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生物来源
rabbit
质量水平
克隆
monoclonal
种属反应性
mouse, human
种属反应性(根据同源性预测)
mammals
制造商/商品名称
ChIPAb+
Upstate®
技术
ChIP: suitable (ChIP-seq)
western blot: suitable
同位素/亚型
IgG
NCBI登记号
UniProt登记号
运输
dry ice
基因信息
human ... H3F3B(3021)
一般描述
对每批、每次的全部ChIPAb+抗体的染色质沉淀进行单独验证。 每个ChIPAb+抗体组均包含对照引物(通过qPCR对每个批次进行检测),以在基因座特异性环境下对IP结果进行生物学验证。提供了qPCR方案和引物序列,使研究人员能够在染色质环境中使用我们的抗体时验证ChIP方案。每组还包括阴性对照抗体,以确保ChIP反应的特异性。
ChIPAb+三甲基组蛋白H3(Lys4)组包括抗三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体,阴性对照抗体(正常兔血清)和qPCR引物,可扩增人GAPDH基因启动子内的166个碱基对区域。 三甲基组蛋白H3(Lys4)和阴性对照抗体以可扩展的“每个ChIP”反应大小提供,可用于功能上验证三甲基组蛋白H3(Lys4)相关染色质的沉淀。
ChIPAb+三甲基组蛋白H3(Lys4)组包括抗三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体,阴性对照抗体(正常兔血清)和qPCR引物,可扩增人GAPDH基因启动子内的166个碱基对区域。 三甲基组蛋白H3(Lys4)和阴性对照抗体以可扩展的“每个ChIP”反应大小提供,可用于功能上验证三甲基组蛋白H3(Lys4)相关染色质的沉淀。
组蛋白的甲基化可以发生在两个不同的残基上:精氨酸或赖氨酸。组蛋白甲基化可以与转录激活或抑制相关,具体取决于甲基化残基。组蛋白H3的赖氨酸4可以通过不同的组蛋白甲基转移酶(HMTs)(例如,SET1或ASH1)单甲基化、二甲基化或三甲基化。Lys4的甲基化通常与转录激活有关。脱甲基酶LSD1能够使组蛋白H3 Lys4脱甲基。
特异性
三甲基化组蛋白H3(Lys4)
免疫原
三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体是针对含有序列…RT[me3K]QT…的BSA偶联合成肽制备的,其中me3K对应于人组蛋白H3的三甲基赖氨酸4
表位:三甲基Lys4
应用
染色质免疫沉淀:
未经处理或紫外线处理(6 hrs,50焦耳/平方米)制备的超声染色质。使用3 μL兔抗三甲基组蛋白H3(Lys4)和Magna ChIP A(目录号17-610)试剂盒对U2OS细胞(每IP 3 X 106细胞当量)进行染色质免疫沉淀。通过qPCR使用包含Sp1结合位点的人p21启动子侧翼的ChIP引物p21通过qPCR验证了三甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的免疫沉淀(请参见图)。
倍数增加是从标准曲线中提取的标准化平均IP量的比率(来自每个染色质样品的输入)。如其他研究中所观察到的,与该启动子相关的三甲基组蛋白(Lys4)免疫沉淀活性随紫外线处理而增加。
请参见EZ-Magna A ChIP(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号#17-371)方案以获得实验详情。
ChIP-seq分析:
使用Magna ChIP HiSens试剂盒(17-10460),3 µL抗三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体(目录号17-614)或20 µL蛋白A/G珠和1e6交联HeLa细胞染色质进行染色质免疫沉淀,然后使用磁珠纯化DNA。使用标准规程从Input和ChIP DNA样品制备文库,带Illumina条形码适配器,并在Illumina HiSeq仪器上进行分析。在去除TagDust(http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource)标签后,使用Bowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml)映射了FastQ文件中的超过188万次读取。使用MACS(http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/)识别峰,并从BigWig和BED文件在UCSC Genome Browser(http://genome.ucsc.edu)中以自定义轨道的形式显示峰和读数。在17-614和07-473数据集中识别出的最高25%峰与HeLa S3的ENCODE H3K4me3 BROAD组蛋白轨迹中识别出的峰有99%重叠。
蛋白质印迹分析和肽抑制:
代表性批次。HeLa酸提取物通过电泳分离,转移到硝酸纤维素膜上,并用抗三甲基组蛋白H3(Lys4)(1:2,000,泳道1)探测或用0.4 μM组蛋白H3肽预孵育,并进行以下修饰:泳道2:单甲基赖氨酸4,泳道3:二甲基赖氨酸4,泳道4:三甲基赖氨酸4。
使用与HRP偶联的山羊抗兔二抗和化学发光检测
系统观察蛋白质(请参见图)。
未经处理或紫外线处理(6 hrs,50焦耳/平方米)制备的超声染色质。使用3 μL兔抗三甲基组蛋白H3(Lys4)和Magna ChIP A(目录号17-610)试剂盒对U2OS细胞(每IP 3 X 106细胞当量)进行染色质免疫沉淀。通过qPCR使用包含Sp1结合位点的人p21启动子侧翼的ChIP引物p21通过qPCR验证了三甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的免疫沉淀(请参见图)。
倍数增加是从标准曲线中提取的标准化平均IP量的比率(来自每个染色质样品的输入)。如其他研究中所观察到的,与该启动子相关的三甲基组蛋白(Lys4)免疫沉淀活性随紫外线处理而增加。
请参见EZ-Magna A ChIP(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号#17-371)方案以获得实验详情。
ChIP-seq分析:
使用Magna ChIP HiSens试剂盒(17-10460),3 µL抗三甲基组蛋白H3(Lys4)抗体(目录号17-614)或20 µL蛋白A/G珠和1e6交联HeLa细胞染色质进行染色质免疫沉淀,然后使用磁珠纯化DNA。使用标准规程从Input和ChIP DNA样品制备文库,带Illumina条形码适配器,并在Illumina HiSeq仪器上进行分析。在去除TagDust(http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource)标签后,使用Bowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml)映射了FastQ文件中的超过188万次读取。使用MACS(http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/)识别峰,并从BigWig和BED文件在UCSC Genome Browser(http://genome.ucsc.edu)中以自定义轨道的形式显示峰和读数。在17-614和07-473数据集中识别出的最高25%峰与HeLa S3的ENCODE H3K4me3 BROAD组蛋白轨迹中识别出的峰有99%重叠。
蛋白质印迹分析和肽抑制:
代表性批次。HeLa酸提取物通过电泳分离,转移到硝酸纤维素膜上,并用抗三甲基组蛋白H3(Lys4)(1:2,000,泳道1)探测或用0.4 μM组蛋白H3肽预孵育,并进行以下修饰:泳道2:单甲基赖氨酸4,泳道3:二甲基赖氨酸4,泳道4:三甲基赖氨酸4。
使用与HRP偶联的山羊抗兔二抗和化学发光检测
系统观察蛋白质(请参见图)。
三甲基组蛋白H3(Lys4)ChIP验证的抗体&引物组,包括ChIP级抗体 & 特异性对照PCR引物用于H3K4Me3染色质免疫沉淀。
研究子类别
染色质生物学
染色质生物学
研究类别
表观遗传学&核功能
表观遗传学&核功能
包装
25次测定/试剂盒,约3 μL/染色质免疫沉淀
组分
抗三甲基组蛋白H3(Lys4)(纯化兔IgG),1小瓶
阴性ChIP对照兔IgG,1小瓶
ChIP引物GAPDH,1小瓶
阴性ChIP对照兔IgG,1小瓶
ChIP引物GAPDH,1小瓶
质量
染色质免疫沉淀:
使用3 μL正常兔IgG或3 μL抗三甲基组蛋白H3(Lys4)单克隆IgG和Magna ChIP A(目录号17-610)试剂盒,对从未处理HeLa细胞制备的超声染色质(1 X 106细胞当量)进行染色质免疫。使用人GAPDH启动子侧翼对照ChIP引物通过qPCR验证了
三甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的成功免疫沉淀(请参见图)。关于实验详细信息,请参阅EZ-Magna A ChIP方案。
使用3 μL正常兔IgG或3 μL抗三甲基组蛋白H3(Lys4)单克隆IgG和Magna ChIP A(目录号17-610)试剂盒,对从未处理HeLa细胞制备的超声染色质(1 X 106细胞当量)进行染色质免疫。使用人GAPDH启动子侧翼对照ChIP引物通过qPCR验证了
三甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的成功免疫沉淀(请参见图)。关于实验详细信息,请参阅EZ-Magna A ChIP方案。
目标描述
17 kDa
外形
形式:纯化
抗三甲基组蛋白H3(Lys4)重组兔单克隆IgG。一个小瓶包含75 μL蛋白A纯化兔IgG,溶于储存缓冲液(0.1 M Tris-甘氨酸(pH 7.4)、0.15 M NaCl、0.05%NaN3,添加40%甘油)中。
正常兔IgG。一个小瓶包含75 μL正常兔IgG。
对照引物。一个小瓶包含75 μL的5 μM人GAPDH特异性引物。
用于:TAC TAG CGG TTT TAC GGG CG
REV: TCG AAC AGG AGG AGC AGA GAG CGA
正常兔IgG。一个小瓶包含75 μL正常兔IgG。
对照引物。一个小瓶包含75 μL的5 μM人GAPDH特异性引物。
用于:TAC TAG CGG TTT TAC GGG CG
REV: TCG AAC AGG AGG AGC AGA GAG CGA
储存及稳定性
自收到之日起在-20°C可稳定保存1年
分析说明
对照
包括阴性对照抗体纯化兔IgG和对人GAPDH启动子特异性的对照引物。
包括阴性对照抗体纯化兔IgG和对人GAPDH启动子特异性的对照引物。
法律信息
UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
免责声明
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储存分类代码
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