, suitable for genomic analysis

• 別名: Fapy DNAグリコシラーゼ, MutM, ホルムアミドピリミジンDNAグリコシラーゼ
• CAS番号: 78783-53-6
• Enzyme Commission number: 3.2.2.23 (BRENDA, IUBMB)
• MDL番号: MFCD02264758
• UNSPSCコード: 12352202
• NACRES: NA.32

特性

• 由来生物: Escherichia coli
• 品質水準: 200
• リコンビナント: expressed in E. coli
• アッセイ: ≥90% (SDS-PAGE)
• 形状: buffered aqueous glycerol solution
• 比活性: >20,000 units/mg protein
• 分子量: 30.2 kDa (269 amino acids, predicted from the nucleotide sequence)
• 組成: protein, 0.1- 0.3 mg/mL Bradford
• 保管条件: (Tightly closed)
• テクニック: nucleic acid detection: suitable
• UniProtアクセッション番号: P05523
• アプリケーション: genomic analysis
• 輸送温度: wet ice
• 保管温度: −20°C
• 遺伝子情報: Escherichia coli CFT073 ... mutM(1038243) ; Escherichia coli K12 ... mutM(946765)

詳細

詳細

Formamidopyrimidine-DNA glycosylase (Fpg) is a DNA repair enzyme found in Escherichia coli, which contains one zinc atom. Proximal to its C-terminal, it contains a zinc-finger motif of CC/CC type.

Fpg contains two domains separated by a flexible hinge.

Research area: Cell signaling

アプリケーション

Fpg Protein from Escherichia coli has been used for the assessment of DNA oxidative damage using comet assay.

生物化学的／生理学的作用

Fpgタンパク質は、DNAの塩基除去修復(BER)経路における重要な酵素であり、ホルムアミドピリミジン(Fapy)や8-オキソグアニン(8-oxo-G)など広範囲にわたる修飾プリン塩基の除去反応を触媒します。 Fpgは、変異した塩基を除去するDNAグリコシラ-ゼ活性と、DNAの5′-および3′-のリン酸化末端を残してリボ-スを遊離するAPリア-ゼ活性の両方を有しています。in vitroにおいて、主としてFapyA、FapyGおよび8-oxo-GによるDNAの酸化的損傷を検出・定量するために、Fpg活性に基づいた複数の分析法が開発されています。fpg遺伝子はBoiteuxらによってクロ-ニングされました。Fpgタンパク質はC末端にzincフィンガ-モチ-フを有しています(1分子あたり亜鉛1原子)。この領域はDNAへの結合とAPリア-ゼ活性に関与しています。 さらに、N末端のプロリンは酵素作用に必須なシッフ塩基中間体を生じる求核剤として作用することが確認されています。

Fpg is a key enzyme in the DNA base excision repair pathway (BER). It catalyses the excision of a broad spectrum of modified purines. Fpg has both DNA glycosylase activity that removes the mutated base and AP-lyase activity that releases ribose leaving both 5′- and 3′-phosphorylated ends in the DNA. The zinc finger motif at its C-terminus is responsible for the DNA binding and AP-lyase activity. In addition, its N-terminal proline acts as a nucleophile to produce a Schiff base intermediate that is essential for enzyme action.

Fpg specifically acts on 3′- and 5′-phosphodiester bonds.

単位の定義

1ユニットは、25°Cで10分間に0.5 pmolの二本鎖DNAオリゴマー基質(8-オキソグアニン変異)を50%切断する量です。

物理的形状

50%グリセロ-ル溶液 (50mM HEPESカリウム, pH 7.5, 1mM DTT, 1mM EDTA, 200mM NaCl含有)。

安全性情報

• 保管分類コード: 10 - Combustible liquids
• WGK: WGK 2
• 引火点(°F): Not applicable
• 引火点(℃): Not applicable
• 個人用保護具 (PPE): Eyeshields, Gloves, multi-purpose combination respirator cartridge (US)