下一代測序

NGS 方法概述

雖然 NGS 的方法和試劑在不斷演進，但現在已有許多 NGS 系統可供研究人員使用。常用的平台結合了 NGS 工作流程中幾個關鍵步驟的使用，包括樣本或文庫製備、簇生成、測序和資料分析。樣本製備通常包括 DNA 擴增或加入序列連結物或適應物。當含有共價連結物的 DNA 與固體表面雜交，進行橋接式 PCR 擴增，或使用乳液 PCR 等其他方法，即可產生各 DNA 序列的簇。此外，還有許多 DNA 測序方法，包括結合測序、合成測序、火法測序和離子半導體測序。每種測序方法都涉及不同的反應步驟和化學反應，最終決定了每個序列的長度（讀取長度）、錯誤率和試劑成本。

NGS 資料分析的分析方法

所有 NGS 工作流程的最後一個要素是測序後的關鍵資料分析步驟。雖然每個 NGS 平台和工作流程都會產生大量擷取在電腦上的數位資訊，但生物資訊學家必須使用持續增加的分析工具來分析原始資料集，以進行讀取比對和映射，例如 Bowtie、Galaxy 和許多其他工具。NGS 技術領域的許多發展都來自於眾多科學領域的合併，以開發和優化此類大型資料集的分析和詮釋。根據特定的應用需求，研究人員現在能夠使用這些強大的工具來對整個基因組、外顯體或轉錄組進行測序，以進行基礎研究和疾病研究。