A2929

Agarose

For pulsed field electrophoresis running gel

• Synonym(e): 3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan
• CAS-Nummer: 9012-36-6
• UNSPSC Code: 41105317
• PubChem Substance ID: 24890707
• EC Number: 232-731-8
• NACRES: NA.25
• MDL number: MFCD00081294

Eigenschaften

• biological source: algae (red)
• Quality Segment: 200
• form: powder
• technique(s): electrophoresis: suitable
• impurities: ≤10% water
• EEO: ≤0.10
• transition temp: gel point 38-43 °C (10% gel)
• gel strength: ≥2000 g/cm²
• anion traces: sulfate (SO₄^2-): ≤0.20%
• foreign activity: DNase, RNase, NICKase, none detected
• SMILES string: O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O
• InChI: 1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
• InChI key: MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

Beschreibung

Application

Especially formulated for fast resolution of large DNA (10-2000 ·kb) by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) or conventional electrophoresis. Pulsed-field gel electrophoresis was developed in 1984 to deal with "reptation" of large DNA′s whose size surpass the limit of resolution and all migrate at the same rate. Alternately pulsed, orthogonally oriented electric fields are applied across the gel. Every time the direction of the electric field changes, the large DNA′s can no longer migrate until they become reoriented along the new electric field. The time required for reorientation is dependent on the size of the DNA, therefore the DNA is fractionated by size.

Biochem/physiol Actions

Suitable for the separation of high molecular weight DNA. Gels are easy to handle and give faster separation and better resolution of high molecular weight DNA by field inversion electrophoresis than our routine-use agarose.

Features and Benefits

• Low EEO allows for increased voltages and more rapid DNA migration
• Greater gel strength allows for stability of lower concentration gels leading to faster DNA migration
• Gels exhibit low background fluorescence using ethidium bromide staining

Analysis Note

Nachfolgend finden Sie eine Liste der Eigenschaften unserer Agarosen:
Sulfatgehalt - dient als Indikator für die Reinheit, da Sulfat die hauptsächlich vorhandene Ionengruppe ist.
Gelstärke - die Kraft, die aufgewendet werden muss, damit ein Gel zerbricht.
Gelierpunkt - die Temperatur, bei der die wässrige Agaroselösung beim Abkühlen geliert. Agaroselösungen zeigen beim Übergang von der Flüssigkeit zum Gel Hysterese - das bedeutet, dass die Temperatur des Gelierpunkts nicht dieselbe ist wie die Schmelztemperatur.
Elektroendosmose (EEO) - Bewegung einer Flüssigkeit durch das Gel. Anionische Gruppen sind in einem Agarosegel an die Matrix gebunden und können sich nicht bewegen, aber dissoziierbare Gegenkationen können in der Matrix in Richtung der Kathode wandern und führen zu EEO. Da die elektrophoretische Bewegung der Biopolymere normalerweise in Richtung der Anode stattfindet, kann EEO die Auftrennung aufgrund von interner Konvektion stören.

Sicherheitshinweise

• Lagerklasse: 11 - Combustible Solids
• wgk: WGK 3
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable
• ppe: Eyeshields, Gloves, type N95 (US)