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KiCqStart™通用SYBR® Green qPCR实验方案



背景

KiCqStart®SYBR® Green qPCR ReadyMix是2X浓缩的即用型反应混合物,含有除引物和模板外的实时定量PCR (qPCR)所有组分。这种专有缓冲液、稳定剂和KiCqStart® Taq DNA聚合酶的独特组合使用SYBR® Green qPCR的快速或常规循环方案,提供最高的PCR效率、灵敏度、特异性和稳定的荧光信号。

高特异性扩增对于使用SYBRSYBR® Green I染料技术成功进行qPCR至关重要,因为该染料可结合扩增过程中产生的任何dsDNA并进行检测。KiCqStart® Taq DNA聚合酶含有专有的单克隆抗体混合物,可与聚合酶结合并在PCR预变性步骤之前保持其无活性(室温下>48小时)。酶的活化在95 °C下瞬时完成。60 °C下,在不到20秒的时间内即可完成高达200 bp的片段复制。 

详情请参阅qPCR技术指南或基于SYBR® Green I的qPCR技术动画。 

KiCqStart® SYBR® Green qPCR ReadyMix™

KiCqStart® SYBR® Green qPCR ReadyMix™的仪器兼容性

不同的实时PCR系统采用不同策略来校准荧光信号和校正孔间光学变化。为特定仪器匹配合适的qPCR试剂至关重要。KiCqStart®SYBR®Green qPCR ReadyMix不含内参染料。请查看下表中联系方式,寻找适用您仪器平台的最佳套装。

耗材

  • KiCqStart® SYBR® Green qPCR ReadyMix™ (KCQS00, KCQS01, KCQS02  KCQS03 – 根据使用的qPCR仪器选择合适的试剂)
  • 正向和逆向引物,稀释至工作浓度(10 μM工作原液足以进行大多数检测)
    • 在此订购定制的寡核苷酸
    • 预先设计的基因表达引物也适用于大多数模型生物 (KiCqStart® SYBR® Green Primers, KSPQ12012)
  • 无菌过滤器移液管吸头
  • 无菌1.5 mL螺纹盖微量离心管(例如CLS430909)
  • PCR管,选择匹配所需形式的试管:
    • 单个薄壁200 μL PCR管(Z374873或P3114)
    • 平板
      • 96孔板(Z374903)
      • 384孔板(Z374911)
    • 封板膜
      • ThermalSeal RTS™ 密封膜(Z734438)
      • ThermalSeal RT2RR™ 薄膜(Z722553)
  • PCR级纯水(W1754)

检测指南

  • 引物设计:
    • 预先设计的引物:我们提供了一组预先设计的引物,这些引物已经过优化,可与KiCqStart® SYBR® Readymixes。这些KiCqStartt® 引物可通过货号KSPQ12012订购.
    • 定制引物
      • 高特异性引物的设计是使用SYBR® Green I染料成功进行实时PCR最重要的参数。鼓励使用计算机辅助引物设计程序,以使每个引物和引物对内3'末端内部二级结构和互补的可能性最小化。  定制底物可通过货号OLIGO订购。
    • 扩增子大小:KiCqStart® SYBR® Green qPCR ReadyMix™可以很容易地扩增400到500 bp的片段;但是,要充分利用快速循环方案,扩增子大小应限制在150 bp以下。
    • 引物浓度:最佳结果可能要求引物滴定浓度为100至500 nM。300 nM的引物终浓度为对绝大多数反应有效。
  • 反应构建:
    • 建议制备反应混合物以减少移液误差并使分析精度最大化。将反应混合物与除样品模板(基因组DNA或cDNA)之外的所有所需组分混合,然后将等分试样分配到独立的反应管中。最后一步,将DNA模板添加到每个反应中。对模板样品进行稀释,至少添加5 µL,这样可提高检测精度。
    • 推荐的模板起始量:对应于总RNA为1pg至100ng的cDNA;100 pg至100 ng基因组DNA

反应构建

终反应体积在10到50 μL之间,可按比例改变所有组分的量。
对各反应密封后,轻轻涡旋混合内容物。短暂离心,收集反应管底部的组分。

PCR循环方案

* 95 ºC下,KiCqStart Taq DNA聚合酶可在1秒内完全激活;但是,最佳预变性时间依赖于模板,并且将影响qPCR的效率和灵敏度。扩增基因组DNA或超螺旋质粒DNA靶标在95 ºC下可能需要5到10分钟才能使模板完全变性并解链。短链双链DNA模板(PCR产物)或单链DNA模板在95 ºC下可能只需要1秒。95 ºC下,使用30秒作为通用起点。

† 延长时间取决于扩增子长度和qPCR仪器的最小数据收集时间要求。一些引物组获得最佳性能需要执行3步循环方案。对于给定的引物组和实时仪器,需要凭经验确定最佳退火温度和时间或引物浓度。

材料
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