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Pepstatina A

≥100,000 U/mg

• Fórmula empírica (notación de Hill): C₃₄H₆₃N₅O₉
• Número de CAS: 26305-03-3
• Peso molecular: 685.89
• Beilstein/REAXYS Number: 2201362
• EC Number: 247-600-0
• MDL number: MFCD00060740
• UNSPSC Code: 12352202
• PubChem Substance ID: 57652681
• NACRES: NA.77

Propiedades

• biological source: Streptomyces sp.
• form: powder
• specific activity: ≥100,000 U/mg
• mp: 233 °C (dec.) (lit.)
• solubility: ethanol: soluble 1 mg/mL
• storage temp.: 2-8°C
• SMILES string: CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C[C@H](O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)CC(C)C)C(C)C)C(C)C)[C@@H](O)CC(O)=O
• InChI: 1S/C34H63N5O9/c1-17(2)12-23(37-33(47)31(21(9)10)39-34(48)30(20(7)8)38-27(42)14-19(5)6)25(40)15-28(43)35-22(11)32(46)36-24(13-18(3)4)26(41)16-29(44)45/h17-26,30-31,40-41H,12-16H2,1-11H3,(H,35,43)(H,36,46)(H,37,47)(H,38,42)(H,39,48)(H,44,45)/t22-,23-,24-,25-,26-,30-,31-/m0/s1
• InChI key: FAXGPCHRFPCXOO-LXTPJMTPSA-N

Descripción

Application

Pepstatin A is suitable for use:

• in the inhibitor cocktail in fluorometric matrix metalloproteinase assay
• as a protease inhibitor during homogenization of tissue
• as a protease inhibitor during extraction of cells
• to determine the molar concentrations of cathepsin D by titration with pepstatin A
• in inhibiting cathepsin D

It can be used in conjunction with E64-d and Leupeptin A to inhibit the degradation of autophagic cargo inside autophagosomes. For this application, the working concentration is typically between 1-10 μM.

Biochem/physiol Actions

La pepstatina A es un inhibidor de las proteasas ácidas (aspartil peptidasas). Forma un complejo 1:1 con proteasas como la pepsina, la renina, la catepsina D, la quimosina bovina y la proteasa B (Aspergillus niger). El inhibidor es muy selectivo y no inhibe las tiol proteasas, las proteasas neutras ni las serín-proteasas. La γ-secretasa solubilizada y la proteasa retroviral son también inhibidas por la pepstatina A. Se ha utilizado para caracterizar proteasas de diversas procedencias.

Unit Definition

1 U corresponds to the amount of inhibitor which reduces the activity of pepsin by 1 U (1 U corresponds to the amount of enzyme which increases the absorbance at 280 nm by 0.001 per minute at pH 2.0 and 37°C (Hemoglobin, Cat. No. 51290, as substrate, in an endvolume of 16 ml)); 10′000 absorbance-U as described above are equivalent to ∼1 Bergmeyer-U (when 1 pepsin-U is the amount of enzyme which hydrolyzes 1 μmol acetyl-L-phenylalanyl-3,5-diiodo-L-tyrosin per minute at pH 2.0 and 37°C)

Preparation Note

La pepstatina puede disolverse a 1 mg/ml en ácido acético al 10 % (v/v) en metanol (9:1 metanol:ácido acético). Puede ser necesario añadir ácido acético para disolver este péptido en metanol o DMSO. Se ha disuelto a 1 - 2 mg/ml en etanol, pero puede requerirse calor para la disolución completa. Las disoluciones de pepstatina A pueden calentarse hasta 60 °C sin que se descomponga el péptido.
Las disoluciones de reserva a 1 mg/ml son estables por lo menos durante una semana a 4 °C. Una disolución 1 mM en metanol o DMSO es estable durante meses a -20 °C. Si las disoluciones se vuelven de color amarillo oscuros, el reactivo se está hidrolizando.
Una concentración de trabajo de 1 μM es estable durante como mínimo un día a temperatura ambiente.

Other Notes

Strong inhibitor of acid proteases - pepsin, cathepsin D, renin

Información de seguridad

• Storage Class: 11 - Combustible Solids
• wgk_germany: WGK 2
• flash_point_f: Not applicable
• flash_point_c: Not applicable
• ppe: Eyeshields, Gloves, type N95 (US)