This kit uses sonication to shear the isolated chromatin to a manageable size. Please see the link below to review the kit instructions for use:
https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/product/documents/530/862/17-371man-ms.pdf
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Über diesen Artikel
description
22 individual chromatin immunoprecipitation (ChIP) reactions using inexpensive protein G agarose beads
Quality Level
packaging
kit of 22 assay(s)
technique(s)
immunoprecipitation (IP): suitable
General description
Die Chromatin-Immunpräzipitation (ChIP) ist eine leistungsstarke Methode zur Kartierung der In-vivo-Verteilung von Proteinen, die mit chromosomaler DNA assoziiert sind. Bei diesen Proteinen kann es sich um Histon-Untereinheiten und posttranslationale Modifikationen sowie andere Chromatin-assoziierte Proteine wie Transkriptionsfaktoren, Chromatin-Regulatoren etc. handeln. Zusätzlich kann ChIP verwendet werden, um mit diesen Proteinen assoziierte Regionen des Genoms zu identifizieren, oder umgekehrt, um mit einer bestimmten Region des Genoms assoziierte Proteine zu identifizieren. Die ChIP-Methodik beinhaltet häufig eine Protein-DNA- und Protein-Protein-Vernetzung, eine Fragmentierung des vernetzten Chromatins und eine anschließende Immunpräzipitation des Chromatins mit einem für ein Zielprotein spezifischen Antikörper. Die im Komplex mit dem Zielprotein isolierten DNA-Fragmente können mit einer Vielzahl von Methoden wie PCR, DNA-Microarray und DNA-Sequenzierung identifiziert werden. Mit einer Standard-PCR oder quantitativen PCR kann überprüft werden, ob eine bestimmte DNA-Sequenz (das Gen oder die Region des Genoms) mit dem jeweiligen Protein assoziiert ist. Die Kombination von ChIP und Promoter Microarrays oder Genomic Tiling Microarrays (ChIP-Chip) ermöglicht die genomweite Identifizierung von DNA-Bindungsstellen für Chromatin-assoziierte Proteine mit präziser Auflösung. Die Hochdurchsatz-Sequenzierung von Bibliotheken, die aus immunpräzipitierter chromosomaler DNA (ChIP-Seq) konstruiert wurden, ist eine leistungsstarke Alternative zum ChIP-Chip bei der Kartierung der Protein-DNA-Interaktionen bei Säugetiergenomen.
Features and Benefits
- Einfacher: Spinsäulen erleichtern die DNA-Aufreinigung und machen sie zuverlässiger - keine unordentlichen Phenol-Chloroform-Extraktionen mehr.
- Schneller: Alle Reagenzien zum Verarbeiten Ihrer Proben sind enthalten - Sie müssen keine wertvolle Zeit mit ihrer Herstellung vergeuden.
- Bessere Reproduzierbarkeit: Positiv- und Negativkontrolle-Antikörper sowie PCR-Primer sind enthalten, um Sie bei der Validierung Ihrer Ergebnisse und Fehlersuche in Ihren Experimenten zu unterstützten.
Packaging
Preparation Note
Other Notes
- Spinsäulen und Sammelröhrchen für die DNA-Aufreinigung
- ChIP-blockierte Protein-G-Agarose
- Anti-RNA-Polymerase II
- PCR-Kontrollprimer
- Normales Maus-IgG
- Bindungs-, Wasch- und Elutionsreagens
- Proteaseinhibitor-Cocktail II
- RNase A
- Proteinase K
- Alle erforderlichen Puffer
- ChIP-Verdünnungspuffer
- Immunkomplex-Waschpuffer mit geringem Salzgehalt
- Immunkomplex-Waschpuffer mit hohem Salzgehalt
- LiCl-Immunkomplex-Waschpuffer
- TE-Puffer
- 0,5 mol/l EDTA
- 5 mol/l NaCl
- SDS-Lysepuffer
- 1 mol/l Tris-HCl, pH-Wert 6,5
- 10X PBS
- 10X Glycin
- 1 mol/l NaHCO3
- Kontrollprimer
- 20 % SDS
- Spinfilter
- Sammelröhrchen
- Bindungsreagens A
- Waschreagens B
- Elutionsreagens C
Disclaimer
signalword
Danger
Lagerklasse
3 - Flammable liquids
wgk
WGK 2
flash_point_f
55.4 °F
flash_point_c
13 °C
target_organs
Respiratory Tract
Hazard Classifications
Acute Tox. 4 Oral - Aquatic Chronic 2 - ED ENV 1 - Eye Dam. 1 - Flam. Liq. 2 - Resp. Sens. 1 - Skin Irrit. 2 - STOT RE 2 Inhalation
Analysenzertifikate (COA)
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"Epigenetics describes heritable changes in gene expression caused by non-genetic mechanisms instead of by alterations in DNA sequence. These changes can be cell- or tissue-specific, and can be passed on to multiple generations. Epigenetic regulation enriches DNAbased information, allowing a cell to vary its response across diverse biological and environmental contexts. Although epigenetic mechanisms are primarily centered in the nucleus, these mechanisms can be induced by environmental signals such as hormones, nutrients, stress, and cellular damage, pointing to the involvement of cytoplasmic and extracellular factors in epigenetic regulation."
Global Trade Item Number
| SKU | GTIN |
|---|---|
| 17-371 | 04053252009778 |
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I do not have the access to the protocol of the assay. Could you please tell me whether the protocol includes the sonication or enzymatic shearing of the chromatin.
1 answer-
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please provide the protocol for the assay.
1 answer-
Please see the link below to review the product datasheet, including the protocol: https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/product/documents/530/862/17-371man-ms.pdf
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