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Amplification de génomes entiers

Kits d'amplification de génome entier

Pour de nombreuses analyses réalisées dans l'étude des maladies humaines et animales, il est essentiel de disposer d'ADN génomique en quantité suffisante. Il n'est pas rare que la source d'ADN soit limitée ou que l'ADN disponible soit endommagé ou dégradé, ce qui empêche les chercheurs de réaliser des analyses cruciales. Notre gamme de produits d'amplification du génome entier (WGA pour "Whole Genome Amplification") vous permet d'amplifier des quantités de matériel de départ de l'ordre du nanogramme pour obtenir un rendement de l'ordre du microgramme de manière fiable et précise, avec une perte allélique minime. Nous ne cessons d'agrandir notre gamme de produits d'amplification du génome entier pour vous proposer un éventail de solutions WGA pour divers matériels de départ : frottis buccaux, échantillons de tissus frais ou congelés, sang sur papier-filtre, sang périphérique, tissus fixés au formol et inclus en paraffine, etc.  L'amplification du génome entier permet d'immortaliser un échantillon disponible en quantité limitée, ce qui permet aux chercheurs de réaliser toutes les analyses souhaitées à partir d'un seul échantillon d'ADN. 

Pour en savoir plus

Ressources apparentées

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Kits d'amplification de génome entier (WGA)

Les tests génomiques et la caractérisation du génome sont devenus des outils importants pour la compréhension des systèmes biologiques. Ces analyses se heurtent souvent à deux problèmes : le nombre d'échantillons à examiner et la disponibilité de quantités d'ADN génomique suffisantes. Cela s'avère particulièrement problématique pour les sources d'ADN rares et archivées. Les kits d'amplification de génome entier (WGA pour "Whole Genome Amplification") GenomePlex® ont été mis au point pour être utilisés comme un système à haut débit pour l'amplification rapide et hautement représentative de l'ADN génomique contenu dans des matériels de départ disponibles en quantités infimes (traces).

Les kits d'amplification de génome entier GenomePlex® utilisent une technologie d'amplification exclusive qui repose sur la fragmentation aléatoire de l'ADN génomique et la conversion des petits fragments ainsi obtenus en molécules de la banque OmniPlex® amplifiables par PCR, flanquées de sites d'amorçage universels. La banque OmniPlex® est ensuite amplifiée à l'aide d'amorces oligonucléotidiques universelles, avec un nombre de cycles limité. Les kits d'amplification de génome entier GenomePlex® nécessitent quelques nanogrammes d'ADN génomique, pour un rendement de 5 à 10 µg à l'issue de la PCR. Ce système convient à divers types d'échantillons d'ADN purifié, notamment le sang total, le sang sur papier-filtre, les frottis buccaux, les échantillons de plantes et les échantillons de tissus fixés au formol et inclus en paraffine.

Stratégies d'amplification de génome entier sur cellules isolées

Le kit d'amplification du génome entier de cellules isolées GenomePlex® WGA4 est conçu pour amplifier le génome de cellules isolées, avec une amplification d'un facteur d'un million, soit un rendement de plusieurs microgrammes d'ADN génomique. Les méthodes classiques d'amplification du génome entier sur cellules isolées produisent des quantités insuffisantes et introduisent d'importants biais de représentation. Cependant, la technologie GenomePlex® permet une amplification efficace grâce à une ADN polymérase pour amplification du génome entier. Le kit d'amplification du génome entier de cellules isolées contient tous les réactifs nécessaires à la lyse cellulaire et à l'amplification du génome entier.

Il a été validé pour de nombreuses applications en aval et convient à l'amplification d'ADN de diverses origines (plantes, cellules fixées au polycarbonate, lymphocytes, cellules de cancer rénal, cellules épithéliales, cellules leucémiques, fibroblastes de liquide amniotique…). Le génome amplifié est compatible avec de nombreuses applications en aval, notamment l'hybridation génomique comparative (CGH pour "Comparative Genomic Hybridization"), l'analyse des microsatellites et des courtes répétitions en tandem (STR pour "Short Tandem Repeat"), l'analyse des polymorphismes mononucléotidiques (SNP pour "Single Nucleotide Polymorphism"), la PCR quantitative (qPCR) et d'autres tests de génotypage.

Amplification du transcriptome entier

Les kits d'amplification de transcriptome entier (WTA pour "Whole Transcriptome Amplification") ont été mis au point pour produire suffisamment de transcrits cibles à partir d'infimes quantités d'ARN. Pour réussir une expérience d'amplification du transcriptome entier, il est important que les transcrits représentatifs présents dans l'échantillon soient répliqués avec précision, sans biais ni perte de certains ARNm.  Nos kits d'amplification de transcriptome entier permettent d'amplifier l'ARN total contenu dans divers échantillons (sang, tissus fixés et congelés, cultures de cellules, cellules triées par cytofluorométrie en flux, tissus végétaux, micro-organismes…) de manière rapide, simple et précise. De plus, ces kits (WTA1, WTA2, SeqR) assurent une amplification rapide de l'ARN total (en moins de 4 heures), sans biais en 3'. L'ARN ainsi amplifié (ADNc) est adapté aux applications de qPCR, d'analyse par puces à ADN et de clonage conventionnel. Pour toute information complémentaire, nous vous invitons à consulter les pages des produits WTA1, WTA2 et SeqR.

Kits d'amplification d'ADN et d'ARN SeqPlex-I pour séquençage de nouvelle génération Illumina®

Les kits d'amplification d'ADN et d'ARN SeqPlex-I pour amplification du génome entier (WGA) et amplification du transcriptome entier (WTA) sont conçus pour faciliter le séquençage de nouvelle génération selon la technologie Illumina® à partir d'ARN ou d'ARN disponibles en très faibles quantités, dégradés ou hautement fragmentés. Les kits WGA et WTA utilisent tous deux une technologie exclusive qui repose sur l'amorçage aléatoire de l'ADN génomique ou de l'ARN et la conversion des petits fragments ainsi obtenus en molécules de banque amplifiables par PCR, flanquées de sites d'amorçage universels. Les kits SeqPlex-I WGA et WTA permettent d'amplifier facilement des échantillons de départ disponibles en quantité limitée, les produits amplifiés pouvant être chargés directement sur des supports solides ("flowcells") pour séquençage de nouvelle génération selon la technologie Illumina®, permettant ainsi d'accélérer votre prochaine grande découverte.

Catégories de produits apparentées
Clonage moléculaire et expression protéique
Méthodes et protocoles de clonage moléculaire et d'expression des protéines permettant un clonage fiable et une expression protéique robuste avec des vecteurs d'expression d'insectes, de bactéries et de mammifères.
Épigénétique
Ressources et réactifs d'épigénétique permettant d'étudier les espèces d'ARN, la méthylation de l'ADN, les modifications de la chromatine et les modifications des histones.
Microbiome
Analyse complète du microbiome intestinal : découvrez une solution globale englobant la préparation des échantillons, le séquençage, la bio-informatique et les statistiques. De l'analyse de l'ARN 16S au séquençage du génome entier (WGS).
Kits et réactifs pour PCR
Maîtrisez la PCR pour faciliter vos découvertes : amplifiez l'ADN de manière exponentielle grâce à nos réactifs, pour l'analyse des gènes, le séquençage, la mutagénèse, etc.
Produits Roche® Life Science
Produits Roche Life Science : en tant que distributeur exclusif des produits et réactifs biochimiques Roche, nous avons à cœur de vous aider à réaliser votre prochaine avancée scientifique en vous proposant des réactifs fiables qui vous donnent des résultats de grande qualité et reproductibles en peu de temps.
Matériel et équipement pour PCR
Tubes PCR, pointes, pointes à filtre, plaques, scelleuses de plaques, thermocycleurs et autres consommables de PCR pour vos protocoles.
Applications apparentées
Édition génomique avancée
Panorama des principes et techniques CRISPR/Cas9 et ZFN et de leur mise en œuvre dans l'édition ciblée du génome et l'ingénierie génomique pour les applications de recherche et les applications thérapeutiques.
Expression et extinction géniques
Technologies CRISPR, micro-ARN, ARNsi et shARN pour applications d'expression et d'extinction géniques
Criblage de génomique fonctionnelle
Principes du criblage de génomique fonctionnelle dans l'identification des gènes cibles par analyse phénotypique afin d'élucider les voies cellulaires, comprendre les états pathologiques et faciliter l'identification de cibles médicamenteuses. Inclut un paragraphe sur l'utilisation des banques ARNi et CRISPR/Cas9 pour les analyses à haut débit.
Purification de l'ADN et de l'ARN
Panorama des principales techniques d'extraction et de purification d'ADN génomique, d'ADN plasmidique et d'ARN total à partir de cellules, de tissus, de sang, de virus et autres types d'échantillons, ainsi que des principales applications en aval.
Applications de PCR
La réaction en chaîne par polymérase (PCR pour "Polymerase Chain Reaction") est une technique d'amplification des molécules d'acide nucléique qui est couramment employée dans de nombreuses applications, incluant la RT-PCR, la PCR à démarrage à chaud, la PCR en point final, et bien d'autres.
PCR quantitative
Applications de PCR quantitative (qPCR) ou de PCR quantitative en temps réel utilisant des molécules rapporteuses fluorescentes pour vos analyses de génotypage, de micro-ARN et d'expression génique.
Clonage et expression
Clonage, vecteurs d'expression protéique et techniques d'obtention de systèmes de clonage génique et d'expression protéique optimaux.
Épigénétique
Outils et techniques épigénétiques permettant d'étudier les complexités des mécanismes épigénétiques, comme la méthylation de l'ADN, la modification des histones et la régulation par l'ARN.
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